More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2549 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  89.96 
 
 		 448 aa  848    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  100 
 
 		 448 aa  924    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  66.37 
 
 		 451 aa  601  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  46.12 
 
 		 451 aa  385  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  44.64 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  39.41 
 
 		 450 aa  360  3e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  42.49 
 
 		 459 aa  351  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  40.32 
 
 		 437 aa  307  3e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1484  hypothetical protein  40.96 
 
 		 418 aa  307  3e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.555419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  35.09 
 
 		 452 aa  299  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1719  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  36.99 
 
 		 448 aa  299  5e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.72 
 
 		 445 aa  295  1e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4109  peptidase M20  37.67 
 
 		 450 aa  288  1e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.720688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  36.46 
 
 		 456 aa  273  3e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  37.16 
 
 		 440 aa  267  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  36.44 
 
 		 463 aa  259  6e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  35.6 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  36.2 
 
 		 458 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  35.6 
 
 		 453 aa  256  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  36.22 
 
 		 456 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  35.94 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2145  peptidase M20  39.21 
 
 		 470 aa  253  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0790004  normal  0.0404303 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  33.78 
 
 		 456 aa  250  5e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  34.29 
 
 		 451 aa  247  4e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  35.21 
 
 		 456 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  35.44 
 
 		 475 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  33.62 
 
 		 460 aa  243  6e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  33.63 
 
 		 459 aa  241  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  36.07 
 
 		 455 aa  240  4e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  34.2 
 
 		 462 aa  239  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  35.71 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1640  hypothetical protein  32.57 
 
 		 458 aa  237  3e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.89 
 
 		 463 aa  231  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2833  peptidase M20  34.02 
 
 		 443 aa  230  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.03601  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  34.99 
 
 		 458 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  33.48 
 
 		 459 aa  227  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  34.72 
 
 		 474 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0937  peptidase M20  35.01 
 
 		 450 aa  226  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0137436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  34.47 
 
 		 468 aa  223  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  39.28 
 
 		 406 aa  223  7e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  34.19 
 
 		 485 aa  223  8e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  35.82 
 
 		 496 aa  222  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  35.51 
 
 		 481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  33.62 
 
 		 465 aa  213  7.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  32.03 
 
 		 460 aa  212  1e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  34.29 
 
 		 461 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  35.36 
 
 		 457 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  35.46 
 
 		 470 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  33.12 
 
 		 456 aa  209  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2415  peptidase M20  35.45 
 
 		 443 aa  208  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0916  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.97 
 
 		 521 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  32.47 
 
 		 460 aa  206  8e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  35.24 
 
 		 457 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  36.13 
 
 		 457 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  33.64 
 
 		 464 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  34.65 
 
 		 465 aa  204  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  32.8 
 
 		 452 aa  203  6e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0196  peptidase M20  33.49 
 
 		 448 aa  202  8e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  32.17 
 
 		 467 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  32.66 
 
 		 467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  32.1 
 
 		 462 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  31.28 
 
 		 469 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  33.88 
 
 		 479 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  38.48 
 
 		 464 aa  197  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  31.98 
 
 		 472 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  31.51 
 
 		 468 aa  196  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  31.75 
 
 		 470 aa  196  9e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  32.05 
 
 		 465 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0094  peptidase M20  33.17 
 
 		 448 aa  195  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  32.97 
 
 		 460 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  33.41 
 
 		 460 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  31.89 
 
 		 463 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  32.24 
 
 		 461 aa  193  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  32.35 
 
 		 458 aa  193  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  31.51 
 
 		 468 aa  192  8e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  31.09 
 
 		 465 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  31.15 
 
 		 465 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  31.15 
 
 		 465 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  32.46 
 
 		 462 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  31.57 
 
 		 462 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  30.04 
 
 		 471 aa  189  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  30.04 
 
 		 471 aa  189  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  31.99 
 
 		 463 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  29.71 
 
 		 484 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  32.72 
 
 		 457 aa  187  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  30.15 
 
 		 469 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  29.85 
 
 		 471 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  30.89 
 
 		 468 aa  183  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  36.57 
 
 		 488 aa  182  7e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  30.62 
 
 		 468 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  32.2 
 
 		 468 aa  179  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  32.22 
 
 		 468 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0372  twin-arginine translocation pathway signal  34.08 
 
 		 514 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.424462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  31.77 
 
 		 462 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  32.99 
 
 		 468 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  30.11 
 
 		 468 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  30.74 
 
 		 461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  30.72 
 
 		 461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  30.94 
 
 		 461 aa  173  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  35.88 
 
 		 461 aa  173  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>