More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1438 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  70.42 
 
 		 453 aa  678    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  100 
 
 		 456 aa  940    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  68.21 
 
 		 453 aa  645    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  74.56 
 
 		 456 aa  699    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  67.68 
 
 		 463 aa  649    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  66.96 
 
 		 460 aa  637    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  65.78 
 
 		 459 aa  634  1e-180  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  63.85 
 
 		 485 aa  604  1.0000000000000001e-171  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  54.9 
 
 		 460 aa  521  1e-146  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  54.69 
 
 		 451 aa  512  1e-144  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  53.64 
 
 		 458 aa  486  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  54.99 
 
 		 440 aa  466  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  47.86 
 
 		 456 aa  443  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  50.94 
 
 		 455 aa  441  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  45.13 
 
 		 456 aa  412  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  45.58 
 
 		 475 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  45.73 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  49.44 
 
 		 459 aa  402  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  44.27 
 
 		 463 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  42.53 
 
 		 455 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  39.6 
 
 		 465 aa  363  5.0000000000000005e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  43.5 
 
 		 456 aa  360  4e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  43.64 
 
 		 458 aa  358  8e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  41.38 
 
 		 452 aa  358  9.999999999999999e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  41.74 
 
 		 458 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  42.54 
 
 		 461 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  43.17 
 
 		 460 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  43.14 
 
 		 460 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  40.96 
 
 		 467 aa  352  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  43.27 
 
 		 465 aa  349  5e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  41.61 
 
 		 464 aa  348  9e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  42.27 
 
 		 467 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  42.42 
 
 		 461 aa  340  4e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  40.22 
 
 		 472 aa  340  4e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  40.13 
 
 		 468 aa  338  8e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  42.06 
 
 		 471 aa  338  9e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  40.83 
 
 		 474 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  41.87 
 
 		 461 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  41.78 
 
 		 462 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  41.34 
 
 		 462 aa  335  9e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  42.41 
 
 		 464 aa  334  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  42.07 
 
 		 463 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  40.82 
 
 		 484 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  40.22 
 
 		 468 aa  333  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  41.46 
 
 		 471 aa  333  5e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  41.46 
 
 		 471 aa  333  5e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  41.11 
 
 		 462 aa  333  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  41.39 
 
 		 469 aa  332  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  42.43 
 
 		 463 aa  330  3e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  38.67 
 
 		 469 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  39.55 
 
 		 468 aa  330  5.0000000000000004e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  42.18 
 
 		 461 aa  329  6e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  42.18 
 
 		 461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  41.42 
 
 		 457 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  42.76 
 
 		 462 aa  326  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  41.19 
 
 		 470 aa  326  6e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  40.13 
 
 		 461 aa  325  9e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  41.34 
 
 		 457 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  39.56 
 
 		 457 aa  324  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  39.56 
 
 		 468 aa  323  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  41.5 
 
 		 468 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  39.29 
 
 		 460 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  39.18 
 
 		 470 aa  322  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  41.08 
 
 		 488 aa  321  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  40.99 
 
 		 468 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  38.7 
 
 		 468 aa  317  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  38.84 
 
 		 458 aa  313  2.9999999999999996e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  40.04 
 
 		 481 aa  312  9e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  38.53 
 
 		 465 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  41.98 
 
 		 468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  38.23 
 
 		 468 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  40.86 
 
 		 457 aa  307  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  37.39 
 
 		 479 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  36.34 
 
 		 465 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  36.34 
 
 		 465 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  36.34 
 
 		 465 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  35.6 
 
 		 467 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  36.84 
 
 		 448 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  36.46 
 
 		 448 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  35.87 
 
 		 452 aa  272  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  37.36 
 
 		 459 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  35.61 
 
 		 496 aa  253  6e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  36.27 
 
 		 535 aa  253  7e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  35.84 
 
 		 451 aa  239  6.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  35.11 
 
 		 451 aa  239  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  34.17 
 
 		 512 aa  236  5.0000000000000005e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  32.26 
 
 		 476 aa  233  8.000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  33.92 
 
 		 453 aa  231  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  34.93 
 
 		 437 aa  232  1e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  34.17 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  34.17 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  34.17 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  34.38 
 
 		 445 aa  231  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  34.54 
 
 		 460 aa  230  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  35.12 
 
 		 450 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78234  Glutamate carboxypeptidase-like protein  33.26 
 
 		 481 aa  224  3e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  34.76 
 
 		 406 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  34.4 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  34.31 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  31.03 
 
 		 446 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>