263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5457 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4859  peptidase M20  80.21 
 
 		 484 aa  814    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.928163  normal  0.0105361 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3479  peptidase M20  67.09 
 
 		 487 aa  659    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.282817  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0836  M20/M25/M40 family peptidase  78.94 
 
 		 483 aa  788    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2218  M20/M25/M40 family peptidase  79.57 
 
 		 483 aa  792    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255073  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0782  peptidase M20  80.62 
 
 		 484 aa  817    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14582  normal  0.0758417 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1759  M20/M25/M40 family peptidase  80.39 
 
 		 479 aa  790    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0324  peptidase M20  65.78 
 
 		 497 aa  638    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0403  peptidase M20  66.03 
 
 		 511 aa  654    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5457  peptidase M20  100 
 
 		 486 aa  989    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.448917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4868  peptidase M20  66.53 
 
 		 500 aa  655    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5276  peptidase dimerisation domain-containing protein  88.26 
 
 		 494 aa  891    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222416  normal  0.090428 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1150  putative peptidase  96.43 
 
 		 487 aa  944    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3703  peptidase M20  81.65 
 
 		 484 aa  825    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239322  normal  0.638266 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3455  peptidase M20  81.24 
 
 		 484 aa  814    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163338  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5375  peptidase M20  81.24 
 
 		 484 aa  814    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277005  normal  0.0563751 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4342  peptidase M20  80.21 
 
 		 484 aa  814    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  hitchhiker  0.000513432 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4911  peptidase M20  81.24 
 
 		 484 aa  814    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.697572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5282  peptidase M20  69.89 
 
 		 503 aa  673    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4771  peptidase M20  65.49 
 
 		 492 aa  660    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4083  peptidase M20  67.8 
 
 		 491 aa  652    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4121  peptidase M20  67.3 
 
 		 487 aa  661    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3578  putative peptidase  68.39 
 
 		 502 aa  669    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0058  M20/M25/M40 family peptidase  78.94 
 
 		 483 aa  788    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.317752  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0967  M20/M25/M40 family peptidase  79.57 
 
 		 483 aa  792    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.294192  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0875  M20/M25/M40 family peptidase  79.36 
 
 		 483 aa  792    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6039  peptidase M20  64.51 
 
 		 508 aa  639    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1562  M20/M25/M40 family peptidase  78.94 
 
 		 483 aa  788    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102974  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1202  peptidase M20  63.18 
 
 		 500 aa  633  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0978  peptidase M20  54.76 
 
 		 497 aa  535  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.131029  normal  0.0607563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02249  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.12 
 
 		 497 aa  528  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0871  hypothetical protein  51.59 
 
 		 471 aa  526  1e-148  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0842  hypothetical protein  51.59 
 
 		 471 aa  525  1e-147  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5005  peptidase M20  52.93 
 
 		 480 aa  523  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.579178 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1737  peptidase M20  52.44 
 
 		 474 aa  510  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353972 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0192  M20/M25/M40 family peptidase  51.06 
 
 		 480 aa  506  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2003  peptidase, M20A family  50.85 
 
 		 480 aa  504  1e-141  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0908  peptidase M20  49.46 
 
 		 471 aa  448  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.333631  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38850  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  46.74 
 
 		 475 aa  437  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.507727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6984  peptidase M20  44.82 
 
 		 469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0233  peptidase M20  39.31 
 
 		 469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159664  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  32.29 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  31.73 
 
 		 484 aa  152  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  31.7 
 
 		 476 aa  152  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  31.84 
 
 		 448 aa  150  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  32.09 
 
 		 453 aa  146  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  32.09 
 
 		 453 aa  146  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  32.42 
 
 		 460 aa  146  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  32.09 
 
 		 453 aa  146  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  31.98 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  33.42 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  33.42 
 
 		 470 aa  143  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  30.79 
 
 		 460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  31.52 
 
 		 469 aa  141  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  33.07 
 
 		 452 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  31.32 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  30.14 
 
 		 469 aa  139  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  27.52 
 
 		 455 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  29.93 
 
 		 467 aa  133  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  30.2 
 
 		 456 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  29.29 
 
 		 488 aa  128  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  31.93 
 
 		 464 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  30.67 
 
 		 449 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  29.58 
 
 		 445 aa  125  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  29.07 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  30.36 
 
 		 472 aa  123  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  28.11 
 
 		 465 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  28.87 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  28.78 
 
 		 464 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  30.07 
 
 		 464 aa  120  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  29.3 
 
 		 465 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  29.3 
 
 		 465 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  29.81 
 
 		 465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  27.29 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  31.33 
 
 		 447 aa  115  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  29.41 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  25.88 
 
 		 459 aa  106  9e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  27.3 
 
 		 468 aa  106  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  25.76 
 
 		 465 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  29.33 
 
 		 470 aa  104  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  25.96 
 
 		 474 aa  104  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  26.82 
 
 		 455 aa  104  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  25.59 
 
 		 461 aa  103  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  24.61 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  26.86 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  25.17 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  26.89 
 
 		 488 aa  101  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  27.95 
 
 		 440 aa  100  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  25.53 
 
 		 461 aa  99.8  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  27.73 
 
 		 448 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  26.56 
 
 		 462 aa  99.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  25.54 
 
 		 453 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  27.25 
 
 		 455 aa  99.8  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  28.78 
 
 		 464 aa  98.2  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  26.28 
 
 		 456 aa  97.8  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  26.64 
 
 		 458 aa  97.4  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  28.04 
 
 		 459 aa  97.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  27.71 
 
 		 461 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  28.28 
 
 		 468 aa  96.7  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  25.29 
 
 		 469 aa  96.3  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  25.18 
 
 		 469 aa  95.9  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>