More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0561 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  100 
 
 
451 aa  938    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  55.38 
 
 
460 aa  532  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  55.58 
 
 
453 aa  522  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  56.4 
 
 
453 aa  518  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  57.27 
 
 
456 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  54.69 
 
 
456 aa  512  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  55.9 
 
 
459 aa  513  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  54.73 
 
 
463 aa  508  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  53.45 
 
 
460 aa  468  1.0000000000000001e-131  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  52.53 
 
 
485 aa  469  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  52.24 
 
 
458 aa  463  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  47.51 
 
 
456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  50 
 
 
455 aa  434  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  45.43 
 
 
440 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  45.23 
 
 
463 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  44.37 
 
 
456 aa  395  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  44.92 
 
 
475 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  46.28 
 
 
465 aa  360  3e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  41.97 
 
 
455 aa  354  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  41.72 
 
 
458 aa  349  5e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  41.89 
 
 
464 aa  347  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  40 
 
 
462 aa  346  6e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  42.06 
 
 
452 aa  345  8.999999999999999e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  42.06 
 
 
459 aa  342  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  38.72 
 
 
458 aa  337  2.9999999999999997e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  41.83 
 
 
456 aa  335  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  44.62 
 
 
461 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  40.71 
 
 
469 aa  330  3e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  40.32 
 
 
467 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  40.22 
 
 
468 aa  326  6e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  44.39 
 
 
461 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  44.39 
 
 
461 aa  323  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  40.76 
 
 
461 aa  323  5e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  41.78 
 
 
460 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  38.18 
 
 
472 aa  321  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  37.47 
 
 
465 aa  320  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  41.2 
 
 
469 aa  316  6e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  41.47 
 
 
468 aa  316  6e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  41.29 
 
 
460 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  41.33 
 
 
467 aa  312  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  40.49 
 
 
457 aa  311  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  42.01 
 
 
461 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  40.27 
 
 
468 aa  311  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  40.4 
 
 
471 aa  310  5e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  40.4 
 
 
471 aa  310  5e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  41.06 
 
 
470 aa  309  5.9999999999999995e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  41.04 
 
 
462 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  39.81 
 
 
458 aa  308  9e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  41.51 
 
 
460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  40.39 
 
 
481 aa  307  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  40.9 
 
 
471 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  41.55 
 
 
463 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  39.6 
 
 
468 aa  302  7.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  40.59 
 
 
462 aa  302  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  41.61 
 
 
468 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  40.49 
 
 
462 aa  299  9e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  40.92 
 
 
462 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  40.45 
 
 
461 aa  297  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  36.83 
 
 
474 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  38.57 
 
 
484 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  38.67 
 
 
464 aa  293  6e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  37.39 
 
 
468 aa  293  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  39.14 
 
 
488 aa  292  9e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  40.5 
 
 
465 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  41.08 
 
 
468 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  39.54 
 
 
457 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  40 
 
 
468 aa  289  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  39.77 
 
 
468 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  37.78 
 
 
463 aa  286  4e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  38.9 
 
 
457 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  37.39 
 
 
457 aa  280  5e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  38.67 
 
 
470 aa  279  7e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  37.44 
 
 
465 aa  279  9e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  36.55 
 
 
465 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  36.55 
 
 
465 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  33.11 
 
 
452 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  36.32 
 
 
467 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  35.79 
 
 
496 aa  256  4e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  34.97 
 
 
479 aa  253  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  36.47 
 
 
459 aa  246  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  34.29 
 
 
448 aa  247  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  34.08 
 
 
448 aa  242  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  33.93 
 
 
535 aa  241  2.9999999999999997e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  35.71 
 
 
451 aa  239  9e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  31.45 
 
 
512 aa  226  5.0000000000000005e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  31.3 
 
 
476 aa  225  1e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1484  hypothetical protein  33.56 
 
 
418 aa  223  4.9999999999999996e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.555419  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78234  Glutamate carboxypeptidase-like protein  33.33 
 
 
481 aa  223  6e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  32.51 
 
 
450 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  33.63 
 
 
437 aa  220  5e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  33.04 
 
 
453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  32.23 
 
 
451 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  35.34 
 
 
406 aa  202  9e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1520  peptidase M20  31.74 
 
 
488 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.305754 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  32.32 
 
 
453 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  32.32 
 
 
453 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  32.32 
 
 
453 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  30.33 
 
 
446 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  31.92 
 
 
484 aa  190  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  31.47 
 
 
453 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>