More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1655 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  74.62 
 
 		 460 aa  713    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  940    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  62.75 
 
 		 469 aa  610  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  63.26 
 
 		 463 aa  607  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  61.77 
 
 		 471 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  61.77 
 
 		 471 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  62.04 
 
 		 462 aa  598  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  60.52 
 
 		 462 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  60.09 
 
 		 462 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  61.39 
 
 		 460 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  59.87 
 
 		 468 aa  575  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  61.82 
 
 		 460 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  59.61 
 
 		 468 aa  566  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  61 
 
 		 461 aa  566  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  59.65 
 
 		 462 aa  566  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  60.04 
 
 		 468 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  58.95 
 
 		 471 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  59.65 
 
 		 461 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  59.39 
 
 		 468 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  57.64 
 
 		 468 aa  556  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  61.01 
 
 		 470 aa  549  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  57.86 
 
 		 468 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  60.35 
 
 		 461 aa  549  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  60.35 
 
 		 461 aa  549  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  60.7 
 
 		 457 aa  549  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  59.57 
 
 		 467 aa  547  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  60.79 
 
 		 457 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  56.99 
 
 		 465 aa  544  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  61.15 
 
 		 468 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  58.52 
 
 		 470 aa  544  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  58.52 
 
 		 468 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  57.86 
 
 		 461 aa  522  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  56.86 
 
 		 464 aa  502  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  54.37 
 
 		 458 aa  496  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  54.08 
 
 		 488 aa  478  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  52.4 
 
 		 484 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  51.62 
 
 		 468 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  50.54 
 
 		 463 aa  466  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  46.52 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  45.25 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  46.88 
 
 		 455 aa  378  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  43.72 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  43.68 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  45.68 
 
 		 456 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  43.57 
 
 		 456 aa  363  3e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  43.47 
 
 		 453 aa  359  6e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  42.54 
 
 		 456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  42.29 
 
 		 475 aa  355  6.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  42.79 
 
 		 456 aa  355  8.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  41.02 
 
 		 463 aa  349  5e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  42.32 
 
 		 459 aa  342  5.999999999999999e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  41.32 
 
 		 458 aa  342  8e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  42.05 
 
 		 463 aa  342  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  41.89 
 
 		 460 aa  338  9e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  41.41 
 
 		 485 aa  333  3e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  42.67 
 
 		 459 aa  333  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  40.18 
 
 		 465 aa  333  4e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  39.96 
 
 		 452 aa  329  8e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  40.76 
 
 		 451 aa  323  5e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  39.6 
 
 		 455 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  39.15 
 
 		 457 aa  310  5e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  40.35 
 
 		 458 aa  309  8e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  42.27 
 
 		 465 aa  306  6e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  39.57 
 
 		 464 aa  299  9e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  38.26 
 
 		 467 aa  298  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  37.75 
 
 		 462 aa  291  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  37.21 
 
 		 472 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  38.28 
 
 		 469 aa  291  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  39.16 
 
 		 479 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  37.17 
 
 		 474 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  38.02 
 
 		 457 aa  286  4e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  39.39 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  39.44 
 
 		 481 aa  273  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  33.55 
 
 		 452 aa  260  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  36.84 
 
 		 496 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  37.98 
 
 		 451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  31.99 
 
 		 476 aa  221  3e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  33.97 
 
 		 453 aa  216  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  36.09 
 
 		 459 aa  216  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  33.93 
 
 		 448 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78234  Glutamate carboxypeptidase-like protein  31.24 
 
 		 481 aa  214  3.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  33.55 
 
 		 484 aa  212  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  31.72 
 
 		 450 aa  210  5e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  33.26 
 
 		 453 aa  209  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  33.84 
 
 		 465 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  31.98 
 
 		 437 aa  207  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  33.41 
 
 		 465 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  33.41 
 
 		 465 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  34.56 
 
 		 455 aa  203  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  31.61 
 
 		 467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  34.92 
 
 		 456 aa  201  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  33.71 
 
 		 445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  32.31 
 
 		 488 aa  200  5e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  32.04 
 
 		 448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  29.58 
 
 		 512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  32.83 
 
 		 453 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  32.83 
 
 		 453 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  32.83 
 
 		 453 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  31.79 
 
 		 445 aa  197  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  32.24 
 
 		 448 aa  193  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>