More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4241 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  100 
 
 
481 aa  948    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  58.49 
 
 
472 aa  541  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  59.87 
 
 
469 aa  530  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  59.69 
 
 
458 aa  507  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  57.58 
 
 
464 aa  497  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  54.11 
 
 
479 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  47.4 
 
 
458 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  44 
 
 
456 aa  369  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  45.2 
 
 
440 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  45.33 
 
 
455 aa  337  2.9999999999999997e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  43.2 
 
 
456 aa  337  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  42.98 
 
 
467 aa  334  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  42.52 
 
 
475 aa  333  5e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  43.86 
 
 
462 aa  332  7.000000000000001e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  39.31 
 
 
453 aa  329  7e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  39.61 
 
 
460 aa  326  5e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  39.52 
 
 
456 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  40.04 
 
 
456 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  40.35 
 
 
453 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  41.48 
 
 
455 aa  318  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  42.95 
 
 
452 aa  316  5e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  39.09 
 
 
463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  41.39 
 
 
457 aa  311  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  40.39 
 
 
451 aa  310  2.9999999999999997e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  39.11 
 
 
459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  45.04 
 
 
468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  39.2 
 
 
459 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  41.61 
 
 
463 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  44.52 
 
 
465 aa  307  4.0000000000000004e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  43.08 
 
 
474 aa  300  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  37.77 
 
 
460 aa  300  4e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  41.79 
 
 
458 aa  300  5e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  40.99 
 
 
462 aa  300  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  41.93 
 
 
458 aa  299  6e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  38.46 
 
 
485 aa  296  5e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  41.53 
 
 
461 aa  295  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  41.06 
 
 
469 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  42.52 
 
 
460 aa  294  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  40.77 
 
 
462 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  40 
 
 
471 aa  293  6e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  40 
 
 
471 aa  293  6e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  40 
 
 
468 aa  290  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  37.85 
 
 
471 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  42.24 
 
 
468 aa  289  6e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  42.73 
 
 
461 aa  289  7e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  39.47 
 
 
465 aa  289  8e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  42.73 
 
 
457 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  41.28 
 
 
461 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  40.69 
 
 
464 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  41.76 
 
 
461 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  40.81 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  41.54 
 
 
461 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  38.79 
 
 
468 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  42.31 
 
 
470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  42.31 
 
 
457 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  38.36 
 
 
468 aa  282  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  40.9 
 
 
468 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  40.45 
 
 
462 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  39.44 
 
 
461 aa  280  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  40.39 
 
 
462 aa  280  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  40.22 
 
 
460 aa  280  6e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  39.91 
 
 
465 aa  279  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  38.31 
 
 
463 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  39.87 
 
 
468 aa  277  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  39.66 
 
 
470 aa  276  6e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  37.5 
 
 
467 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  39.22 
 
 
468 aa  273  7e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  40.88 
 
 
463 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  40.88 
 
 
456 aa  271  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  37.6 
 
 
468 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  39.71 
 
 
488 aa  261  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  36.36 
 
 
484 aa  256  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  38.62 
 
 
496 aa  245  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  34.46 
 
 
451 aa  242  9e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  30.15 
 
 
452 aa  229  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  35.51 
 
 
448 aa  225  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  36.56 
 
 
459 aa  221  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  36.62 
 
 
465 aa  217  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  36.06 
 
 
457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  35.5 
 
 
467 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  35.96 
 
 
465 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  35.96 
 
 
465 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  33.63 
 
 
448 aa  210  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  32.75 
 
 
451 aa  203  6e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  28.6 
 
 
450 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  32.4 
 
 
453 aa  195  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  36.78 
 
 
406 aa  187  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  36.04 
 
 
445 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  35.37 
 
 
453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  35.37 
 
 
453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  35.37 
 
 
453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  30.54 
 
 
544 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  30.54 
 
 
497 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  33.41 
 
 
453 aa  179  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  36.48 
 
 
447 aa  179  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  33.82 
 
 
445 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  30.79 
 
 
437 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  35.44 
 
 
470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  34.88 
 
 
452 aa  173  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1484  hypothetical protein  30.68 
 
 
418 aa  171  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.555419  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>