More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1467 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 388 aa  782    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  54.64 
 
 		 390 aa  437  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.91 
 
 		 393 aa  414  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  45.64 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  45.01 
 
 		 391 aa  353  2e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.61 
 
 		 413 aa  236  6e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.22 
 
 		 433 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  33.33 
 
 		 419 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  28.73 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.27 
 
 		 431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.22 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  30.18 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  31.02 
 
 		 389 aa  123  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.79 
 
 		 402 aa  122  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  28.54 
 
 		 421 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.92 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  28.54 
 
 		 444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.95 
 
 		 439 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.95 
 
 		 423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 		 386 aa  120  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  30.1 
 
 		 440 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  29.25 
 
 		 387 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  30.32 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  29 
 
 		 435 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  30.71 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  27.4 
 
 		 437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  28.54 
 
 		 380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.7 
 
 		 398 aa  116  5e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  28.31 
 
 		 446 aa  116  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.75 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4939  acetylornithine deacetylase  28.76 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  30.16 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  27.39 
 
 		 384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0990  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.98 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  29.38 
 
 		 442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  28.47 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.49 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  29.82 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.71 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1445  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.37 
 
 		 365 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0181667  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  29.97 
 
 		 386 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  29.82 
 
 		 364 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  28.88 
 
 		 406 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  28.04 
 
 		 439 aa  113  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.5 
 
 		 395 aa  113  6e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  27.02 
 
 		 442 aa  113  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  29.67 
 
 		 368 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  30.97 
 
 		 387 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  27.05 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  28.21 
 
 		 450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  29.1 
 
 		 386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.44 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  28.6 
 
 		 449 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.86 
 
 		 396 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  26.59 
 
 		 434 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  28.09 
 
 		 444 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  29.82 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  28.09 
 
 		 444 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  28.09 
 
 		 444 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.29 
 
 		 399 aa  111  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  27 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  30.83 
 
 		 411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.01 
 
 		 365 aa  110  5e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.119075  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  29.62 
 
 		 497 aa  110  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  36.27 
 
 		 444 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  27.32 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  28.34 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  29.26 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  28.71 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1291  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.42 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  28.54 
 
 		 443 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  28.37 
 
 		 462 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  29.07 
 
 		 388 aa  107  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  28.64 
 
 		 387 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  26.65 
 
 		 391 aa  106  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  27.94 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  29.07 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  26.83 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  27.87 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  27.44 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  24.65 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.51 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.74 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  29.31 
 
 		 380 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3135  acetylornithine deacetylase  31.07 
 
 		 432 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  28.13 
 
 		 390 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  29.75 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  26.38 
 
 		 430 aa  103  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  25.96 
 
 		 381 aa  103  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  27.85 
 
 		 392 aa  102  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  28.07 
 
 		 383 aa  102  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.63 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.765563  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1036  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.79 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98683  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02544  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.32 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0279642  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.15 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  29.55 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  26.71 
 
 		 452 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  25.72 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.2 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  26.5 
 
 		 448 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>