More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0480 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  100 
 
 		 453 aa  922    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  68.61 
 
 		 449 aa  595  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  62.9 
 
 		 449 aa  524  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3706  peptidase M20  51.11 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114919  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  44.97 
 
 		 446 aa  340  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  45.83 
 
 		 448 aa  327  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  43.26 
 
 		 460 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  41.88 
 
 		 470 aa  317  4e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  42.66 
 
 		 452 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  40.41 
 
 		 445 aa  305  8.000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  40.32 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  41.23 
 
 		 448 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  40.32 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  40.32 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  41.15 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  42.24 
 
 		 488 aa  304  2.0000000000000002e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  41.87 
 
 		 460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  39.64 
 
 		 467 aa  294  2e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  40.45 
 
 		 469 aa  294  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  39.61 
 
 		 455 aa  293  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1438  peptidase M20  40.7 
 
 		 457 aa  293  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  42.17 
 
 		 464 aa  289  6e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  40.27 
 
 		 445 aa  286  7e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  41.26 
 
 		 447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  40.95 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  37.19 
 
 		 484 aa  271  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  40.79 
 
 		 472 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  40.52 
 
 		 464 aa  268  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  36.64 
 
 		 455 aa  263  6.999999999999999e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  40.38 
 
 		 476 aa  262  6.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  39.52 
 
 		 469 aa  261  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1926  peptidase M20  38.44 
 
 		 447 aa  258  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  34.52 
 
 		 455 aa  252  9.000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  37.54 
 
 		 467 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  33.99 
 
 		 465 aa  213  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  33.74 
 
 		 465 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  33.74 
 
 		 465 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  32.45 
 
 		 455 aa  180  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  30.68 
 
 		 456 aa  179  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  30.16 
 
 		 459 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  30.39 
 
 		 440 aa  178  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  31.67 
 
 		 462 aa  170  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  28.54 
 
 		 453 aa  169  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  28.7 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  30.77 
 
 		 464 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  29.46 
 
 		 456 aa  160  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  28.41 
 
 		 471 aa  159  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.31 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  29.85 
 
 		 459 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  27.19 
 
 		 456 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  27.89 
 
 		 465 aa  156  6e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  28.67 
 
 		 470 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  29.81 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  29.22 
 
 		 485 aa  155  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  27.19 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  28.61 
 
 		 456 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  30.33 
 
 		 460 aa  153  7e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  27.48 
 
 		 461 aa  153  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  28.67 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  29.44 
 
 		 462 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  29.61 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  28.09 
 
 		 465 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  30.33 
 
 		 465 aa  151  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  32.16 
 
 		 460 aa  150  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  26.77 
 
 		 512 aa  149  7e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  29.05 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  28.63 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  29.89 
 
 		 488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  29.86 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  29.56 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  27.17 
 
 		 461 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  28.99 
 
 		 461 aa  145  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  30.21 
 
 		 458 aa  145  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  29.82 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  28.85 
 
 		 471 aa  144  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  28.85 
 
 		 471 aa  144  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  29.82 
 
 		 457 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  30.2 
 
 		 458 aa  144  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  29.34 
 
 		 461 aa  143  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  29.56 
 
 		 463 aa  143  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  27.85 
 
 		 460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  29.1 
 
 		 461 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  29.06 
 
 		 460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  29.48 
 
 		 461 aa  139  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  30.89 
 
 		 468 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  28.93 
 
 		 457 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  26.55 
 
 		 535 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.57 
 
 		 475 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  30.54 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  26.5 
 
 		 451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  29.78 
 
 		 462 aa  137  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.18 
 
 		 456 aa  136  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  25.49 
 
 		 458 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  30.82 
 
 		 496 aa  130  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  29 
 
 		 457 aa  130  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  27.99 
 
 		 468 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  25.72 
 
 		 484 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  30.05 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  26.78 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  28.88 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>