More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3645 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  81.46 
 
 
452 aa  675    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  100 
 
 
453 aa  890    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  100 
 
 
453 aa  890    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  100 
 
 
453 aa  890    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  82.56 
 
 
460 aa  692    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  84.51 
 
 
470 aa  708    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  65.31 
 
 
445 aa  541  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  58.3 
 
 
453 aa  479  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  58.28 
 
 
472 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  57.11 
 
 
448 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  54.38 
 
 
445 aa  457  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  57.72 
 
 
455 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  55.18 
 
 
447 aa  430  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  55.97 
 
 
460 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  53.76 
 
 
469 aa  422  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  54.73 
 
 
464 aa  420  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  53.69 
 
 
456 aa  419  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  50.33 
 
 
484 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  54.14 
 
 
469 aa  409  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  55.32 
 
 
464 aa  405  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  50.65 
 
 
488 aa  397  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  50 
 
 
476 aa  392  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  43.74 
 
 
455 aa  350  4e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  44.59 
 
 
467 aa  345  1e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  45.79 
 
 
446 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  43.02 
 
 
455 aa  335  7e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  46.31 
 
 
448 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  40.32 
 
 
453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1926  peptidase M20  43.14 
 
 
447 aa  301  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  41.93 
 
 
449 aa  300  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  40.68 
 
 
467 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  38.65 
 
 
465 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  38.65 
 
 
465 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1438  peptidase M20  41.06 
 
 
457 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368913  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  38.43 
 
 
465 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  42.76 
 
 
449 aa  289  7e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3706  peptidase M20  44.05 
 
 
455 aa  270  5e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114919  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  37.53 
 
 
453 aa  243  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  38.75 
 
 
469 aa  240  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  36.68 
 
 
458 aa  234  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  35.15 
 
 
465 aa  234  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  36.55 
 
 
455 aa  233  7.000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  34.17 
 
 
456 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  34.64 
 
 
462 aa  226  7e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  33.26 
 
 
455 aa  226  8e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  34.85 
 
 
458 aa  225  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.48 
 
 
463 aa  223  4.9999999999999996e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  33.49 
 
 
453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  33.19 
 
 
460 aa  221  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  34.31 
 
 
452 aa  220  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  33.9 
 
 
462 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  33.05 
 
 
468 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  35.16 
 
 
440 aa  216  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  33.05 
 
 
462 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  33.63 
 
 
465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.8 
 
 
456 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  32.98 
 
 
469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.8 
 
 
475 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  36.18 
 
 
464 aa  212  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  34.66 
 
 
470 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  34.33 
 
 
485 aa  211  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  35.56 
 
 
468 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  31.76 
 
 
471 aa  211  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  32.32 
 
 
456 aa  210  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  32.72 
 
 
458 aa  210  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  32.11 
 
 
462 aa  210  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  33.91 
 
 
460 aa  210  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  33.04 
 
 
465 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  32.83 
 
 
461 aa  209  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  33.97 
 
 
456 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  33.64 
 
 
457 aa  207  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  33.63 
 
 
463 aa  207  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  32.89 
 
 
471 aa  206  7e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  32.89 
 
 
471 aa  206  7e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  33.33 
 
 
460 aa  205  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  32.17 
 
 
462 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  34.49 
 
 
460 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  33.64 
 
 
459 aa  202  7e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  31.02 
 
 
459 aa  202  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  32.17 
 
 
461 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  33.92 
 
 
468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  35.84 
 
 
479 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  32.83 
 
 
461 aa  197  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  31.48 
 
 
463 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  33.04 
 
 
468 aa  195  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  31.32 
 
 
468 aa  194  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  32.53 
 
 
470 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  31.68 
 
 
468 aa  193  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  32.53 
 
 
457 aa  194  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  32.37 
 
 
468 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  32.32 
 
 
451 aa  192  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  32.95 
 
 
461 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  32.01 
 
 
457 aa  189  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  32.62 
 
 
472 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  30.45 
 
 
460 aa  188  1e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  30.65 
 
 
484 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  31.96 
 
 
474 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  30.75 
 
 
468 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  32.29 
 
 
461 aa  187  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  31.87 
 
 
458 aa  186  7e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>