More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3551 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  93.06 
 
 		 453 aa  831    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  885    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  72.58 
 
 		 460 aa  618  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  65.63 
 
 		 455 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  62.01 
 
 		 445 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  58.6 
 
 		 456 aa  476  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  60.18 
 
 		 447 aa  472  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  57.47 
 
 		 445 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  57.11 
 
 		 453 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  57.11 
 
 		 453 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  57.11 
 
 		 453 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  59.81 
 
 		 470 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  57.17 
 
 		 469 aa  461  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  58.31 
 
 		 460 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  57.21 
 
 		 452 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  59.24 
 
 		 469 aa  451  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  57.88 
 
 		 464 aa  450  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  57.14 
 
 		 472 aa  449  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  58.14 
 
 		 464 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  55.41 
 
 		 484 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  55.51 
 
 		 476 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  54.57 
 
 		 488 aa  426  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  47.09 
 
 		 446 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  45.1 
 
 		 455 aa  350  3e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  44.14 
 
 		 455 aa  349  5e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  43.97 
 
 		 467 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  46.97 
 
 		 467 aa  340  4e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  45.9 
 
 		 448 aa  331  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  42.66 
 
 		 465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  42.66 
 
 		 465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  42.44 
 
 		 465 aa  312  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  41.23 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  41.46 
 
 		 449 aa  294  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  45.5 
 
 		 449 aa  290  4e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1926  peptidase M20  43.19 
 
 		 447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1438  peptidase M20  40.86 
 
 		 457 aa  282  8.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3706  peptidase M20  44.62 
 
 		 455 aa  279  9e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114919  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  35.67 
 
 		 455 aa  246  8e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  34.21 
 
 		 458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  34.54 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  34.65 
 
 		 465 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  34.4 
 
 		 465 aa  226  9e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  33.79 
 
 		 453 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  34.44 
 
 		 456 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  34.32 
 
 		 462 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  34.96 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  33.41 
 
 		 440 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  32.95 
 
 		 460 aa  217  2.9999999999999998e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  34 
 
 		 460 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  33.93 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  34.7 
 
 		 469 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  35.12 
 
 		 460 aa  212  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  33.33 
 
 		 463 aa  212  9e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  32.32 
 
 		 456 aa  211  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.26 
 
 		 475 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.81 
 
 		 456 aa  210  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  31.33 
 
 		 468 aa  209  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  33.96 
 
 		 460 aa  209  1e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  31.33 
 
 		 471 aa  208  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  33.55 
 
 		 458 aa  207  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  33.55 
 
 		 468 aa  206  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  31.72 
 
 		 469 aa  206  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  33.33 
 
 		 452 aa  206  9e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  32.67 
 
 		 471 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  32.67 
 
 		 471 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  32.45 
 
 		 470 aa  205  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  32.68 
 
 		 455 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  33.85 
 
 		 461 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  34.33 
 
 		 460 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  33.88 
 
 		 462 aa  204  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  32.55 
 
 		 462 aa  203  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  34.43 
 
 		 458 aa  203  6e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  33.77 
 
 		 461 aa  202  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  32.81 
 
 		 458 aa  202  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  31.41 
 
 		 462 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  30.51 
 
 		 484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  32.52 
 
 		 463 aa  200  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  32.89 
 
 		 468 aa  199  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  34.06 
 
 		 470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  31.36 
 
 		 453 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  34.06 
 
 		 457 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  36.59 
 
 		 464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.35 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  33.63 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  33.62 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  31.04 
 
 		 459 aa  197  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  33.62 
 
 		 457 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  35.18 
 
 		 479 aa  196  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  33.26 
 
 		 461 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  31.22 
 
 		 465 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  35.83 
 
 		 496 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  32.39 
 
 		 468 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  33.1 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  34.11 
 
 		 485 aa  192  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  32.25 
 
 		 451 aa  189  1e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  32.95 
 
 		 468 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  32.66 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  31.18 
 
 		 467 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  30.51 
 
 		 468 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  32.44 
 
 		 461 aa  186  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>