More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0455 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  100 
 
 		 459 aa  914    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  46.45 
 
 		 451 aa  358  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  42.4 
 
 		 448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  42.86 
 
 		 448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  42.38 
 
 		 451 aa  358  1.9999999999999998e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  39.55 
 
 		 453 aa  305  8.000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  34.99 
 
 		 452 aa  296  5e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  35.07 
 
 		 450 aa  295  8e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  37.28 
 
 		 456 aa  295  9e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  39.77 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4109  peptidase M20  37.31 
 
 		 450 aa  279  7e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.720688 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  37.78 
 
 		 437 aa  276  4e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  38.34 
 
 		 456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  37.81 
 
 		 459 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  36.96 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  37.75 
 
 		 453 aa  267  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2145  peptidase M20  39.15 
 
 		 470 aa  266  5e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0790004  normal  0.0404303 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1484  hypothetical protein  39.17 
 
 		 418 aa  262  8e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.555419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  36.56 
 
 		 455 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  36.32 
 
 		 456 aa  261  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  36.4 
 
 		 453 aa  259  7e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  36.63 
 
 		 458 aa  259  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  35.81 
 
 		 451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  35.67 
 
 		 475 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  38.18 
 
 		 440 aa  254  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  35.6 
 
 		 462 aa  253  5.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  39.17 
 
 		 461 aa  250  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  35.18 
 
 		 460 aa  249  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1719  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  31.01 
 
 		 448 aa  248  2e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  39.01 
 
 		 470 aa  246  8e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  37.72 
 
 		 457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  37.64 
 
 		 457 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  36.05 
 
 		 463 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  36.26 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  37.7 
 
 		 462 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.33 
 
 		 463 aa  237  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  34.67 
 
 		 471 aa  237  4e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  37.47 
 
 		 462 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  34.97 
 
 		 485 aa  236  7e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  34.63 
 
 		 469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  37.22 
 
 		 462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  35.15 
 
 		 458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  33.92 
 
 		 457 aa  234  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  36.05 
 
 		 470 aa  233  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  35.15 
 
 		 452 aa  233  7.000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  36.77 
 
 		 463 aa  233  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  35.57 
 
 		 468 aa  232  8.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  33.85 
 
 		 467 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  35.96 
 
 		 465 aa  229  9e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.22 
 
 		 445 aa  229  1e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  34.23 
 
 		 465 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  40.28 
 
 		 406 aa  227  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  35.32 
 
 		 471 aa  226  6e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  35.32 
 
 		 471 aa  226  6e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  36.59 
 
 		 488 aa  226  7e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  35.1 
 
 		 458 aa  226  9e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0937  peptidase M20  35.03 
 
 		 450 aa  226  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0137436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  33.86 
 
 		 459 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  34.15 
 
 		 496 aa  225  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  35.41 
 
 		 462 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  34.36 
 
 		 469 aa  224  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  35.46 
 
 		 461 aa  222  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  33.78 
 
 		 484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  34.9 
 
 		 460 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  35.01 
 
 		 460 aa  221  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  34.43 
 
 		 458 aa  219  7e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  34.9 
 
 		 460 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  36.22 
 
 		 468 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  32.09 
 
 		 465 aa  219  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  35.89 
 
 		 481 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  33.33 
 
 		 460 aa  217  4e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  32.54 
 
 		 472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0094  peptidase M20  31.24 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  36.94 
 
 		 456 aa  211  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  35 
 
 		 461 aa  210  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  33.33 
 
 		 474 aa  210  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  34.45 
 
 		 464 aa  209  7e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1640  hypothetical protein  29.59 
 
 		 458 aa  209  7e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  34.08 
 
 		 461 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  33.56 
 
 		 463 aa  209  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2833  peptidase M20  31.28 
 
 		 443 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.03601  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  34.55 
 
 		 461 aa  204  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  34.55 
 
 		 461 aa  204  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  32.17 
 
 		 468 aa  203  6e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  31.73 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  33.1 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 468 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0196  peptidase M20  30.8 
 
 		 448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  32.45 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  32.21 
 
 		 467 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  32.29 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  31.93 
 
 		 479 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  32.07 
 
 		 468 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  32.65 
 
 		 457 aa  193  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2415  peptidase M20  30.11 
 
 		 443 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  28.51 
 
 		 508 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0916  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.45 
 
 		 521 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  30.56 
 
 		 465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  30.34 
 
 		 465 aa  163  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  30.34 
 
 		 465 aa  163  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>