More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0950 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  100 
 
 
452 aa  929    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  51.32 
 
 
456 aa  467  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  51.32 
 
 
475 aa  467  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  48.79 
 
 
455 aa  440  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  45.35 
 
 
456 aa  389  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  45.52 
 
 
458 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  44.12 
 
 
455 aa  377  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  45.41 
 
 
462 aa  375  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  44.6 
 
 
453 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  44.06 
 
 
456 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  42.43 
 
 
453 aa  364  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  42.28 
 
 
463 aa  363  4e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  41.38 
 
 
456 aa  358  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  42.37 
 
 
459 aa  350  2e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  46.01 
 
 
465 aa  350  3e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  40.87 
 
 
460 aa  349  5e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  41.27 
 
 
463 aa  348  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  40.67 
 
 
460 aa  345  8e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  42.06 
 
 
451 aa  345  8.999999999999999e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  43.54 
 
 
485 aa  345  1e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  43.96 
 
 
440 aa  345  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  43.89 
 
 
461 aa  342  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  42.35 
 
 
467 aa  333  4e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  39.91 
 
 
458 aa  332  8e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  43.92 
 
 
460 aa  331  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  43.6 
 
 
468 aa  331  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  41.85 
 
 
463 aa  330  4e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  43.21 
 
 
461 aa  329  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  39.96 
 
 
461 aa  329  8e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  42.66 
 
 
460 aa  325  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  40.84 
 
 
470 aa  325  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  42.99 
 
 
461 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  42.76 
 
 
461 aa  322  8e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  41.94 
 
 
458 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  42.56 
 
 
462 aa  321  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  42.76 
 
 
464 aa  320  3e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  38.85 
 
 
468 aa  319  7.999999999999999e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  39.24 
 
 
465 aa  319  7.999999999999999e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  40.49 
 
 
460 aa  318  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  40.31 
 
 
468 aa  316  5e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  40.31 
 
 
468 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  40.48 
 
 
465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  40.75 
 
 
469 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  39.43 
 
 
469 aa  313  4.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  41.65 
 
 
474 aa  312  5.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  40.09 
 
 
462 aa  312  6.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  39 
 
 
471 aa  310  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  39 
 
 
471 aa  310  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  38.8 
 
 
462 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  40.27 
 
 
461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  39.02 
 
 
462 aa  310  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  39.61 
 
 
468 aa  310  5e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  41.65 
 
 
488 aa  308  9e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  39.74 
 
 
484 aa  308  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  37.97 
 
 
471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  40.09 
 
 
467 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  41.18 
 
 
457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  40.32 
 
 
458 aa  303  4.0000000000000003e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  40.72 
 
 
470 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  42.95 
 
 
481 aa  302  7.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  40.84 
 
 
464 aa  302  9e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  40.9 
 
 
468 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  39.69 
 
 
468 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  41.2 
 
 
456 aa  299  5e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  38.69 
 
 
463 aa  300  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  40.59 
 
 
457 aa  299  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  40.54 
 
 
468 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  40.49 
 
 
457 aa  296  5e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  37.61 
 
 
459 aa  295  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  38.41 
 
 
457 aa  293  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  40.92 
 
 
468 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  37.83 
 
 
472 aa  289  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  39.05 
 
 
479 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  38.94 
 
 
496 aa  258  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  36.22 
 
 
451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  33.63 
 
 
465 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  33.63 
 
 
465 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  33.19 
 
 
465 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  31.04 
 
 
452 aa  226  7e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  32.45 
 
 
467 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  34.95 
 
 
459 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  34.15 
 
 
453 aa  224  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  35.21 
 
 
445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  34.31 
 
 
453 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  34.31 
 
 
453 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  34.31 
 
 
453 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  37.37 
 
 
406 aa  216  7e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  33.33 
 
 
448 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  30.77 
 
 
512 aa  213  7e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  35.49 
 
 
469 aa  209  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  35.93 
 
 
437 aa  208  2e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  33.56 
 
 
445 aa  208  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  33.77 
 
 
472 aa  206  8e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  33.33 
 
 
448 aa  206  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  32.64 
 
 
452 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  33.57 
 
 
460 aa  204  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  32.8 
 
 
448 aa  203  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  32.16 
 
 
470 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  27.85 
 
 
450 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  33.41 
 
 
447 aa  196  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>