More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2374 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 410 aa  828    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.99 
 
 		 395 aa  229  7e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.56 
 
 		 398 aa  229  8e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.83 
 
 		 399 aa  222  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.23 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.27 
 
 		 435 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.57 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.48 
 
 		 431 aa  212  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.34 
 
 		 423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.66 
 
 		 423 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.42 
 
 		 439 aa  196  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1823  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.84 
 
 		 369 aa  164  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.248504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  30.61 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.71 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.5 
 
 		 409 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.37 
 
 		 413 aa  144  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.27 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  27.82 
 
 		 409 aa  144  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1982  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.74 
 
 		 376 aa  143  5e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.49 
 
 		 410 aa  143  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.78 
 
 		 419 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.78 
 
 		 419 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.37 
 
 		 396 aa  140  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.25 
 
 		 423 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2108  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.35 
 
 		 430 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921136 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.26 
 
 		 407 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3442  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.33 
 
 		 422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.14 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.88 
 
 		 442 aa  137  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3277  peptidase M20:peptidase dimerisation  28.16 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0424  M20/DapE family protein YgeY  26.56 
 
 		 413 aa  131  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3143  peptidase M20  27.49 
 
 		 424 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.138788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  27.25 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0847  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.359888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.99 
 
 		 409 aa  127  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  28.12 
 
 		 407 aa  126  6e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  25.74 
 
 		 382 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3470  peptidase M20  27.01 
 
 		 424 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3273  hypothetical protein  26.6 
 
 		 424 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4390  peptidase M20  29.16 
 
 		 413 aa  123  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.18 
 
 		 411 aa  122  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  27.05 
 
 		 380 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.23 
 
 		 433 aa  122  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1036  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.16 
 
 		 426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98683  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1035  peptidase dimerisation domain protein  27.08 
 
 		 424 aa  121  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.2 
 
 		 404 aa  121  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.88 
 
 		 389 aa  121  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1162  peptidase M20  28.43 
 
 		 414 aa  120  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.988314  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  28.05 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1114  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.85 
 
 		 429 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  28.41 
 
 		 422 aa  116  6e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  27.38 
 
 		 422 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.56 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  27.11 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  27.23 
 
 		 422 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1729  peptidase  25.55 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  24.41 
 
 		 411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  25.99 
 
 		 401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  25.7 
 
 		 368 aa  113  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2196  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.09 
 
 		 385 aa  113  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  25.5 
 
 		 364 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0720  peptidase M20  28.89 
 
 		 424 aa  113  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.611917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  30.09 
 
 		 421 aa  113  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3492  acetylornithine deacetylase  24.83 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.22 
 
 		 366 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1663  M20/DapE family protein YgeY  26.5 
 
 		 436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  25.5 
 
 		 364 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.9 
 
 		 429 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  23.83 
 
 		 391 aa  111  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  27.78 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  26.21 
 
 		 422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.32 
 
 		 433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0561  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.58 
 
 		 407 aa  110  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  26.34 
 
 		 422 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2664  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.94 
 
 		 427 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.18198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4015  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  28 
 
 		 413 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2652  M20/DapE family protein YgeY  25.97 
 
 		 443 aa  110  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.46 
 
 		 393 aa  110  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  27.92 
 
 		 374 aa  110  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  26.34 
 
 		 422 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0642  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.61 
 
 		 402 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.39661  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02705  hypothetical protein  25.84 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0820  M20/DapE family protein YgeY  25.84 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3032  peptidase  25.84 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  26.11 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  26.11 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  26.11 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02667  hypothetical protein  25.84 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0836  peptidase  25.84 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4162  peptidase  25.84 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3005  peptidase  25.84 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2554  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.96 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  26.11 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1432  peptidase  25.11 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3197  peptidase  25.6 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0549  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.71 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0227  acetylornithine deacetylase  27.16 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  24.27 
 
 		 381 aa  107  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  26.42 
 
 		 407 aa  107  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.24 
 
 		 407 aa  106  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>