More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0641 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 
411 aa  829    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  44.06 
 
 
421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  41.45 
 
 
411 aa  329  6e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  47.45 
 
 
396 aa  327  3e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  46.43 
 
 
396 aa  325  1e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  42.6 
 
 
411 aa  315  6e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  39.19 
 
 
407 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1865  diaminopimelate aminotransferase  40.69 
 
 
406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.363137  normal  0.0244826 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  40.85 
 
 
413 aa  306  6e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  37.22 
 
 
407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  41.96 
 
 
409 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2049  diaminopimelate aminotransferase  42.75 
 
 
409 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1333  diaminopimelate aminotransferase  39.66 
 
 
407 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  41.03 
 
 
410 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.78 
 
 
404 aa  276  4e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1933  diaminopimelate aminotransferase  38.86 
 
 
413 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  34.65 
 
 
415 aa  264  3e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  35.71 
 
 
415 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  34.98 
 
 
415 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  32.61 
 
 
423 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  34.42 
 
 
415 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.1 
 
 
398 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.79 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.95 
 
 
399 aa  129  9.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.19 
 
 
399 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.64 
 
 
433 aa  107  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  29.24 
 
 
442 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.3 
 
 
442 aa  103  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  30.31 
 
 
442 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.56 
 
 
419 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  28.89 
 
 
419 aa  99  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.48 
 
 
419 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.48 
 
 
419 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.1 
 
 
410 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  28.16 
 
 
433 aa  94.4  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.87 
 
 
385 aa  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  28.36 
 
 
434 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  28.48 
 
 
444 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.27 
 
 
370 aa  89.7  8e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0240606  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.22 
 
 
409 aa  89.7  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.66 
 
 
409 aa  89.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  27.24 
 
 
468 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  31.97 
 
 
442 aa  87.8  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  30.65 
 
 
437 aa  87.8  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  27 
 
 
434 aa  87.8  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.88 
 
 
366 aa  87  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  28.65 
 
 
462 aa  87  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  31.51 
 
 
440 aa  86.7  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  27.43 
 
 
452 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  27.72 
 
 
451 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  26.77 
 
 
411 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  26.51 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  35.15 
 
 
494 aa  84.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  27.05 
 
 
421 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  27.74 
 
 
440 aa  84.7  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.15 
 
 
413 aa  83.6  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1445  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.24 
 
 
365 aa  83.6  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0181667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  28.28 
 
 
432 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.14 
 
 
423 aa  83.6  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0078  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.47 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.81 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  27.18 
 
 
449 aa  83.2  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.22 
 
 
411 aa  82.8  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.53 
 
 
387 aa  82.8  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  25.95 
 
 
468 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  32.23 
 
 
435 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  31.63 
 
 
429 aa  82.8  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  29.04 
 
 
443 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1819  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  21.73 
 
 
452 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1496  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2108  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.4 
 
 
430 aa  82  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0921136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  26.88 
 
 
430 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  30.49 
 
 
434 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  28.19 
 
 
428 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  29.14 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.61 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2967  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.5 
 
 
395 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  30.2 
 
 
438 aa  79.7  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  25.46 
 
 
455 aa  79.7  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4562  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.81 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  26.67 
 
 
368 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1372  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.34 
 
 
375 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.5 
 
 
431 aa  78.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  26.23 
 
 
451 aa  78.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2996  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.8 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0449  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.87 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.408478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2313  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.71 
 
 
389 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0897692 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  30.31 
 
 
376 aa  79  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3141  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.34 
 
 
375 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  27.59 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1255  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.34 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.74 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.119075  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  25.94 
 
 
439 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  42.59 
 
 
448 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.97 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  31.63 
 
 
442 aa  77.4  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4285  acetylornithine deacetylase  34.97 
 
 
432 aa  77  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1278  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.14 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.645839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>