More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0843 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  100 
 
 
458 aa  944    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  51.52 
 
 
458 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  44.95 
 
 
456 aa  404  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  46.07 
 
 
455 aa  396  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  44.98 
 
 
463 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  45.16 
 
 
440 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  43.31 
 
 
459 aa  371  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  42.21 
 
 
475 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  44.26 
 
 
456 aa  364  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  42.79 
 
 
462 aa  363  3e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  40.89 
 
 
456 aa  361  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  43.22 
 
 
453 aa  361  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  43.64 
 
 
456 aa  358  8e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  41.83 
 
 
460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  42.36 
 
 
468 aa  350  3e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  41.89 
 
 
467 aa  350  4e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  44.59 
 
 
468 aa  348  8e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  43.48 
 
 
465 aa  348  8e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  43.27 
 
 
468 aa  347  2e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  43.88 
 
 
470 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  41.86 
 
 
463 aa  343  5e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  43.21 
 
 
458 aa  342  8e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  41.32 
 
 
461 aa  342  8e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  43.05 
 
 
457 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  39.07 
 
 
453 aa  341  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  39.41 
 
 
455 aa  340  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  43.88 
 
 
457 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  43.95 
 
 
468 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  41.48 
 
 
468 aa  340  5e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  44.19 
 
 
468 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  42.79 
 
 
468 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  38.72 
 
 
451 aa  337  2.9999999999999997e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  42.02 
 
 
461 aa  335  7e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  41.94 
 
 
469 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  42.38 
 
 
460 aa  333  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  39.91 
 
 
452 aa  332  8e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  41.39 
 
 
485 aa  329  5.0000000000000004e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  42 
 
 
472 aa  328  9e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  40.54 
 
 
467 aa  326  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  41.74 
 
 
460 aa  326  5e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  39.82 
 
 
471 aa  326  6e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  40.18 
 
 
460 aa  325  1e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  42.92 
 
 
468 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  39.15 
 
 
468 aa  324  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  40.92 
 
 
465 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  41.94 
 
 
464 aa  323  4e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  40.27 
 
 
462 aa  319  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  41.26 
 
 
460 aa  319  6e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  39.7 
 
 
464 aa  317  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  40.95 
 
 
474 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  40.09 
 
 
470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  39.96 
 
 
459 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  38.36 
 
 
465 aa  314  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  37.63 
 
 
463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  40.68 
 
 
461 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  40 
 
 
463 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  39.96 
 
 
458 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  38.39 
 
 
462 aa  306  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  38.7 
 
 
469 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  37.95 
 
 
462 aa  306  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  38.94 
 
 
471 aa  305  8.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  38.94 
 
 
471 aa  305  8.000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  39.78 
 
 
479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  40.88 
 
 
461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  39.1 
 
 
456 aa  302  9e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  37.78 
 
 
462 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  38.15 
 
 
457 aa  300  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  37.58 
 
 
484 aa  299  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  39.87 
 
 
488 aa  296  6e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  41.93 
 
 
481 aa  296  6e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  40.23 
 
 
461 aa  295  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  40.23 
 
 
461 aa  295  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  39.14 
 
 
457 aa  293  6e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  33.12 
 
 
452 aa  266  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  36.71 
 
 
451 aa  257  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  34.21 
 
 
448 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  31.82 
 
 
465 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  31.82 
 
 
465 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  32.35 
 
 
465 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  33.63 
 
 
453 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  34.99 
 
 
448 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  35.48 
 
 
459 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  34.93 
 
 
496 aa  227  3e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  34.4 
 
 
445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  32.19 
 
 
476 aa  221  3e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  33.94 
 
 
535 aa  220  5e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  30.91 
 
 
467 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  34.99 
 
 
448 aa  217  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  30.93 
 
 
512 aa  214  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  34.41 
 
 
453 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  32.14 
 
 
470 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  32.72 
 
 
453 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  32.72 
 
 
453 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  32.72 
 
 
453 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78234  Glutamate carboxypeptidase-like protein  31.67 
 
 
481 aa  207  3e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  30.28 
 
 
446 aa  206  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  31.37 
 
 
448 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  34.73 
 
 
406 aa  206  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  32.89 
 
 
460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  28.08 
 
 
450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>