More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1865 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  91.43 
 
 
470 aa  845    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  67.92 
 
 
458 aa  636    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  100 
 
 
457 aa  934    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  90.99 
 
 
457 aa  841    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  67.48 
 
 
461 aa  620  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  63.08 
 
 
462 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  67.25 
 
 
464 aa  601  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  61.57 
 
 
462 aa  594  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  62.45 
 
 
462 aa  587  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  60.78 
 
 
471 aa  586  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  60.78 
 
 
471 aa  586  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  60.78 
 
 
469 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  62.14 
 
 
462 aa  579  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  60.04 
 
 
471 aa  579  1e-164  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  62.08 
 
 
463 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  60.79 
 
 
468 aa  572  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  59.74 
 
 
463 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  60.7 
 
 
461 aa  560  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  58.77 
 
 
465 aa  551  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  60.61 
 
 
460 aa  547  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  58.3 
 
 
468 aa  545  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  59.52 
 
 
460 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  59.08 
 
 
460 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  59.43 
 
 
470 aa  540  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  56.99 
 
 
468 aa  531  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  59.83 
 
 
468 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  59.17 
 
 
468 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  58.28 
 
 
488 aa  526  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  58.3 
 
 
467 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  57.62 
 
 
461 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  56.92 
 
 
461 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  57.36 
 
 
461 aa  512  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  57.64 
 
 
468 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  57.14 
 
 
461 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  60.37 
 
 
468 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  53.28 
 
 
484 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  53.95 
 
 
468 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  50.86 
 
 
468 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  44.49 
 
 
458 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  42.32 
 
 
456 aa  360  4e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  44.22 
 
 
440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  45.02 
 
 
455 aa  351  2e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  43.05 
 
 
458 aa  347  3e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  41.91 
 
 
460 aa  345  8.999999999999999e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  42.96 
 
 
453 aa  342  7e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  41.09 
 
 
463 aa  339  5.9999999999999996e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  42.59 
 
 
456 aa  338  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  41.85 
 
 
455 aa  331  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  41.34 
 
 
456 aa  330  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  42.03 
 
 
453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  40.83 
 
 
463 aa  326  4.0000000000000003e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  41.16 
 
 
457 aa  326  5e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  41.59 
 
 
475 aa  323  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  40.93 
 
 
456 aa  320  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  39.56 
 
 
459 aa  317  3e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  41.1 
 
 
460 aa  315  8e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  41.18 
 
 
452 aa  311  1e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  41.18 
 
 
462 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  41.52 
 
 
458 aa  309  8e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  42.63 
 
 
465 aa  308  9e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  40.8 
 
 
485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  38.5 
 
 
465 aa  302  9e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  40.14 
 
 
459 aa  300  4e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  39.54 
 
 
451 aa  295  1e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  39.57 
 
 
467 aa  294  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  40.92 
 
 
469 aa  293  4e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  37.94 
 
 
472 aa  286  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  42.73 
 
 
481 aa  283  6.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  41.59 
 
 
464 aa  282  9e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  39.1 
 
 
474 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  37.64 
 
 
456 aa  271  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  38.68 
 
 
479 aa  270  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  36.52 
 
 
457 aa  260  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  37.67 
 
 
459 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  32.39 
 
 
452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  35.6 
 
 
451 aa  229  5e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  35.89 
 
 
496 aa  226  9e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  35.21 
 
 
448 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  35 
 
 
448 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  36.05 
 
 
453 aa  209  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  33.62 
 
 
448 aa  203  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  32.18 
 
 
467 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  33.9 
 
 
484 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  33.11 
 
 
437 aa  201  3e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  32.68 
 
 
453 aa  199  9e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  33.19 
 
 
465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  32.91 
 
 
465 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  32.91 
 
 
465 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  37.6 
 
 
406 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  31.75 
 
 
445 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  32.75 
 
 
455 aa  190  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78234  Glutamate carboxypeptidase-like protein  28.69 
 
 
481 aa  190  5e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  31.6 
 
 
464 aa  190  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  30.2 
 
 
445 aa  188  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  29.33 
 
 
450 aa  187  5e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  31 
 
 
453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  31 
 
 
453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  31 
 
 
453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1484  hypothetical protein  36.15 
 
 
418 aa  185  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.555419  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  31.93 
 
 
469 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>