More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00350 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00350  acetylornithine deacetylase  100 
 
 
366 aa  736    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0652335  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2727  acetylornithine deacetylase  88.86 
 
 
362 aa  630  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0286  acetylornithine deacetylase  79.18 
 
 
364 aa  556  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.311281  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0316  acetylornithine deacetylase  79.18 
 
 
364 aa  556  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.692174  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2538  peptidase M20  35.18 
 
 
369 aa  142  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561977  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  29.28 
 
 
383 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.26 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  29.04 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  31.5 
 
 
428 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  30.23 
 
 
397 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  30.08 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  29.34 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  28.07 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  30.39 
 
 
397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  28.97 
 
 
389 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  28.97 
 
 
389 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  28.97 
 
 
405 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  28.97 
 
 
405 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  28.97 
 
 
405 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  28.97 
 
 
405 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  29.11 
 
 
586 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0328  acetylornithine deacetylase  28.38 
 
 
383 aa  109  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  29.63 
 
 
374 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  27.78 
 
 
404 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  27.78 
 
 
416 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  29.5 
 
 
405 aa  106  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04910  acetylornithine deacetylase  29.41 
 
 
385 aa  106  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.43 
 
 
398 aa  106  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  29.01 
 
 
411 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4277  acetylornithine deacetylase  29.17 
 
 
383 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00886468  normal  0.333205 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.34 
 
 
388 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  31.45 
 
 
386 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  28.24 
 
 
386 aa  102  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  29.49 
 
 
386 aa  103  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  28.94 
 
 
380 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  27.64 
 
 
412 aa  102  8e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  27.64 
 
 
416 aa  102  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  29.91 
 
 
395 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.82 
 
 
392 aa  102  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  28.12 
 
 
406 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  28.91 
 
 
380 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  28.74 
 
 
380 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  27.48 
 
 
383 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  29.84 
 
 
380 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  26.95 
 
 
391 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  29.24 
 
 
382 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  29.26 
 
 
388 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  30.79 
 
 
389 aa  100  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  27.81 
 
 
406 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  27.81 
 
 
406 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  27.81 
 
 
406 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  27.79 
 
 
382 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.16 
 
 
388 aa  98.6  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  27.81 
 
 
406 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  27.5 
 
 
406 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  28.37 
 
 
380 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  28.8 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  28.62 
 
 
404 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  28.09 
 
 
378 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  29.3 
 
 
364 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  27.5 
 
 
406 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1040  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.99 
 
 
392 aa  98.2  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.16 
 
 
400 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3920  acetylornithine deacetylase  28.47 
 
 
383 aa  97.1  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.21 
 
 
387 aa  97.1  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  28.96 
 
 
387 aa  97.1  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  27.79 
 
 
403 aa  97.4  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0194  acetylornithine deacetylase  28.04 
 
 
382 aa  97.4  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  28.4 
 
 
388 aa  97.4  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.65 
 
 
413 aa  97.1  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  30.08 
 
 
364 aa  96.7  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  26.62 
 
 
382 aa  96.3  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  28.91 
 
 
376 aa  96.3  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2601  acetylornithine deacetylase  29.22 
 
 
389 aa  95.9  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265053  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  27.06 
 
 
383 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  26.99 
 
 
378 aa  95.5  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  27.35 
 
 
383 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  28.68 
 
 
374 aa  95.1  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  27.23 
 
 
384 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  27.76 
 
 
384 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  26.18 
 
 
384 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.3 
 
 
400 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  28.71 
 
 
388 aa  93.2  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  28.06 
 
 
404 aa  92.8  9e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  28.25 
 
 
375 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2313  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.59 
 
 
389 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0897692 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4229  peptidase M20  30.69 
 
 
397 aa  91.3  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.543782  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.35 
 
 
393 aa  90.9  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0227  acetylornithine deacetylase  25.4 
 
 
382 aa  90.9  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  25.91 
 
 
383 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  25.91 
 
 
383 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  25.91 
 
 
383 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  25.91 
 
 
383 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  25.91 
 
 
383 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  26.8 
 
 
383 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3291  acetylornithine deacetylase  27.97 
 
 
383 aa  89.7  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.72 
 
 
393 aa  89.4  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  27.08 
 
 
386 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  28.21 
 
 
398 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.21 
 
 
391 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>