More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5344 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  69.26 
 
 		 471 aa  675    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  69.26 
 
 		 471 aa  675    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  71.58 
 
 		 462 aa  700    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  71.37 
 
 		 462 aa  701    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  70.72 
 
 		 462 aa  693    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  65.44 
 
 		 471 aa  638    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  71.96 
 
 		 463 aa  701    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  100 
 
 		 468 aa  960    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  70.09 
 
 		 469 aa  681    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  65.16 
 
 		 462 aa  631  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  59.87 
 
 		 461 aa  575  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  59.48 
 
 		 465 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  60.65 
 
 		 470 aa  559  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  60.79 
 
 		 457 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  59.65 
 
 		 460 aa  552  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  59.48 
 
 		 468 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  57.27 
 
 		 468 aa  549  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  56.62 
 
 		 468 aa  545  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  59.47 
 
 		 470 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  57.92 
 
 		 468 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  57.45 
 
 		 461 aa  541  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  59.03 
 
 		 457 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  58.1 
 
 		 468 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  57.08 
 
 		 467 aa  530  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  55.34 
 
 		 458 aa  527  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  57.86 
 
 		 461 aa  527  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  57.86 
 
 		 461 aa  518  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  58.08 
 
 		 461 aa  518  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  56.52 
 
 		 461 aa  521  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  55.53 
 
 		 460 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  54.82 
 
 		 488 aa  518  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  59.68 
 
 		 468 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  57.33 
 
 		 464 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  55.43 
 
 		 468 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  54.88 
 
 		 460 aa  512  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  51.72 
 
 		 484 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  50.22 
 
 		 463 aa  467  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  50.54 
 
 		 468 aa  462  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  43.83 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  46.28 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  40.72 
 
 		 440 aa  332  8e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  40.22 
 
 		 456 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  39.15 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  40.99 
 
 		 453 aa  324  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  40.82 
 
 		 459 aa  323  4e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  39.56 
 
 		 456 aa  323  4e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  37.85 
 
 		 463 aa  320  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  38.85 
 
 		 452 aa  319  7.999999999999999e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  38.63 
 
 		 457 aa  317  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  38.73 
 
 		 460 aa  314  2.9999999999999996e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  38.67 
 
 		 456 aa  311  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  38.58 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  37.69 
 
 		 475 aa  306  7e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  40 
 
 		 458 aa  306  7e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  39.72 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  38.62 
 
 		 453 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  39.69 
 
 		 459 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  39.5 
 
 		 462 aa  302  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  37.98 
 
 		 455 aa  300  5e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  36.59 
 
 		 465 aa  297  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  39.43 
 
 		 460 aa  296  4e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  41.15 
 
 		 465 aa  296  5e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  37.39 
 
 		 451 aa  293  7e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  36.74 
 
 		 467 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  39.47 
 
 		 464 aa  288  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  38.14 
 
 		 485 aa  283  5.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  37.86 
 
 		 456 aa  283  6.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  36.92 
 
 		 469 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  40 
 
 		 481 aa  282  9e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  35.17 
 
 		 472 aa  281  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  37.86 
 
 		 474 aa  280  4e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  38.21 
 
 		 457 aa  276  7e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  37.91 
 
 		 479 aa  259  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  33.91 
 
 		 452 aa  253  5.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  35.41 
 
 		 451 aa  231  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  35.54 
 
 		 459 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  32.98 
 
 		 496 aa  225  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  33.05 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  33.05 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  33.05 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  36.41 
 
 		 406 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  31.1 
 
 		 467 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  31.33 
 
 		 448 aa  209  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  34 
 
 		 460 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  31.55 
 
 		 465 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  31.55 
 
 		 465 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  31.74 
 
 		 465 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  31.24 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  30.52 
 
 		 455 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  33.11 
 
 		 452 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  31.47 
 
 		 447 aa  197  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  31.37 
 
 		 469 aa  195  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  32.33 
 
 		 445 aa  193  7e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  31.81 
 
 		 460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  30.84 
 
 		 453 aa  190  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  32.07 
 
 		 464 aa  189  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  30.77 
 
 		 445 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  31.61 
 
 		 484 aa  187  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  32.67 
 
 		 469 aa  187  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  30.51 
 
 		 437 aa  186  6e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>