More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3180 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  100 
 
 
364 aa  746    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  85.12 
 
 
369 aa  642    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  52.23 
 
 
362 aa  353  4e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  44.57 
 
 
365 aa  311  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0327  Acetylornithine deacetylase/Succinyl- diaminopimelate desuccinylase and related deacylase-like protein  35.59 
 
 
434 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  37.63 
 
 
378 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  31.56 
 
 
400 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2473  peptidase M20  34.22 
 
 
356 aa  153  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  33.93 
 
 
393 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1186  M20/M25/M40 family peptidase  29.73 
 
 
363 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390537  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.75 
 
 
398 aa  138  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.37 
 
 
395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  32.26 
 
 
753 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.42 
 
 
399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.07 
 
 
399 aa  125  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.66 
 
 
396 aa  119  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0672  peptidase M20  29.32 
 
 
366 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.07 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.119075  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  26.61 
 
 
419 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.45 
 
 
387 aa  113  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1445  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.94 
 
 
365 aa  109  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0181667  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  28.12 
 
 
397 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.63 
 
 
413 aa  109  8.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  30.41 
 
 
368 aa  109  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  27.23 
 
 
397 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  25.84 
 
 
404 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.66 
 
 
366 aa  108  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  26.16 
 
 
379 aa  106  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  28.01 
 
 
404 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  27.65 
 
 
416 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  30.13 
 
 
411 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1019  peptidase dimerisation domain protein  28.76 
 
 
411 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.675627 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.39 
 
 
388 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  26.94 
 
 
428 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1036  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.53 
 
 
426 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  27.01 
 
 
403 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  27.76 
 
 
384 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0829  peptidase M20  28.31 
 
 
372 aa  103  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0413272  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  27.22 
 
 
376 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  26.58 
 
 
412 aa  102  8e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  28.16 
 
 
387 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.13 
 
 
363 aa  102  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  25.86 
 
 
392 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  30.34 
 
 
385 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  26.98 
 
 
406 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.29 
 
 
370 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  29.41 
 
 
398 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  28.53 
 
 
405 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  28.53 
 
 
405 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  28.53 
 
 
405 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.64 
 
 
433 aa  100  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  28.53 
 
 
405 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0990  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24 
 
 
365 aa  100  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  28.53 
 
 
389 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  28.53 
 
 
389 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2108  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.03 
 
 
430 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0921136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.45 
 
 
400 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.35 
 
 
395 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  26.03 
 
 
406 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  27.55 
 
 
586 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.66 
 
 
354 aa  99.8  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  27.22 
 
 
384 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  26.03 
 
 
406 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  26.03 
 
 
406 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  28.73 
 
 
374 aa  99.4  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  24.8 
 
 
390 aa  99.4  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.09 
 
 
392 aa  99.4  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.11 
 
 
429 aa  99.4  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  26.03 
 
 
406 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  27.6 
 
 
397 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  26.03 
 
 
406 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  27.13 
 
 
405 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.19 
 
 
356 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1255  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.37 
 
 
378 aa  99  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  29.84 
 
 
389 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2796  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.49 
 
 
397 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.884075 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  27.6 
 
 
389 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  24.32 
 
 
384 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.54 
 
 
371 aa  97.8  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7452  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.65 
 
 
397 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248803  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.19 
 
 
393 aa  97.1  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  26.03 
 
 
406 aa  97.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  24.94 
 
 
400 aa  97.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0076  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.2 
 
 
404 aa  96.7  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.48 
 
 
365 aa  96.7  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.765563  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1192  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.2 
 
 
365 aa  96.3  7e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.467708  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2506  acetylornithine deacetylase  28.7 
 
 
426 aa  96.3  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183541  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.48 
 
 
389 aa  96.3  8e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.45 
 
 
400 aa  96.3  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.79 
 
 
423 aa  96.3  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  27.38 
 
 
422 aa  95.9  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  24.32 
 
 
384 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.13 
 
 
357 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0240  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.99 
 
 
367 aa  95.1  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3889  acetylornithine deacetylase  28.15 
 
 
426 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  26.23 
 
 
390 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  25.97 
 
 
387 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.52 
 
 
388 aa  94.7  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.68 
 
 
354 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.34 
 
 
410 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>