More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2108 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1035  peptidase dimerisation domain protein  84.54 
 
 
424 aa  726    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  76.61 
 
 
423 aa  654    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2108  peptidase dimerisation domain-containing protein  100 
 
 
430 aa  878    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0921136 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4390  peptidase M20  74.58 
 
 
413 aa  635    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  79.24 
 
 
411 aa  675    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1114  peptidase dimerisation domain-containing protein  84.78 
 
 
429 aa  728    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  80.48 
 
 
409 aa  692    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  72.79 
 
 
411 aa  610  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  70.53 
 
 
409 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  70.36 
 
 
410 aa  592  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  66.74 
 
 
407 aa  580  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1162  peptidase M20  52.53 
 
 
414 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.988314  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.16 
 
 
409 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.88 
 
 
419 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3277  peptidase M20:peptidase dimerisation  51.54 
 
 
422 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.65 
 
 
419 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.65 
 
 
419 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3442  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.65 
 
 
422 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  48.72 
 
 
422 aa  401  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3470  peptidase M20  48.74 
 
 
424 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.25 
 
 
423 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3143  peptidase M20  48.28 
 
 
424 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.138788  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0720  peptidase M20  48.5 
 
 
424 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.611917  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3273  hypothetical protein  49.53 
 
 
424 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425351  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1106  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  77.78 
 
 
184 aa  296  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802488  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.37 
 
 
442 aa  152  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.17 
 
 
395 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.67 
 
 
398 aa  140  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.35 
 
 
410 aa  139  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.79 
 
 
399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.83 
 
 
399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.38 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.38 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0847  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.34 
 
 
413 aa  117  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.359888  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.02 
 
 
431 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.8 
 
 
423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.23 
 
 
435 aa  113  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  28.33 
 
 
393 aa  111  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1036  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.19 
 
 
426 aa  110  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98683  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.44 
 
 
433 aa  110  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  28.41 
 
 
412 aa  108  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4285  acetylornithine deacetylase  27.4 
 
 
432 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  26.74 
 
 
446 aa  106  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  28.23 
 
 
424 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  27.89 
 
 
416 aa  104  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.86 
 
 
387 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  29.74 
 
 
387 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.75 
 
 
388 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  27.6 
 
 
411 aa  101  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2569  acetylornithine deacetylase  26 
 
 
432 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.999576  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  27.03 
 
 
364 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.3 
 
 
396 aa  100  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1031  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.33 
 
 
395 aa  99.4  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.56 
 
 
433 aa  99.4  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  27.3 
 
 
369 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0972  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.33 
 
 
395 aa  99.4  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.56 
 
 
400 aa  99  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3442  acetylornithine deacetylase  25.46 
 
 
426 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  29.06 
 
 
389 aa  97.8  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.71 
 
 
389 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0411  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.95 
 
 
437 aa  97.4  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.38 
 
 
400 aa  97.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.25 
 
 
400 aa  96.3  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  29.38 
 
 
389 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3135  acetylornithine deacetylase  26.24 
 
 
432 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.82 
 
 
402 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  29.15 
 
 
364 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2506  acetylornithine deacetylase  25.46 
 
 
426 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183541  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  23.81 
 
 
415 aa  94.4  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3480  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.35 
 
 
404 aa  94.4  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  29.1 
 
 
390 aa  94.4  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  29.49 
 
 
387 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0954  peptidase dimerisation domain protein  27.48 
 
 
426 aa  93.6  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  26.91 
 
 
385 aa  93.6  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  22.95 
 
 
423 aa  92.4  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  25.37 
 
 
379 aa  92.8  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  29.49 
 
 
364 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  28.7 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  27.13 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1338  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.25 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  28.74 
 
 
392 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  26.82 
 
 
415 aa  92  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2938  acetylornithine deacetylase  25.92 
 
 
426 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4939  acetylornithine deacetylase  28.49 
 
 
424 aa  92  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3492  acetylornithine deacetylase  24.77 
 
 
432 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152448  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  30.14 
 
 
417 aa  90.9  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  32.88 
 
 
384 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.81 
 
 
395 aa  90.9  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0810  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  27.37 
 
 
447 aa  90.5  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0717  acetylornithine deacetylase  26.81 
 
 
388 aa  89.7  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150361  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.25 
 
 
398 aa  89.7  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.57 
 
 
433 aa  89.7  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2664  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.12 
 
 
427 aa  89.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.18198 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  26.5 
 
 
421 aa  89.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.29 
 
 
389 aa  89.4  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1610  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.52 
 
 
447 aa  89.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  28.94 
 
 
387 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.57 
 
 
392 aa  89.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  30.28 
 
 
394 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  24.82 
 
 
380 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>