More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2569 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_3135  acetylornithine deacetylase  93.75 
 
 
432 aa  850    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3492  acetylornithine deacetylase  85.42 
 
 
432 aa  776    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152448  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4285  acetylornithine deacetylase  78.28 
 
 
432 aa  697    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2569  acetylornithine deacetylase  100 
 
 
432 aa  892    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.999576  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3442  acetylornithine deacetylase  46.84 
 
 
426 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2506  acetylornithine deacetylase  46.6 
 
 
426 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183541  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2938  acetylornithine deacetylase  46.84 
 
 
426 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3889  acetylornithine deacetylase  45.35 
 
 
426 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2352  acetylornithine deacetylase  46.27 
 
 
424 aa  362  8e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.737535  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3347  acetylornithine deacetylase  41.69 
 
 
436 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1080  acetylornithine deacetylase  44.89 
 
 
430 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2875  acetylornithine deacetylase  44.15 
 
 
427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2664  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.03 
 
 
427 aa  335  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.18198 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1406  acetylornithine deacetylase  45.52 
 
 
427 aa  328  8e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.566514  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3737  acetylornithine deacetylase  42.72 
 
 
427 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1036  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.55 
 
 
426 aa  273  5.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3755  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.9 
 
 
431 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0601129  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0411  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.11 
 
 
437 aa  236  8e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  31.43 
 
 
422 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4015  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  35.58 
 
 
413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  31.58 
 
 
422 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  33.64 
 
 
446 aa  211  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  32.06 
 
 
422 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1610  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.95 
 
 
447 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  32.13 
 
 
422 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  31.65 
 
 
422 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  31.65 
 
 
422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  31.65 
 
 
422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  31.65 
 
 
422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0744  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.03 
 
 
453 aa  201  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.49 
 
 
429 aa  199  6e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  31.41 
 
 
422 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  31.41 
 
 
422 aa  199  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3865  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.32 
 
 
433 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.838236  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  30.14 
 
 
422 aa  192  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.57 
 
 
433 aa  190  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0097  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.31 
 
 
437 aa  189  7e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0395035  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0019  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.79 
 
 
428 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.191094  hitchhiker  0.000354462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4522  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.15 
 
 
428 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  30.12 
 
 
424 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12180  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  33.66 
 
 
463 aa  174  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0246803  normal  0.255441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0025  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.92 
 
 
429 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2920  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.59 
 
 
429 aa  170  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3374  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  34.38 
 
 
424 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0810  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  32.1 
 
 
447 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0497  acetylornithine deacetylase  28.47 
 
 
424 aa  150  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00375868  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0467  acetylornithine deacetylase  27.07 
 
 
426 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0406  acetylornithine deacetylase  28.29 
 
 
424 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0493  acetylornithine deacetylase  27.07 
 
 
426 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0548  acetylornithine deacetylase  26.46 
 
 
424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2502  acetylornithine deacetylase  32.27 
 
 
418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0410  acetylornithine deacetylase  27.71 
 
 
424 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0475  acetylornithine deacetylase  27.71 
 
 
424 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0548  acetylornithine deacetylase  26.65 
 
 
424 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000707223  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4825  acetylornithine deacetylase  25.92 
 
 
424 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0895557  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4506  acetylornithine deacetylase  33.26 
 
 
428 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2177  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.98 
 
 
441 aa  142  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  24.77 
 
 
422 aa  139  8.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0412  acetylornithine deacetylase  28.43 
 
 
424 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1499  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.98 
 
 
441 aa  137  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0792  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  36.69 
 
 
423 aa  137  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  27.27 
 
 
417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2806  peptidase M20  32.03 
 
 
425 aa  133  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2048  acetylornithine deacetylase  27.37 
 
 
418 aa  123  8e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0080  peptidase M20  28.65 
 
 
434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.306901  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1722  acetylornithine deacetylase  28.82 
 
 
433 aa  116  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.633386  normal  0.578084 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  26.5 
 
 
753 aa  113  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.98 
 
 
387 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  28.53 
 
 
393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2664  peptidase M20  28.25 
 
 
442 aa  107  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  27.15 
 
 
422 aa  107  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.49 
 
 
410 aa  106  8e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 
423 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0631  peptidase M20  28 
 
 
433 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  25.9 
 
 
411 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.79 
 
 
413 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2108  peptidase dimerisation domain-containing protein  26 
 
 
430 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0921136 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.23 
 
 
388 aa  99.8  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0346  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.84 
 
 
447 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0940118 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  28.2 
 
 
390 aa  98.2  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.03 
 
 
393 aa  97.1  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  27.16 
 
 
411 aa  97.1  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.86 
 
 
411 aa  95.9  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4390  peptidase M20  24.46 
 
 
413 aa  94.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.23 
 
 
407 aa  94.4  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  25 
 
 
415 aa  94.4  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0720  peptidase M20  27.02 
 
 
424 aa  93.2  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.611917  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  24.82 
 
 
409 aa  93.2  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  27.22 
 
 
391 aa  93.2  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.29 
 
 
409 aa  93.2  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  24.25 
 
 
382 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.46 
 
 
419 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0078  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.88 
 
 
397 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2849  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.46 
 
 
375 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.46 
 
 
375 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2716  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.46 
 
 
375 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0930351 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2742  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.46 
 
 
375 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  30.28 
 
 
389 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.17 
 
 
375 aa  90.9  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.46 
 
 
375 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>