More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3295 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 
409 aa  819    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1162  peptidase M20  68.46 
 
 
414 aa  558  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.988314  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  62.75 
 
 
422 aa  512  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0720  peptidase M20  64.53 
 
 
424 aa  504  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.611917  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.56 
 
 
419 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.31 
 
 
419 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  62.31 
 
 
419 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3442  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  58.07 
 
 
422 aa  478  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3143  peptidase M20  59.47 
 
 
424 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.138788  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3470  peptidase M20  59.71 
 
 
424 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  57.21 
 
 
409 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3277  peptidase M20:peptidase dimerisation  57.11 
 
 
422 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.32 
 
 
407 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  57.28 
 
 
409 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.19 
 
 
423 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.01 
 
 
410 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4390  peptidase M20  55.64 
 
 
413 aa  453  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  54.77 
 
 
411 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3273  hypothetical protein  59.95 
 
 
424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425351  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  55.45 
 
 
411 aa  440  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  56.52 
 
 
423 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2108  peptidase dimerisation domain-containing protein  52.16 
 
 
430 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0921136 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1035  peptidase dimerisation domain protein  52.32 
 
 
424 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1114  peptidase dimerisation domain-containing protein  52.32 
 
 
429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1106  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.1 
 
 
184 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802488  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.05 
 
 
395 aa  163  7e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.15 
 
 
398 aa  158  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.15 
 
 
399 aa  154  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.4 
 
 
442 aa  151  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.37 
 
 
435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.24 
 
 
399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.6 
 
 
431 aa  139  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.93 
 
 
439 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.93 
 
 
423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.99 
 
 
410 aa  127  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.98 
 
 
387 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.63 
 
 
433 aa  121  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.98 
 
 
423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  31.82 
 
 
397 aa  119  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.81 
 
 
388 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  30.22 
 
 
412 aa  116  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  29.77 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.6 
 
 
413 aa  113  5e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  29.48 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  30.43 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  28.9 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  29.54 
 
 
416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0847  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.99 
 
 
413 aa  109  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.359888  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.6 
 
 
393 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  30.5 
 
 
394 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.19 
 
 
396 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  24.69 
 
 
415 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  31.03 
 
 
404 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  30.99 
 
 
389 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  27.34 
 
 
446 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0717  acetylornithine deacetylase  30.43 
 
 
388 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150361  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  31.12 
 
 
399 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  30.21 
 
 
364 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.59 
 
 
400 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  32.66 
 
 
387 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  30.5 
 
 
428 aa  104  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2475  acetylornithine deacetylase  29.72 
 
 
420 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0713768  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.01 
 
 
433 aa  103  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  30.13 
 
 
384 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  28.4 
 
 
391 aa  103  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  27.68 
 
 
380 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  30.58 
 
 
391 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  27.51 
 
 
422 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  29.81 
 
 
384 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3374  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  32.11 
 
 
424 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.31 
 
 
392 aa  101  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  28.7 
 
 
403 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  29.92 
 
 
364 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.64 
 
 
366 aa  100  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.78 
 
 
398 aa  100  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.29 
 
 
400 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  28.87 
 
 
404 aa  100  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.59 
 
 
389 aa  100  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.38 
 
 
400 aa  100  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  28.96 
 
 
411 aa  100  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2664  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.45 
 
 
427 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.18198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  28.67 
 
 
365 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  23.93 
 
 
415 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  29.38 
 
 
386 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  29.97 
 
 
386 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  31.09 
 
 
387 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30 
 
 
433 aa  97.1  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  30.13 
 
 
386 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  25.9 
 
 
390 aa  96.7  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.58 
 
 
370 aa  96.3  9e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0240606  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  29.28 
 
 
369 aa  96.3  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  29.78 
 
 
424 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  27.86 
 
 
379 aa  95.5  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  26.75 
 
 
406 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.75 
 
 
365 aa  95.5  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.119075  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.14 
 
 
391 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2443  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.41 
 
 
377 aa  95.9  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.461656  normal  0.0916444 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  28.66 
 
 
406 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  27.22 
 
 
416 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  28.49 
 
 
398 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>