More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0403 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3479  peptidase M20  78.82 
 
 		 487 aa  794    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.282817  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3703  peptidase M20  65.56 
 
 		 484 aa  655    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239322  normal  0.638266 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1202  peptidase M20  75.41 
 
 		 500 aa  771    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0836  M20/M25/M40 family peptidase  65.68 
 
 		 483 aa  644    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2218  M20/M25/M40 family peptidase  65.89 
 
 		 483 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255073  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0782  peptidase M20  65.35 
 
 		 484 aa  653    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14582  normal  0.0758417 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1759  M20/M25/M40 family peptidase  65.33 
 
 		 479 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4083  peptidase M20  76.58 
 
 		 491 aa  779    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0403  peptidase M20  100 
 
 		 511 aa  1051    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5282  peptidase M20  77.62 
 
 		 503 aa  790    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5457  peptidase M20  65.87 
 
 		 486 aa  641    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.448917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6039  peptidase M20  77.62 
 
 		 508 aa  777    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4868  peptidase M20  76.97 
 
 		 500 aa  802    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1150  putative peptidase  66.31 
 
 		 487 aa  646    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1562  M20/M25/M40 family peptidase  65.68 
 
 		 483 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102974  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5276  peptidase dimerisation domain-containing protein  65.84 
 
 		 494 aa  661    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222416  normal  0.090428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3455  peptidase M20  64.94 
 
 		 484 aa  643    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163338  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4859  peptidase M20  65.77 
 
 		 484 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.928163  normal  0.0105361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5375  peptidase M20  64.94 
 
 		 484 aa  643    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277005  normal  0.0563751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0324  peptidase M20  67.47 
 
 		 497 aa  666    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4342  peptidase M20  65.77 
 
 		 484 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  hitchhiker  0.000513432 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0058  M20/M25/M40 family peptidase  65.68 
 
 		 483 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.317752  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4121  peptidase M20  78.62 
 
 		 487 aa  792    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3578  putative peptidase  67.86 
 
 		 502 aa  686    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0875  M20/M25/M40 family peptidase  66.11 
 
 		 483 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4911  peptidase M20  64.94 
 
 		 484 aa  643    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.697572 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0967  M20/M25/M40 family peptidase  65.89 
 
 		 483 aa  649    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.294192  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4771  peptidase M20  77.6 
 
 		 492 aa  793    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5005  peptidase M20  53.14 
 
 		 480 aa  532  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.579178 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02249  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  54.35 
 
 		 497 aa  525  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0978  peptidase M20  52.23 
 
 		 497 aa  519  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.131029  normal  0.0607563 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0871  hypothetical protein  50.64 
 
 		 471 aa  507  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0842  hypothetical protein  50.21 
 
 		 471 aa  504  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0192  M20/M25/M40 family peptidase  49.79 
 
 		 480 aa  492  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1737  peptidase M20  51.61 
 
 		 474 aa  494  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353972 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2003  peptidase, M20A family  49.79 
 
 		 480 aa  491  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38850  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  49.04 
 
 		 475 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.507727 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0908  peptidase M20  47.56 
 
 		 471 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.333631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6984  peptidase M20  46.32 
 
 		 469 aa  430  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0233  peptidase M20  37.15 
 
 		 469 aa  301  2e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159664  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  30.69 
 
 		 469 aa  156  9e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  33.24 
 
 		 455 aa  151  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  31.22 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  31.31 
 
 		 453 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  30.52 
 
 		 484 aa  146  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  32.93 
 
 		 460 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  31.98 
 
 		 455 aa  144  4e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  28.76 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  28.76 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  28.76 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  31.38 
 
 		 476 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  30.57 
 
 		 445 aa  140  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  31.38 
 
 		 472 aa  137  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  30.81 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  31.52 
 
 		 469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  29.54 
 
 		 464 aa  131  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  30.91 
 
 		 447 aa  131  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  27.87 
 
 		 446 aa  130  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  30.9 
 
 		 464 aa  130  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  31.05 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  31.08 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  30.49 
 
 		 445 aa  127  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  29.75 
 
 		 456 aa  128  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  30.59 
 
 		 470 aa  126  9e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  29.95 
 
 		 488 aa  124  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  29.23 
 
 		 465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  29.23 
 
 		 465 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  29.23 
 
 		 465 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  29.08 
 
 		 467 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  29.18 
 
 		 449 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  29.32 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  27.61 
 
 		 465 aa  113  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  27.52 
 
 		 449 aa  113  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  26.96 
 
 		 448 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  25.86 
 
 		 457 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  26.42 
 
 		 453 aa  105  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  28.15 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.71 
 
 		 456 aa  101  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  28.38 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  26.75 
 
 		 488 aa  99.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  25.93 
 
 		 460 aa  99  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  25.05 
 
 		 463 aa  99  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  25.85 
 
 		 469 aa  98.6  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  26.44 
 
 		 471 aa  97.8  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  29.22 
 
 		 470 aa  97.8  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  26.44 
 
 		 471 aa  97.8  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  27.78 
 
 		 512 aa  97.1  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  26.78 
 
 		 465 aa  97.1  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  25.49 
 
 		 459 aa  97.1  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  30.05 
 
 		 456 aa  97.1  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  27.56 
 
 		 457 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  27.13 
 
 		 458 aa  95.9  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  26.46 
 
 		 452 aa  94.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.94 
 
 		 475 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  24.79 
 
 		 455 aa  94.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1926  peptidase M20  28.05 
 
 		 447 aa  94.4  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  26.12 
 
 		 462 aa  94.4  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1438  peptidase M20  27.41 
 
 		 457 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  26.97 
 
 		 461 aa  94  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  26.07 
 
 		 456 aa  92.8  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>