184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0916 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0916  peptidase dimerisation domain-containing protein  100 
 
 		 521 aa  1063    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0372  twin-arginine translocation pathway signal  41.15 
 
 		 514 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.424462 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3870  peptidase M20  34.36 
 
 		 495 aa  265  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0529091  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  35.87 
 
 		 451 aa  223  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.922328 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  35.97 
 
 		 437 aa  213  7e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  33.41 
 
 		 453 aa  210  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  32.97 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  31.78 
 
 		 448 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.18 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  33.41 
 
 		 451 aa  193  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  31.29 
 
 		 456 aa  193  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  29.21 
 
 		 450 aa  187  4e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  30.24 
 
 		 452 aa  180  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  32.89 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1484  hypothetical protein  30.57 
 
 		 418 aa  177  3e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.555419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4109  peptidase M20  32.6 
 
 		 450 aa  175  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.720688 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  32.33 
 
 		 459 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  30.21 
 
 		 462 aa  173  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1719  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  31.06 
 
 		 448 aa  171  3e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  31.64 
 
 		 455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  31.87 
 
 		 458 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2145  peptidase M20  30.2 
 
 		 470 aa  163  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0790004  normal  0.0404303 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  31.35 
 
 		 464 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  30.73 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  31.67 
 
 		 458 aa  160  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  29.21 
 
 		 453 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  32.44 
 
 		 456 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  28.82 
 
 		 455 aa  157  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  31.66 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  29.75 
 
 		 452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  29.3 
 
 		 459 aa  154  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1186  peptidase M20  30.65 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126219  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.41 
 
 		 406 aa  152  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  29.19 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  31.64 
 
 		 496 aa  152  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  29.78 
 
 		 460 aa  151  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  32.02 
 
 		 467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  29.15 
 
 		 456 aa  146  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  30.84 
 
 		 457 aa  143  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  29.91 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.66 
 
 		 463 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.77 
 
 		 475 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.77 
 
 		 456 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  30.2 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0196  peptidase M20  27.67 
 
 		 448 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  30.02 
 
 		 440 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  29.24 
 
 		 462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1640  hypothetical protein  30.21 
 
 		 458 aa  134  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0094  peptidase M20  27.4 
 
 		 448 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2833  peptidase M20  27.99 
 
 		 443 aa  133  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.03601  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  30.89 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  31.22 
 
 		 461 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  30.65 
 
 		 461 aa  131  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  31.82 
 
 		 460 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  27.91 
 
 		 471 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  32.56 
 
 		 468 aa  130  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  31.2 
 
 		 461 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  31.2 
 
 		 461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  31.42 
 
 		 481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  29.54 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  29.98 
 
 		 465 aa  127  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  28.73 
 
 		 535 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  29.23 
 
 		 459 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  29.11 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  29.87 
 
 		 461 aa  124  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  28.89 
 
 		 458 aa  123  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  30.33 
 
 		 467 aa  123  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  30 
 
 		 460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  29.36 
 
 		 474 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  29.39 
 
 		 460 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  29.33 
 
 		 488 aa  120  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  29.23 
 
 		 460 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  28.89 
 
 		 465 aa  119  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  28.1 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  28.1 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  27.94 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  28.17 
 
 		 468 aa  118  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  28.86 
 
 		 463 aa  118  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  28.78 
 
 		 457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  29.07 
 
 		 485 aa  117  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  27.95 
 
 		 468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  30.87 
 
 		 456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  28.47 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  28 
 
 		 479 aa  116  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  29.49 
 
 		 470 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  29.89 
 
 		 457 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  29.92 
 
 		 464 aa  114  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78234  Glutamate carboxypeptidase-like protein  26.13 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0937  peptidase M20  26.34 
 
 		 450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0137436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  28.91 
 
 		 468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  29.81 
 
 		 470 aa  111  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  27.83 
 
 		 508 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  28.12 
 
 		 462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  26.87 
 
 		 468 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2415  peptidase M20  26.35 
 
 		 443 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  26.73 
 
 		 463 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  27.52 
 
 		 468 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  29.27 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  28.11 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  25.77 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>