More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0121 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  100 
 
 
471 aa  962    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  100 
 
 
471 aa  962    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  77.11 
 
 
462 aa  757    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  76.96 
 
 
463 aa  737    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  79.18 
 
 
462 aa  763    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  77.92 
 
 
462 aa  750    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  94.02 
 
 
469 aa  907    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  75.43 
 
 
462 aa  724    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  69.26 
 
 
468 aa  675    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  71.61 
 
 
471 aa  702    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  61.77 
 
 
461 aa  602  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  62.37 
 
 
468 aa  594  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  62.15 
 
 
468 aa  594  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  61.77 
 
 
460 aa  591  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  61.69 
 
 
461 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  60.48 
 
 
460 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  61.77 
 
 
461 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  61.77 
 
 
461 aa  580  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  61.56 
 
 
461 aa  579  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  60.78 
 
 
457 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  60.91 
 
 
460 aa  570  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  61.11 
 
 
468 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  60.81 
 
 
467 aa  566  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  58.66 
 
 
465 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  60.3 
 
 
461 aa  567  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  61.26 
 
 
468 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  59.14 
 
 
470 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  59.31 
 
 
470 aa  561  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  59.4 
 
 
468 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  58.75 
 
 
457 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  63.04 
 
 
468 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  56.25 
 
 
458 aa  546  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  56.69 
 
 
488 aa  539  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  58.39 
 
 
464 aa  537  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  56.06 
 
 
468 aa  534  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  52.89 
 
 
484 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  51.5 
 
 
463 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  52.85 
 
 
468 aa  478  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  44.03 
 
 
458 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  46.62 
 
 
455 aa  361  1e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  43.81 
 
 
440 aa  354  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  43.02 
 
 
460 aa  346  4e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  43.3 
 
 
453 aa  345  7e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  42.89 
 
 
459 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  41.16 
 
 
456 aa  334  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  41.46 
 
 
456 aa  333  6e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  40.86 
 
 
463 aa  330  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  41.24 
 
 
463 aa  327  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  42.3 
 
 
459 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  40.04 
 
 
457 aa  320  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  42.42 
 
 
456 aa  320  5e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  38.26 
 
 
456 aa  319  5e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  38.48 
 
 
475 aa  317  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  40 
 
 
453 aa  312  6.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  43.3 
 
 
465 aa  312  7.999999999999999e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  39 
 
 
452 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  41.05 
 
 
458 aa  310  4e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  40.4 
 
 
451 aa  310  5e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  41.59 
 
 
485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  38.94 
 
 
458 aa  305  9.000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  40.78 
 
 
462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  40.52 
 
 
464 aa  300  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  39.32 
 
 
469 aa  299  6e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  37.94 
 
 
455 aa  299  9e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  38.41 
 
 
467 aa  296  6e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  40.4 
 
 
460 aa  294  3e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  37.31 
 
 
474 aa  293  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  35.33 
 
 
465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  37.4 
 
 
472 aa  285  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  39.52 
 
 
456 aa  283  6.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  40 
 
 
481 aa  281  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  37.96 
 
 
457 aa  276  6e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  39.91 
 
 
479 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  34.48 
 
 
452 aa  254  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  33.62 
 
 
451 aa  223  8e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  35.28 
 
 
459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  33.91 
 
 
484 aa  219  7.999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  33.84 
 
 
496 aa  211  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  32.89 
 
 
453 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  32.89 
 
 
453 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  32.89 
 
 
453 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  32.67 
 
 
448 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  32.13 
 
 
453 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  33.11 
 
 
460 aa  203  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  34.21 
 
 
465 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  33.33 
 
 
465 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  33.33 
 
 
465 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  32.35 
 
 
455 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  31.4 
 
 
448 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  32 
 
 
467 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  32.85 
 
 
453 aa  193  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  33.18 
 
 
452 aa  190  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  34.43 
 
 
406 aa  190  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  30.04 
 
 
448 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  33.19 
 
 
469 aa  188  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  29.79 
 
 
476 aa  189  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  32.27 
 
 
445 aa  189  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  31.46 
 
 
469 aa  188  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  31.87 
 
 
464 aa  188  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  33.18 
 
 
470 aa  187  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>