More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1823 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1823  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 369 aa  751    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.248504  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1982  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.64 
 
 		 376 aa  431  1e-120  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.59 
 
 		 395 aa  199  7e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.26 
 
 		 399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.35 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.34 
 
 		 398 aa  197  3e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.84 
 
 		 410 aa  164  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.05 
 
 		 442 aa  125  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  32.82 
 
 		 416 aa  122  9e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.67 
 
 		 431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  31.13 
 
 		 404 aa  120  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  32.67 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  32.95 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  33.55 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.26 
 
 		 435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  28.76 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.16 
 
 		 433 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.54 
 
 		 423 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  29.52 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  28.94 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.57 
 
 		 423 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.57 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  28.97 
 
 		 397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 		 384 aa  109  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.82 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  31.29 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  31.51 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  28.64 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  29.01 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  28.93 
 
 		 398 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  29.31 
 
 		 388 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  31.46 
 
 		 384 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.22 
 
 		 387 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  26.22 
 
 		 383 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  26.98 
 
 		 387 aa  102  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0847  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.63 
 
 		 413 aa  102  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.359888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  26.22 
 
 		 383 aa  102  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3712  putative acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases  30.29 
 
 		 433 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  28.43 
 
 		 395 aa  102  9e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  28.72 
 
 		 384 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  26.58 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  26.52 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  26.52 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  26.52 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  26.52 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  27.84 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  26.52 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  26.76 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4390  peptidase M20  27.59 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  29.41 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  29.32 
 
 		 404 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.94 
 
 		 423 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  28.23 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  29.22 
 
 		 376 aa  99.8  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  28.71 
 
 		 419 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  26.84 
 
 		 428 aa  99.4  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.3 
 
 		 400 aa  99.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  30.06 
 
 		 411 aa  99.4  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  29.21 
 
 		 391 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  27.46 
 
 		 387 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  29.34 
 
 		 406 aa  99.4  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  29.97 
 
 		 397 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.9 
 
 		 400 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  31.75 
 
 		 389 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  30.89 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.48 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  30.06 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7452  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.65 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248803  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  29.5 
 
 		 404 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  29.21 
 
 		 386 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  28.53 
 
 		 386 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3920  acetylornithine deacetylase  25.85 
 
 		 383 aa  97.1  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.83 
 
 		 391 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  26.86 
 
 		 406 aa  97.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  25.27 
 
 		 387 aa  96.7  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  25.85 
 
 		 389 aa  96.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  26.74 
 
 		 406 aa  96.7  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  25.27 
 
 		 387 aa  96.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2755  acetylornithine deacetylase  29.84 
 
 		 378 aa  96.3  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  29.25 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  29.25 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  29.25 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  29.25 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  27.07 
 
 		 411 aa  96.3  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.55 
 
 		 391 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  30.1 
 
 		 386 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  29.25 
 
 		 389 aa  96.3  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  27.39 
 
 		 406 aa  96.3  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  29.25 
 
 		 389 aa  96.3  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  27.39 
 
 		 406 aa  96.3  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  26.33 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  26.74 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  29.1 
 
 		 380 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  30.45 
 
 		 586 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  25.71 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  27.22 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1548  acetylornithine deacetylase  31.38 
 
 		 410 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376814 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.45 
 
 		 402 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  25.07 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  25.07 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>