More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7804 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  100 
 
 
472 aa  954    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  56.65 
 
 
469 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  58.49 
 
 
481 aa  527  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  57.05 
 
 
464 aa  513  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  56.74 
 
 
458 aa  510  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  51.88 
 
 
479 aa  451  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  45.89 
 
 
458 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  43.9 
 
 
456 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  42.83 
 
 
455 aa  345  1e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  41.9 
 
 
462 aa  343  4e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  41.52 
 
 
475 aa  342  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  39.87 
 
 
453 aa  341  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  40.22 
 
 
456 aa  340  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  40.87 
 
 
456 aa  335  7.999999999999999e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  40 
 
 
459 aa  332  8e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  39.61 
 
 
456 aa  329  8e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  42 
 
 
458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  37.63 
 
 
453 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  40.09 
 
 
467 aa  326  5e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  38.71 
 
 
460 aa  323  4e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  41.95 
 
 
440 aa  323  4e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  39.01 
 
 
460 aa  322  9.000000000000001e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  40.65 
 
 
455 aa  322  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  38.18 
 
 
451 aa  321  1.9999999999999998e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  41.32 
 
 
463 aa  320  3.9999999999999996e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  38.38 
 
 
463 aa  320  3.9999999999999996e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  38.1 
 
 
465 aa  317  4e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  40.65 
 
 
474 aa  313  5.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  38.49 
 
 
485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  39.29 
 
 
468 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  36.29 
 
 
459 aa  297  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  36.89 
 
 
471 aa  295  1e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  38.68 
 
 
458 aa  292  9e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  37.21 
 
 
461 aa  291  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  37.83 
 
 
452 aa  289  6e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  37.92 
 
 
465 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  39.3 
 
 
461 aa  287  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  38.46 
 
 
462 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  40.58 
 
 
461 aa  286  5.999999999999999e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  37.4 
 
 
471 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  37.4 
 
 
471 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  38.24 
 
 
462 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  39.35 
 
 
462 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  35.17 
 
 
468 aa  281  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  37.94 
 
 
457 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  39.3 
 
 
461 aa  279  6e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  36.19 
 
 
469 aa  279  7e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  36.19 
 
 
470 aa  279  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  39.26 
 
 
468 aa  278  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  39.08 
 
 
461 aa  277  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  38.29 
 
 
470 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  39.25 
 
 
456 aa  277  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  38.29 
 
 
457 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  37.97 
 
 
462 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  38.33 
 
 
465 aa  276  7e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  37.74 
 
 
468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  40.61 
 
 
460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  37.42 
 
 
467 aa  273  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  39.3 
 
 
460 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  37.72 
 
 
463 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  35.26 
 
 
457 aa  270  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  37.09 
 
 
463 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  37.71 
 
 
464 aa  267  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  36.38 
 
 
468 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  36.8 
 
 
468 aa  264  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  37.89 
 
 
461 aa  263  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  36.31 
 
 
460 aa  260  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  37.26 
 
 
468 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  36.21 
 
 
488 aa  258  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  33.76 
 
 
484 aa  255  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  37.33 
 
 
468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  37.58 
 
 
468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  30.17 
 
 
452 aa  239  8e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  35.14 
 
 
465 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  35.14 
 
 
465 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  35.14 
 
 
465 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  35.08 
 
 
496 aa  223  8e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  33.91 
 
 
457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  32.77 
 
 
451 aa  210  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  32.61 
 
 
467 aa  209  8e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  35.32 
 
 
445 aa  206  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  32.65 
 
 
459 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  33.83 
 
 
453 aa  200  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  34.79 
 
 
452 aa  199  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  34.81 
 
 
445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  33.62 
 
 
448 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  31.98 
 
 
448 aa  196  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  35.16 
 
 
469 aa  196  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  30.21 
 
 
453 aa  196  7e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  35.41 
 
 
488 aa  196  8.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  30.64 
 
 
476 aa  196  9e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  32.82 
 
 
469 aa  192  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  32.62 
 
 
453 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  32.62 
 
 
453 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  32.62 
 
 
453 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  33.56 
 
 
460 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  27.97 
 
 
450 aa  189  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  33.04 
 
 
470 aa  188  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  33.79 
 
 
464 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  30.63 
 
 
448 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>