124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1106 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1106  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 
184 aa  367  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802488  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  98.91 
 
 
409 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  81.42 
 
 
423 aa  306  9e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  82.87 
 
 
411 aa  302  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2108  peptidase dimerisation domain-containing protein  77.78 
 
 
430 aa  296  8e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0921136 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1114  peptidase dimerisation domain-containing protein  76.84 
 
 
429 aa  295  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1035  peptidase dimerisation domain protein  76.84 
 
 
424 aa  294  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4390  peptidase M20  73.22 
 
 
413 aa  275  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  72.93 
 
 
407 aa  270  7e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  73.08 
 
 
409 aa  269  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  74.59 
 
 
411 aa  254  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  71.27 
 
 
410 aa  251  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.14 
 
 
419 aa  190  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.14 
 
 
419 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.14 
 
 
419 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.1 
 
 
409 aa  177  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3277  peptidase M20:peptidase dimerisation  51.1 
 
 
422 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1162  peptidase M20  51.11 
 
 
414 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.988314  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3442  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.55 
 
 
422 aa  170  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3273  hypothetical protein  49.73 
 
 
424 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425351  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3470  peptidase M20  50.27 
 
 
424 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  47.51 
 
 
422 aa  162  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3143  peptidase M20  49.73 
 
 
424 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.138788  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0720  peptidase M20  49.7 
 
 
424 aa  155  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.611917  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.8 
 
 
423 aa  151  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.99 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.53 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.77 
 
 
395 aa  68.2  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  27.92 
 
 
753 aa  66.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.82 
 
 
399 aa  65.9  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.27 
 
 
387 aa  60.5  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  29.45 
 
 
393 aa  59.7  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.07 
 
 
374 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.06 
 
 
378 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.43 
 
 
410 aa  58.9  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.43 
 
 
442 aa  58.2  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.38 
 
 
433 aa  57.8  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  27.66 
 
 
379 aa  56.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1036  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.18 
 
 
426 aa  55.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98683  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.32 
 
 
354 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  30.07 
 
 
389 aa  53.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.88 
 
 
400 aa  53.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.34 
 
 
357 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  27.6 
 
 
412 aa  51.6  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0046  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.7 
 
 
387 aa  50.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  30.41 
 
 
376 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  27.67 
 
 
389 aa  50.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  28.57 
 
 
399 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  26.25 
 
 
422 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.8 
 
 
396 aa  49.7  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2806  peptidase M20  27.95 
 
 
425 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.97 
 
 
354 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.67 
 
 
370 aa  50.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1019  peptidase dimerisation domain protein  29.63 
 
 
411 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.675627 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  30.77 
 
 
419 aa  50.1  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  26.77 
 
 
416 aa  48.5  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.98 
 
 
354 aa  48.5  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.33 
 
 
400 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  30.7 
 
 
369 aa  48.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.88 
 
 
389 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  27.71 
 
 
404 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1291  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.28 
 
 
378 aa  46.6  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.17 
 
 
366 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75558  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  27.81 
 
 
411 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2664  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.84 
 
 
427 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.18198 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4086  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.17 
 
 
366 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.875683  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4242  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.17 
 
 
366 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4235  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.17 
 
 
396 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395056 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.1 
 
 
400 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2180  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.03 
 
 
354 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136819  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3752  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.95 
 
 
357 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0165343  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0346  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.2 
 
 
447 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0940118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2502  acetylornithine deacetylase  29.56 
 
 
418 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.01 
 
 
431 aa  45.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  24.42 
 
 
453 aa  45.1  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  30.41 
 
 
368 aa  45.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3855  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.98 
 
 
359 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  26.39 
 
 
411 aa  45.1  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.14 
 
 
354 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  29.58 
 
 
383 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  28.57 
 
 
364 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0255  peptidase M20  22.93 
 
 
402 aa  45.1  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4301  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.92 
 
 
367 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal  0.667956 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1225  peptidase dimerization domain protein  22.28 
 
 
261 aa  44.3  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2509  peptidase M20  31.06 
 
 
337 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0805  peptidase M20  25.9 
 
 
344 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0568  acetylornithine deacetylase  27.88 
 
 
371 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.783579  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  26.19 
 
 
446 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  34.55 
 
 
388 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4285  acetylornithine deacetylase  26.87 
 
 
432 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  24.84 
 
 
422 aa  43.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2582  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.16 
 
 
397 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.86 
 
 
413 aa  43.5  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  26.04 
 
 
456 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4745  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.47 
 
 
410 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  30 
 
 
424 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1373  amidohydrolase  30.08 
 
 
422 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  23.84 
 
 
407 aa  42.7  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1933  diaminopimelate aminotransferase  23.94 
 
 
413 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  29.92 
 
 
378 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>