More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5953 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  75.5 
 
 		 453 aa  730    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  100 
 
 		 453 aa  935    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  68.21 
 
 		 456 aa  645    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  66.52 
 
 		 463 aa  632  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  66.3 
 
 		 460 aa  629  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  68.67 
 
 		 456 aa  627  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  66.96 
 
 		 459 aa  622  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  63.18 
 
 		 485 aa  587  1e-166  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  58.94 
 
 		 460 aa  546  1e-154  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  56.4 
 
 		 451 aa  518  1e-146  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  53.57 
 
 		 458 aa  488  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  55.09 
 
 		 455 aa  479  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  54.2 
 
 		 440 aa  474  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  48.87 
 
 		 456 aa  457  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  48.78 
 
 		 462 aa  433  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  48.67 
 
 		 475 aa  432  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  48.97 
 
 		 456 aa  431  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  47.49 
 
 		 455 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  47.03 
 
 		 463 aa  414  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  47.53 
 
 		 459 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  45.25 
 
 		 461 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  44.6 
 
 		 452 aa  376  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  46.54 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  46.62 
 
 		 465 aa  373  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  40.72 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  45.89 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  42.76 
 
 		 464 aa  364  2e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  43.78 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  44.84 
 
 		 456 aa  362  6e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  43.22 
 
 		 458 aa  361  1e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  45.03 
 
 		 461 aa  360  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  44.44 
 
 		 462 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  43.68 
 
 		 474 aa  360  4e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  44.6 
 
 		 463 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  43.52 
 
 		 461 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  44.49 
 
 		 462 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  41.09 
 
 		 468 aa  354  1e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  44.17 
 
 		 461 aa  352  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  44.17 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  43.67 
 
 		 469 aa  350  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  45.75 
 
 		 468 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  40.13 
 
 		 458 aa  350  4e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  41.84 
 
 		 468 aa  349  6e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  43.76 
 
 		 460 aa  348  8e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  44.02 
 
 		 488 aa  348  8e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  42.44 
 
 		 457 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  45.18 
 
 		 462 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  44.93 
 
 		 464 aa  348  2e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  43.79 
 
 		 458 aa  347  3e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  45.06 
 
 		 467 aa  346  5e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  43.3 
 
 		 471 aa  345  6e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  43.3 
 
 		 471 aa  345  6e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  43.22 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  43.45 
 
 		 468 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  39.87 
 
 		 472 aa  341  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  42.79 
 
 		 462 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  42.3 
 
 		 468 aa  340  4e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  40.13 
 
 		 469 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  40.54 
 
 		 484 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  41.61 
 
 		 468 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  42.96 
 
 		 457 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  41.45 
 
 		 470 aa  337  3.9999999999999995e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  42.41 
 
 		 470 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  44.37 
 
 		 468 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  43.91 
 
 		 468 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  42.19 
 
 		 457 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  41.76 
 
 		 471 aa  330  3e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  43.12 
 
 		 457 aa  328  8e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  40.55 
 
 		 465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  41.84 
 
 		 463 aa  325  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  40.99 
 
 		 468 aa  324  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  39.37 
 
 		 479 aa  311  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  40.35 
 
 		 481 aa  311  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  37.47 
 
 		 465 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  37.04 
 
 		 465 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  37.04 
 
 		 465 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  35.96 
 
 		 452 aa  290  3e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  39.28 
 
 		 496 aa  290  5.0000000000000004e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  34.73 
 
 		 467 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  35.6 
 
 		 448 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  37.64 
 
 		 459 aa  257  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  35.38 
 
 		 448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  37.47 
 
 		 535 aa  251  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  35.83 
 
 		 451 aa  246  4.9999999999999997e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  36.36 
 
 		 437 aa  246  6.999999999999999e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  37.53 
 
 		 453 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  37.53 
 
 		 453 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  37.53 
 
 		 453 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  33.12 
 
 		 512 aa  241  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  37.38 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  35.62 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  36.04 
 
 		 470 aa  240  4e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  37.35 
 
 		 460 aa  240  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78234  Glutamate carboxypeptidase-like protein  34.56 
 
 		 481 aa  237  2e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  35.4 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  33.76 
 
 		 476 aa  232  1e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  34.98 
 
 		 453 aa  231  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  37.24 
 
 		 406 aa  229  6e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  36.74 
 
 		 447 aa  229  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  32.97 
 
 		 453 aa  226  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>