More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1840 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  100 
 
 		 448 aa  925    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  89.96 
 
 		 448 aa  848    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  66.59 
 
 		 451 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  44.84 
 
 		 453 aa  378  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  45.21 
 
 		 451 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  39.41 
 
 		 450 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  42.96 
 
 		 459 aa  351  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  39.95 
 
 		 437 aa  307  3e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1484  hypothetical protein  40.05 
 
 		 418 aa  300  3e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.555419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  34.38 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.13 
 
 		 445 aa  288  1e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1719  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  35.62 
 
 		 448 aa  285  9e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4109  peptidase M20  37.44 
 
 		 450 aa  282  9e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.720688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  36.84 
 
 		 456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  35.7 
 
 		 453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  35.38 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  35.94 
 
 		 456 aa  252  9.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  36.49 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  35.49 
 
 		 455 aa  249  5e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  34.29 
 
 		 456 aa  249  8e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  36.34 
 
 		 475 aa  247  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  35.78 
 
 		 463 aa  247  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  39.53 
 
 		 458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2145  peptidase M20  38.05 
 
 		 470 aa  243  6e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0790004  normal  0.0404303 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  34.08 
 
 		 451 aa  242  9e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  33.41 
 
 		 460 aa  241  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  39.54 
 
 		 456 aa  242  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  37.44 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.47 
 
 		 463 aa  236  7e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  34.38 
 
 		 459 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  32.52 
 
 		 459 aa  234  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  34.71 
 
 		 467 aa  232  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  33.97 
 
 		 462 aa  231  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2833  peptidase M20  34.48 
 
 		 443 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.03601  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  34.48 
 
 		 468 aa  224  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1640  hypothetical protein  30.73 
 
 		 458 aa  222  8e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  33.77 
 
 		 485 aa  222  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  35.61 
 
 		 496 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  38.27 
 
 		 406 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  34.57 
 
 		 474 aa  220  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0937  peptidase M20  33.41 
 
 		 450 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0137436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  34.99 
 
 		 458 aa  217  4e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  34 
 
 		 456 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  34.44 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  33.33 
 
 		 452 aa  215  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  35.57 
 
 		 464 aa  211  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  34.78 
 
 		 457 aa  210  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  32.9 
 
 		 460 aa  209  7e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  36.36 
 
 		 470 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  33.63 
 
 		 481 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  36.13 
 
 		 457 aa  206  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  33.04 
 
 		 467 aa  206  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  31.97 
 
 		 460 aa  206  9e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  34.42 
 
 		 460 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  36.14 
 
 		 457 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0916  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.78 
 
 		 521 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  32.55 
 
 		 468 aa  200  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  34.13 
 
 		 460 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0196  peptidase M20  33.98 
 
 		 448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  32.55 
 
 		 468 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  32.98 
 
 		 465 aa  199  9e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2415  peptidase M20  34.98 
 
 		 443 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  32.66 
 
 		 467 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  32.04 
 
 		 461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  34.42 
 
 		 465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  31.88 
 
 		 462 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  32.1 
 
 		 470 aa  197  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  32.1 
 
 		 463 aa  196  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  31.4 
 
 		 471 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  31.4 
 
 		 471 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  31.61 
 
 		 469 aa  195  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  31.67 
 
 		 465 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  32.73 
 
 		 464 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  31.15 
 
 		 471 aa  192  1e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  32.4 
 
 		 468 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  31.24 
 
 		 469 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  30.52 
 
 		 463 aa  190  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  31.46 
 
 		 465 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  32.68 
 
 		 462 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  33.12 
 
 		 462 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  31.89 
 
 		 458 aa  187  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0094  peptidase M20  33.17 
 
 		 448 aa  186  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  32.62 
 
 		 488 aa  186  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  31.01 
 
 		 465 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  31.01 
 
 		 465 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  32.71 
 
 		 479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  33.12 
 
 		 468 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  33.33 
 
 		 468 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  29.67 
 
 		 484 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  31.91 
 
 		 468 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  30.63 
 
 		 472 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  32.33 
 
 		 468 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  33.18 
 
 		 457 aa  182  7e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  32.01 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  31.49 
 
 		 462 aa  180  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  31 
 
 		 468 aa  180  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  31.78 
 
 		 461 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  31.59 
 
 		 461 aa  177  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  32.38 
 
 		 461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  31.18 
 
 		 458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>