More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4390 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1114  peptidase dimerisation domain-containing protein  78.61 
 
 		 429 aa  639    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  78.38 
 
 		 411 aa  664    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2108  peptidase dimerisation domain-containing protein  74.58 
 
 		 430 aa  635    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921136 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4390  peptidase M20  100 
 
 		 413 aa  843    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  77.09 
 
 		 423 aa  646    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  80.05 
 
 		 409 aa  669    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1035  peptidase dimerisation domain protein  78.12 
 
 		 424 aa  635    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  70.9 
 
 		 409 aa  609  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  72.09 
 
 		 411 aa  608  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  71.12 
 
 		 410 aa  604  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  68.24 
 
 		 407 aa  579  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.64 
 
 		 409 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1162  peptidase M20  55.45 
 
 		 414 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.988314  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3442  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.18 
 
 		 422 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.63 
 
 		 419 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3277  peptidase M20:peptidase dimerisation  51.46 
 
 		 422 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.38 
 
 		 419 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.38 
 
 		 419 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3470  peptidase M20  52.45 
 
 		 424 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  52.33 
 
 		 422 aa  418  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3143  peptidase M20  52.21 
 
 		 424 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.138788  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3273  hypothetical protein  53.66 
 
 		 424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0720  peptidase M20  53.2 
 
 		 424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.611917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.25 
 
 		 423 aa  398  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1106  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  73.22 
 
 		 184 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.48 
 
 		 442 aa  159  6e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.39 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.51 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.3 
 
 		 399 aa  135  9e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.3 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  31.63 
 
 		 393 aa  123  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.16 
 
 		 410 aa  123  6e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.75 
 
 		 435 aa  120  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.89 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.71 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.07 
 
 		 439 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.07 
 
 		 423 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  27.68 
 
 		 380 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0847  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.5 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.359888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.91 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.61 
 
 		 387 aa  109  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  28.44 
 
 		 424 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  27.19 
 
 		 416 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1036  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.74 
 
 		 426 aa  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98683  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.76 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0411  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.93 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4285  acetylornithine deacetylase  26.68 
 
 		 432 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.96 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3492  acetylornithine deacetylase  24.42 
 
 		 432 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  30.45 
 
 		 384 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.9 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  27.27 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.05 
 
 		 433 aa  99.8  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1823  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.59 
 
 		 369 aa  99.8  9e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.248504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  27.71 
 
 		 411 aa  99.4  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  30.72 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.26 
 
 		 400 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  30.46 
 
 		 384 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  28.53 
 
 		 389 aa  96.7  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  28.15 
 
 		 390 aa  97.1  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  30.46 
 
 		 387 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.71 
 
 		 433 aa  96.7  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.76 
 
 		 400 aa  96.3  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.55 
 
 		 404 aa  96.3  9e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  30.22 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.75 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  22.89 
 
 		 422 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1406  acetylornithine deacetylase  28.09 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.566514  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  30.75 
 
 		 387 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2569  acetylornithine deacetylase  24.46 
 
 		 432 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.999576  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  28.64 
 
 		 399 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  28.44 
 
 		 386 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  24.94 
 
 		 446 aa  94.4  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2664  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.4 
 
 		 427 aa  94  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.18198 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  28.06 
 
 		 397 aa  93.6  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  27.11 
 
 		 404 aa  93.2  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3135  acetylornithine deacetylase  24.64 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.339139 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  27.91 
 
 		 753 aa  92  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  25.89 
 
 		 379 aa  92  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.76 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  28.53 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0954  peptidase dimerisation domain protein  24.1 
 
 		 426 aa  91.3  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 		 385 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2049  diaminopimelate aminotransferase  27.2 
 
 		 409 aa  91.3  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  30.91 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  27.24 
 
 		 394 aa  90.5  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25 
 
 		 398 aa  90.9  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  27.06 
 
 		 389 aa  90.5  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  30.06 
 
 		 389 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3347  acetylornithine deacetylase  24.15 
 
 		 436 aa  90.1  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  34.4 
 
 		 382 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3442  acetylornithine deacetylase  24.64 
 
 		 426 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2796  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.17 
 
 		 397 aa  89.7  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.884075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  29.05 
 
 		 386 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  29.05 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  27.93 
 
 		 428 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  27.93 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  29.29 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  25.74 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  27.4 
 
 		 364 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>