More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0408 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  100 
 
 		 455 aa  921    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  74.29 
 
 		 455 aa  705    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  45.83 
 
 		 476 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  49.31 
 
 		 464 aa  381  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  44.91 
 
 		 484 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  48.12 
 
 		 447 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  47.07 
 
 		 445 aa  375  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  49.01 
 
 		 469 aa  371  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  48.47 
 
 		 464 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  44.93 
 
 		 488 aa  352  7e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  44.98 
 
 		 472 aa  351  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  44.14 
 
 		 448 aa  349  5e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  43.47 
 
 		 453 aa  345  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  42.79 
 
 		 445 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  43.02 
 
 		 453 aa  335  7e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  43.02 
 
 		 453 aa  335  7e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  43.02 
 
 		 453 aa  335  7e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  43.43 
 
 		 469 aa  333  3e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  42.56 
 
 		 460 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  40.88 
 
 		 455 aa  310  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  42.19 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  42.12 
 
 		 452 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  40.79 
 
 		 470 aa  301  1e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  43.05 
 
 		 456 aa  298  1e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  40.22 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  38.67 
 
 		 467 aa  268  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  41.26 
 
 		 448 aa  263  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  36.64 
 
 		 453 aa  263  6.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  36.72 
 
 		 449 aa  259  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1926  peptidase M20  35.79 
 
 		 447 aa  251  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  35 
 
 		 465 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  34.47 
 
 		 465 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  34.47 
 
 		 465 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  37.19 
 
 		 449 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1438  peptidase M20  34.53 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  34.88 
 
 		 467 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  33.72 
 
 		 453 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  32.53 
 
 		 455 aa  212  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  34.34 
 
 		 440 aa  209  8e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3706  peptidase M20  36.43 
 
 		 455 aa  207  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114919  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.98 
 
 		 463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  31.09 
 
 		 456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  31.44 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  31.02 
 
 		 465 aa  191  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  30.24 
 
 		 456 aa  190  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  32.97 
 
 		 464 aa  189  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  30.67 
 
 		 458 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  31.85 
 
 		 456 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  28.95 
 
 		 460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  33.33 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  31.41 
 
 		 461 aa  183  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  29.32 
 
 		 459 aa  183  7e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  30.84 
 
 		 472 aa  182  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  30.54 
 
 		 469 aa  180  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  29.08 
 
 		 463 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  31.28 
 
 		 452 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  27.93 
 
 		 465 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.46 
 
 		 475 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  28.66 
 
 		 455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.24 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  28.48 
 
 		 457 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  27.87 
 
 		 468 aa  169  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  29.07 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  28.54 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  28.72 
 
 		 468 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  28.79 
 
 		 458 aa  166  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  29.35 
 
 		 461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  27.68 
 
 		 465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  29.07 
 
 		 468 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  28 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  26.88 
 
 		 484 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  29.11 
 
 		 467 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  30 
 
 		 485 aa  161  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  29.66 
 
 		 460 aa  162  2e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  30.38 
 
 		 469 aa  162  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  28.05 
 
 		 460 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  28.66 
 
 		 471 aa  161  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  28.66 
 
 		 471 aa  161  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  28.79 
 
 		 470 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  30.53 
 
 		 468 aa  160  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  28.76 
 
 		 460 aa  159  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5005  peptidase M20  32.58 
 
 		 480 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.579178 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  28.88 
 
 		 460 aa  159  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  28.67 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  27.55 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  28.22 
 
 		 461 aa  156  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  29.28 
 
 		 462 aa  156  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  28.22 
 
 		 461 aa  156  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  29.17 
 
 		 456 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  27.71 
 
 		 464 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  31.91 
 
 		 512 aa  154  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38850  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  32.14 
 
 		 475 aa  153  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.507727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  28.39 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1737  peptidase M20  31.37 
 
 		 474 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353972 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  26.8 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  27.47 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0871  hypothetical protein  34.05 
 
 		 471 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  27.88 
 
 		 461 aa  151  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  27.31 
 
 		 474 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  28.41 
 
 		 468 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>