246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0233 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0233  peptidase M20  100 
 
 		 469 aa  897    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159664  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0908  peptidase M20  45.78 
 
 		 471 aa  348  1e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.333631  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38850  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  45.14 
 
 		 475 aa  344  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.507727 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1737  peptidase M20  42.4 
 
 		 474 aa  325  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353972 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0978  peptidase M20  39.14 
 
 		 497 aa  322  6e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.131029  normal  0.0607563 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2003  peptidase, M20A family  38.67 
 
 		 480 aa  322  9.999999999999999e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0192  M20/M25/M40 family peptidase  38.44 
 
 		 480 aa  321  9.999999999999999e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0842  hypothetical protein  36.5 
 
 		 471 aa  319  7.999999999999999e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0871  hypothetical protein  36.29 
 
 		 471 aa  318  1e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6984  peptidase M20  42.39 
 
 		 469 aa  317  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5005  peptidase M20  38.84 
 
 		 480 aa  315  8e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.579178 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02249  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.59 
 
 		 497 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5282  peptidase M20  39.82 
 
 		 503 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4083  peptidase M20  40.38 
 
 		 491 aa  309  9e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4771  peptidase M20  38.38 
 
 		 492 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4868  peptidase M20  37.87 
 
 		 500 aa  303  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5276  peptidase dimerisation domain-containing protein  39.74 
 
 		 494 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222416  normal  0.090428 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2218  M20/M25/M40 family peptidase  40.18 
 
 		 483 aa  302  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255073  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0782  peptidase M20  39.05 
 
 		 484 aa  302  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14582  normal  0.0758417 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0967  M20/M25/M40 family peptidase  40.18 
 
 		 483 aa  302  9e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.294192  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1150  putative peptidase  40.18 
 
 		 487 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6039  peptidase M20  39.19 
 
 		 508 aa  301  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0403  peptidase M20  37.15 
 
 		 511 aa  301  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4121  peptidase M20  37.12 
 
 		 487 aa  301  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0875  M20/M25/M40 family peptidase  39.96 
 
 		 483 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3479  peptidase M20  36.91 
 
 		 487 aa  300  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.282817  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3703  peptidase M20  38.66 
 
 		 484 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239322  normal  0.638266 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5457  peptidase M20  39.96 
 
 		 486 aa  300  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.448917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4342  peptidase M20  38.61 
 
 		 484 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  hitchhiker  0.000513432 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4859  peptidase M20  38.61 
 
 		 484 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.928163  normal  0.0105361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3455  peptidase M20  39.05 
 
 		 484 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163338  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4911  peptidase M20  39.05 
 
 		 484 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.697572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5375  peptidase M20  39.05 
 
 		 484 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277005  normal  0.0563751 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0836  M20/M25/M40 family peptidase  39.69 
 
 		 483 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0324  peptidase M20  40.82 
 
 		 497 aa  298  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0058  M20/M25/M40 family peptidase  39.69 
 
 		 483 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.317752  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1562  M20/M25/M40 family peptidase  39.69 
 
 		 483 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102974  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1759  M20/M25/M40 family peptidase  40.22 
 
 		 479 aa  296  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1202  peptidase M20  37.55 
 
 		 500 aa  296  5e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3578  putative peptidase  38.23 
 
 		 502 aa  277  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  38.21 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  37.28 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  38.21 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  38.21 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  35.62 
 
 		 460 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  37.66 
 
 		 448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  36.16 
 
 		 470 aa  153  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  37.8 
 
 		 460 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  33.73 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  36.78 
 
 		 469 aa  148  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  32.43 
 
 		 484 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  35.75 
 
 		 472 aa  146  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  34.44 
 
 		 447 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  35.24 
 
 		 464 aa  146  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  34.87 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  37.87 
 
 		 464 aa  144  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  35.01 
 
 		 452 aa  144  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  31.99 
 
 		 476 aa  143  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  35.58 
 
 		 469 aa  141  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  31.43 
 
 		 455 aa  136  8e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  32.75 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  32.18 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  34.34 
 
 		 488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  32.75 
 
 		 449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  33.77 
 
 		 448 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  30.8 
 
 		 465 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  31.17 
 
 		 465 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  30.8 
 
 		 465 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  30.47 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  33.63 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  32.75 
 
 		 467 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  31.01 
 
 		 467 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  30.98 
 
 		 465 aa  119  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  30.65 
 
 		 453 aa  117  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1438  peptidase M20  31.24 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368913  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  27.1 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  28.21 
 
 		 452 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1926  peptidase M20  30 
 
 		 447 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  29.94 
 
 		 461 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  28.18 
 
 		 456 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  27.95 
 
 		 462 aa  95.1  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  28.77 
 
 		 461 aa  94  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  30.49 
 
 		 449 aa  93.2  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  30.89 
 
 		 456 aa  92.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  28.54 
 
 		 461 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  27.1 
 
 		 461 aa  91.3  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  29.68 
 
 		 468 aa  90.9  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  24.61 
 
 		 460 aa  90.9  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  27.82 
 
 		 455 aa  90.9  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4378  hypothetical protein  30.3 
 
 		 473 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  26.83 
 
 		 460 aa  90.1  8e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  29.05 
 
 		 460 aa  89.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  30.9 
 
 		 471 aa  89.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  31.57 
 
 		 490 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  27.17 
 
 		 469 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.57 
 
 		 475 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  27.48 
 
 		 468 aa  88.2  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  28.39 
 
 		 462 aa  87.8  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.33 
 
 		 456 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  24.94 
 
 		 451 aa  86.7  8e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>