More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2287 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  100 
 
 		 456 aa  917    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  48.67 
 
 		 459 aa  423  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  47.61 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  44.42 
 
 		 456 aa  388  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  45.27 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  44.84 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  43.5 
 
 		 456 aa  373  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  44.52 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  47.14 
 
 		 455 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  44.32 
 
 		 456 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  42.06 
 
 		 459 aa  364  2e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  41.39 
 
 		 453 aa  363  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  41.37 
 
 		 460 aa  359  6e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  44.08 
 
 		 467 aa  358  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  45.27 
 
 		 474 aa  356  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  43.46 
 
 		 462 aa  356  5e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  43.36 
 
 		 456 aa  352  7e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  40.22 
 
 		 460 aa  351  1e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  41.83 
 
 		 451 aa  347  2e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  43.36 
 
 		 475 aa  347  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  40.22 
 
 		 463 aa  345  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  42.35 
 
 		 455 aa  343  4e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  40.43 
 
 		 485 aa  331  2e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  39.1 
 
 		 458 aa  317  2e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  40.09 
 
 		 457 aa  318  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  41.2 
 
 		 452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  40.39 
 
 		 460 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  41.33 
 
 		 458 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  40.22 
 
 		 465 aa  307  3e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  41.07 
 
 		 464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  39.87 
 
 		 469 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  40.61 
 
 		 460 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  42.98 
 
 		 468 aa  299  6e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  39.52 
 
 		 471 aa  297  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  39.52 
 
 		 471 aa  297  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  37.86 
 
 		 468 aa  297  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  38.48 
 
 		 471 aa  296  5e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  39.39 
 
 		 461 aa  296  7e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  39.3 
 
 		 462 aa  296  7e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  36.17 
 
 		 484 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  40 
 
 		 463 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  38.93 
 
 		 461 aa  293  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  39.78 
 
 		 460 aa  293  5e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  38.17 
 
 		 465 aa  292  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  38.56 
 
 		 464 aa  290  4e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  39.25 
 
 		 472 aa  290  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  38.41 
 
 		 468 aa  290  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  37.64 
 
 		 461 aa  288  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  36.38 
 
 		 470 aa  286  5.999999999999999e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  39.82 
 
 		 461 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  39.82 
 
 		 461 aa  286  7e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  39.33 
 
 		 469 aa  285  8e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  39 
 
 		 461 aa  285  9e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  37.64 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  38.02 
 
 		 462 aa  280  5e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  37.5 
 
 		 468 aa  279  7e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  36.96 
 
 		 465 aa  279  7e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  40.88 
 
 		 481 aa  279  9e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  38.27 
 
 		 462 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  36.98 
 
 		 458 aa  278  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  38.38 
 
 		 468 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  38.24 
 
 		 470 aa  276  8e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  37.67 
 
 		 462 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  37.03 
 
 		 468 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  37.2 
 
 		 468 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  38.01 
 
 		 457 aa  272  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  36.98 
 
 		 467 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  37.95 
 
 		 468 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  38.29 
 
 		 488 aa  264  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  36.67 
 
 		 463 aa  264  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  38.35 
 
 		 468 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  38.73 
 
 		 479 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  34.28 
 
 		 457 aa  251  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  32.1 
 
 		 452 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  34 
 
 		 448 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  33.12 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  35.78 
 
 		 451 aa  220  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  35.75 
 
 		 451 aa  219  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  34.62 
 
 		 496 aa  218  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  32.97 
 
 		 476 aa  217  4e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  32.68 
 
 		 465 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  32.54 
 
 		 465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  32.68 
 
 		 465 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  36.81 
 
 		 459 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  32.46 
 
 		 535 aa  212  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  29.72 
 
 		 512 aa  209  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  33.03 
 
 		 467 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  35.07 
 
 		 446 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  35.79 
 
 		 406 aa  201  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78234  Glutamate carboxypeptidase-like protein  32.31 
 
 		 481 aa  199  7.999999999999999e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  33.18 
 
 		 445 aa  196  7e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  35.54 
 
 		 448 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  32.94 
 
 		 470 aa  186  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  33.11 
 
 		 455 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  32.57 
 
 		 453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  32.57 
 
 		 453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  32.57 
 
 		 453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  32.4 
 
 		 448 aa  183  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  26.29 
 
 		 450 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  28.99 
 
 		 437 aa  180  5.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>