More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38850 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6984  peptidase M20  67.59 
 
 		 469 aa  638    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38850  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  100 
 
 		 475 aa  945    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.507727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0978  peptidase M20  51.29 
 
 		 497 aa  488  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.131029  normal  0.0607563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02249  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.85 
 
 		 497 aa  481  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1737  peptidase M20  52.89 
 
 		 474 aa  478  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353972 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5005  peptidase M20  49.68 
 
 		 480 aa  460  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.579178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0403  peptidase M20  49.04 
 
 		 511 aa  456  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4868  peptidase M20  48.23 
 
 		 500 aa  455  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0324  peptidase M20  51.15 
 
 		 497 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0871  hypothetical protein  46.94 
 
 		 471 aa  449  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0842  hypothetical protein  47.38 
 
 		 471 aa  451  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4121  peptidase M20  48.82 
 
 		 487 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5282  peptidase M20  49.67 
 
 		 503 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3479  peptidase M20  48.82 
 
 		 487 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.282817  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0192  M20/M25/M40 family peptidase  45.59 
 
 		 480 aa  445  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5276  peptidase dimerisation domain-containing protein  47.97 
 
 		 494 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222416  normal  0.090428 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4083  peptidase M20  49.58 
 
 		 491 aa  443  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2003  peptidase, M20A family  45.59 
 
 		 480 aa  441  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3703  peptidase M20  49.04 
 
 		 484 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239322  normal  0.638266 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6039  peptidase M20  47.7 
 
 		 508 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1202  peptidase M20  48.3 
 
 		 500 aa  438  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4859  peptidase M20  48.93 
 
 		 484 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.928163  normal  0.0105361 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4342  peptidase M20  48.93 
 
 		 484 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  hitchhiker  0.000513432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4771  peptidase M20  47.54 
 
 		 492 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0782  peptidase M20  48.61 
 
 		 484 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14582  normal  0.0758417 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1150  putative peptidase  47.85 
 
 		 487 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5457  peptidase M20  46.78 
 
 		 486 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.448917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5375  peptidase M20  48.61 
 
 		 484 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277005  normal  0.0563751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3455  peptidase M20  48.61 
 
 		 484 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163338  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3578  putative peptidase  49.69 
 
 		 502 aa  431  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4911  peptidase M20  48.61 
 
 		 484 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.697572 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0967  M20/M25/M40 family peptidase  47.51 
 
 		 483 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.294192  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2218  M20/M25/M40 family peptidase  47.51 
 
 		 483 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255073  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0875  M20/M25/M40 family peptidase  47.72 
 
 		 483 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0836  M20/M25/M40 family peptidase  47.29 
 
 		 483 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1562  M20/M25/M40 family peptidase  47.29 
 
 		 483 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102974  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0058  M20/M25/M40 family peptidase  47.29 
 
 		 483 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.317752  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1759  M20/M25/M40 family peptidase  47.07 
 
 		 479 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0908  peptidase M20  46.75 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.333631  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0233  peptidase M20  45.14 
 
 		 469 aa  344  2e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159664  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  37.01 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  36.27 
 
 		 445 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  35.08 
 
 		 464 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  35.93 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  33.26 
 
 		 453 aa  156  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  33.26 
 
 		 453 aa  156  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  33.26 
 
 		 453 aa  156  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  34.08 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  33.83 
 
 		 460 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  32.14 
 
 		 455 aa  153  5e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  31.73 
 
 		 484 aa  153  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  33.55 
 
 		 453 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  34.01 
 
 		 472 aa  150  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  31.83 
 
 		 445 aa  149  9e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  32.97 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  35.86 
 
 		 470 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  34.94 
 
 		 452 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  32.1 
 
 		 476 aa  143  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  31.83 
 
 		 455 aa  143  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  35.51 
 
 		 464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  32.91 
 
 		 469 aa  139  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  29.48 
 
 		 446 aa  137  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  33.25 
 
 		 455 aa  136  8e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  31.93 
 
 		 488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  33.4 
 
 		 460 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  30.51 
 
 		 449 aa  129  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  30.5 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  29.14 
 
 		 467 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  31.02 
 
 		 453 aa  124  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  29.39 
 
 		 465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  29.03 
 
 		 465 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  29.03 
 
 		 465 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.54 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  30.75 
 
 		 453 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  29.79 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  29.75 
 
 		 462 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  26.46 
 
 		 457 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  27.58 
 
 		 448 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  30.07 
 
 		 462 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  29.44 
 
 		 449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  30.73 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  27.35 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  30.95 
 
 		 462 aa  114  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  29.21 
 
 		 463 aa  113  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  30.39 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  29.43 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  29.38 
 
 		 471 aa  109  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  29.38 
 
 		 471 aa  109  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  25.86 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.74 
 
 		 456 aa  107  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  28.18 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  28.35 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.63 
 
 		 475 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  28.76 
 
 		 460 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  28.54 
 
 		 461 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  27.95 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  28.63 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  29.62 
 
 		 464 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  29.23 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1926  peptidase M20  29.28 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.137403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>