More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0180 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  93.49 
 
 		 415 aa  785    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  90.36 
 
 		 415 aa  762    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 415 aa  831    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  70.84 
 
 		 415 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  62.53 
 
 		 423 aa  530  1e-149  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  44.28 
 
 		 407 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  38.67 
 
 		 396 aa  298  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  38.59 
 
 		 396 aa  296  4e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  40.05 
 
 		 421 aa  289  7e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2049  diaminopimelate aminotransferase  34.86 
 
 		 409 aa  281  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.74 
 
 		 404 aa  276  3e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  39.52 
 
 		 407 aa  276  5e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1865  diaminopimelate aminotransferase  36.8 
 
 		 406 aa  276  5e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.363137  normal  0.0244826 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  37.93 
 
 		 413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  36.3 
 
 		 410 aa  272  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1333  diaminopimelate aminotransferase  34.29 
 
 		 407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  34.79 
 
 		 409 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1933  diaminopimelate aminotransferase  34.94 
 
 		 413 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  37.65 
 
 		 411 aa  267  2e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  35.71 
 
 		 411 aa  261  2e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  38.57 
 
 		 411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.43 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.6 
 
 		 395 aa  123  5e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2793  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.99 
 
 		 377 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.49 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  28.4 
 
 		 382 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.88 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  26.68 
 
 		 419 aa  107  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  25.07 
 
 		 586 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  25.07 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  25.07 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  25.07 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  25.07 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.69 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  25.07 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  25.07 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  26.6 
 
 		 439 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.95 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.01 
 
 		 410 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.11 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  24.18 
 
 		 405 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.04 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.04 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.24 
 
 		 366 aa  100  6e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.9 
 
 		 419 aa  99.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  26.85 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3492  acetylornithine deacetylase  25.29 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  25.66 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.29 
 
 		 442 aa  98.6  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3135  acetylornithine deacetylase  25.1 
 
 		 432 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  25.3 
 
 		 434 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.06 
 
 		 402 aa  97.1  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  26.59 
 
 		 379 aa  96.7  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.49 
 
 		 407 aa  96.3  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4285  acetylornithine deacetylase  25.38 
 
 		 432 aa  96.3  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.42 
 
 		 413 aa  95.5  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  25.37 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.94 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  26.72 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1445  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.96 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0181667  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  25.89 
 
 		 450 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01145  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.81 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0346694  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  25.81 
 
 		 411 aa  95.5  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2569  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 432 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.999576  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.71 
 
 		 370 aa  94.7  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0240606  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  24.56 
 
 		 406 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02089  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.59 
 
 		 390 aa  94.4  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.569859  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  24.78 
 
 		 406 aa  94  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  24.56 
 
 		 406 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  24.56 
 
 		 406 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1724  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.94 
 
 		 377 aa  94  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  27.7 
 
 		 402 aa  94  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  25.12 
 
 		 442 aa  93.6  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  25.24 
 
 		 411 aa  93.6  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.97 
 
 		 435 aa  93.6  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.23 
 
 		 431 aa  93.6  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.65 
 
 		 385 aa  93.2  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  25.29 
 
 		 433 aa  93.2  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  25.38 
 
 		 404 aa  93.2  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.04 
 
 		 363 aa  92.8  9e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.38 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  24.71 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  24.49 
 
 		 390 aa  92.8  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  26.96 
 
 		 449 aa  92.8  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2108  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.82 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921136 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  24.27 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.64 
 
 		 433 aa  91.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.89 
 
 		 423 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.07 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2375  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.81 
 
 		 377 aa  91.3  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.56 
 
 		 377 aa  91.3  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  23.29 
 
 		 421 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1869  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.79 
 
 		 375 aa  91.3  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1633  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.11 
 
 		 403 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.73321  normal  0.191724 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  24.86 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  26.42 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  25.53 
 
 		 442 aa  90.9  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  23.96 
 
 		 442 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.69 
 
 		 378 aa  90.9  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  24.12 
 
 		 409 aa  90.5  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>