More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0526 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  100 
 
 		 464 aa  941    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  75 
 
 		 458 aa  691    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  63.08 
 
 		 469 aa  578  1e-164  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  57.05 
 
 		 472 aa  525  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  57.58 
 
 		 481 aa  505  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  53.58 
 
 		 479 aa  481  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  47.46 
 
 		 458 aa  403  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  45.01 
 
 		 456 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  42.76 
 
 		 453 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  44.32 
 
 		 456 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  44.96 
 
 		 475 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  45.52 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  45.13 
 
 		 462 aa  371  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  41.61 
 
 		 456 aa  366  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  41.91 
 
 		 456 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  41.43 
 
 		 460 aa  364  2e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  42.16 
 
 		 459 aa  363  3e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  41.89 
 
 		 451 aa  362  1e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  40.83 
 
 		 453 aa  360  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  47.24 
 
 		 455 aa  358  9.999999999999999e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  43.88 
 
 		 463 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  40.71 
 
 		 465 aa  352  5e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  43.11 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  41.87 
 
 		 455 aa  347  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  40.69 
 
 		 463 aa  347  3e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  43.88 
 
 		 474 aa  344  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  39.17 
 
 		 460 aa  341  2e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  42.89 
 
 		 468 aa  340  4e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  41.94 
 
 		 458 aa  338  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  42.76 
 
 		 452 aa  337  2.9999999999999997e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  40.3 
 
 		 485 aa  333  4e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  42.39 
 
 		 462 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  44.83 
 
 		 465 aa  321  1.9999999999999998e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  40.65 
 
 		 469 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  40.52 
 
 		 471 aa  316  6e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  40.52 
 
 		 471 aa  316  6e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  39.57 
 
 		 461 aa  316  6e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  38.65 
 
 		 459 aa  314  2.9999999999999996e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  39 
 
 		 471 aa  311  1e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  41.57 
 
 		 462 aa  309  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  41.11 
 
 		 462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  40.65 
 
 		 458 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  39.47 
 
 		 468 aa  306  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  40.67 
 
 		 462 aa  306  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  41.07 
 
 		 456 aa  302  9e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  39.73 
 
 		 465 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  41.59 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  40 
 
 		 461 aa  298  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  41.23 
 
 		 461 aa  298  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  39.73 
 
 		 470 aa  296  4e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  39.21 
 
 		 461 aa  295  9e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  38.8 
 
 		 484 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  41.01 
 
 		 464 aa  293  4e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  39.09 
 
 		 468 aa  293  6e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  39.12 
 
 		 460 aa  292  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  39 
 
 		 460 aa  290  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  38.83 
 
 		 463 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  39.33 
 
 		 468 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  40.93 
 
 		 470 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  38.34 
 
 		 463 aa  286  5.999999999999999e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  39.43 
 
 		 461 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  40.71 
 
 		 457 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  38.26 
 
 		 468 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  39.43 
 
 		 461 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  37.37 
 
 		 467 aa  279  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  37.69 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  34.93 
 
 		 452 aa  278  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  38.44 
 
 		 468 aa  276  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  38.95 
 
 		 488 aa  273  4.0000000000000004e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  35.63 
 
 		 457 aa  266  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  38.73 
 
 		 468 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  37.78 
 
 		 468 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  37.95 
 
 		 468 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  37.17 
 
 		 457 aa  258  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  36.38 
 
 		 465 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  37.66 
 
 		 496 aa  245  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  35.95 
 
 		 465 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  35.95 
 
 		 465 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  34.68 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  36.26 
 
 		 459 aa  236  7e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  34.06 
 
 		 467 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  28.88 
 
 		 450 aa  227  4e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  36.18 
 
 		 453 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  36.18 
 
 		 453 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  36.18 
 
 		 453 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  36.49 
 
 		 452 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  35.98 
 
 		 470 aa  220  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  36.15 
 
 		 453 aa  219  7e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  38.62 
 
 		 460 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  37.53 
 
 		 488 aa  214  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  36.59 
 
 		 448 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  33.41 
 
 		 455 aa  212  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  33.64 
 
 		 448 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  36.83 
 
 		 445 aa  211  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  37.75 
 
 		 464 aa  209  6e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.54 
 
 		 445 aa  209  8e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  32.79 
 
 		 437 aa  209  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  32.68 
 
 		 453 aa  206  7e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  30.34 
 
 		 476 aa  204  3e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  30.72 
 
 		 497 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>