More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0848 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  100 
 
 		 479 aa  936    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  54.73 
 
 		 458 aa  464  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  53.58 
 
 		 464 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  51.88 
 
 		 472 aa  451  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  53.14 
 
 		 469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  54.11 
 
 		 481 aa  437  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  41.8 
 
 		 456 aa  329  8e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  43.08 
 
 		 440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  41.35 
 
 		 465 aa  320  3.9999999999999996e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  43.02 
 
 		 458 aa  319  7e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  41.72 
 
 		 462 aa  318  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  40.92 
 
 		 475 aa  312  7.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  39.37 
 
 		 453 aa  311  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  40.4 
 
 		 456 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  42.18 
 
 		 455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  39.78 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  38.51 
 
 		 455 aa  297  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  40 
 
 		 467 aa  295  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  39.16 
 
 		 461 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  37.39 
 
 		 456 aa  288  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  39.05 
 
 		 474 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  35.36 
 
 		 453 aa  282  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  37.19 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  40.32 
 
 		 461 aa  280  6e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  35.23 
 
 		 460 aa  279  8e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  37 
 
 		 459 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  40.74 
 
 		 462 aa  279  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  39.78 
 
 		 469 aa  277  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  41.91 
 
 		 464 aa  276  5e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  39.05 
 
 		 452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  35.65 
 
 		 463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  40.89 
 
 		 468 aa  274  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  35.86 
 
 		 459 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  39.91 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  39.91 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  36.87 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  38.37 
 
 		 465 aa  271  2e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  40.41 
 
 		 470 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  39.86 
 
 		 462 aa  270  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  37.97 
 
 		 457 aa  268  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  37.39 
 
 		 470 aa  267  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  40.18 
 
 		 457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  39.13 
 
 		 462 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  35.91 
 
 		 460 aa  266  7e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  38.68 
 
 		 457 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  37.19 
 
 		 463 aa  265  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  39.5 
 
 		 462 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  38.99 
 
 		 460 aa  260  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  38.67 
 
 		 461 aa  259  8e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  39.19 
 
 		 458 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  37.91 
 
 		 468 aa  259  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  37.05 
 
 		 463 aa  258  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  40 
 
 		 460 aa  258  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  39.07 
 
 		 460 aa  257  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  37.62 
 
 		 463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  34.97 
 
 		 451 aa  253  5.000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  37.33 
 
 		 461 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  37.18 
 
 		 465 aa  250  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  38.8 
 
 		 468 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  37.88 
 
 		 468 aa  248  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  37.56 
 
 		 461 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  38.73 
 
 		 456 aa  244  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  37.33 
 
 		 461 aa  243  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  36.18 
 
 		 485 aa  242  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  34 
 
 		 484 aa  240  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  37.85 
 
 		 468 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  36.7 
 
 		 468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  37.27 
 
 		 468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  36.9 
 
 		 468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  38.91 
 
 		 488 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  32.13 
 
 		 452 aa  234  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  36.08 
 
 		 468 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  35.14 
 
 		 453 aa  216  8e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  36.96 
 
 		 496 aa  213  7e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  33.48 
 
 		 457 aa  208  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  35.01 
 
 		 467 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  34.07 
 
 		 465 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  33.85 
 
 		 465 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  33.85 
 
 		 465 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  35.06 
 
 		 452 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.68 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  35.84 
 
 		 453 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  35.84 
 
 		 453 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  35.84 
 
 		 453 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  33.88 
 
 		 448 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  35.18 
 
 		 448 aa  196  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  33.25 
 
 		 451 aa  194  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  33.94 
 
 		 467 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  35.01 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  36.09 
 
 		 470 aa  189  9e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  35.08 
 
 		 488 aa  189  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  31.48 
 
 		 459 aa  188  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  35.68 
 
 		 445 aa  187  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  35.15 
 
 		 453 aa  186  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  32.71 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  27.21 
 
 		 450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  32.63 
 
 		 451 aa  178  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  33.71 
 
 		 469 aa  176  8e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  35.03 
 
 		 472 aa  176  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  31.48 
 
 		 437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>