More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1547 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  100 
 
 
455 aa  917    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  58.93 
 
 
440 aa  502  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  54.23 
 
 
456 aa  490  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  55.09 
 
 
453 aa  479  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  51.96 
 
 
453 aa  461  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  52.74 
 
 
463 aa  456  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  53.42 
 
 
458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  50.94 
 
 
456 aa  441  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  49.77 
 
 
460 aa  439  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  51.04 
 
 
463 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  49.54 
 
 
459 aa  437  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  50 
 
 
451 aa  434  1e-120  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  47.75 
 
 
456 aa  432  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  51.27 
 
 
485 aa  424  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  51 
 
 
465 aa  412  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  47.79 
 
 
475 aa  409  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  48.13 
 
 
462 aa  411  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  48.42 
 
 
456 aa  409  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  48.75 
 
 
459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  47.05 
 
 
460 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  47.9 
 
 
455 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  46.07 
 
 
458 aa  396  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  46.88 
 
 
461 aa  378  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  44.12 
 
 
452 aa  377  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  46.43 
 
 
461 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  46.46 
 
 
470 aa  375  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  46.28 
 
 
468 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  46.82 
 
 
460 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  47.13 
 
 
467 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  46.21 
 
 
461 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  47.94 
 
 
462 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  47.39 
 
 
458 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  45.17 
 
 
471 aa  371  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  46.42 
 
 
463 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  46.21 
 
 
461 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  45.43 
 
 
462 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  46.1 
 
 
462 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  46.21 
 
 
461 aa  365  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  46.36 
 
 
460 aa  362  6e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  46.82 
 
 
469 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  46.1 
 
 
467 aa  362  9e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  46.62 
 
 
471 aa  361  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  46.62 
 
 
471 aa  361  1e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  44.73 
 
 
468 aa  361  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  45.82 
 
 
461 aa  360  4e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  44.7 
 
 
468 aa  358  9e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  44.57 
 
 
468 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  45.6 
 
 
468 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  46.98 
 
 
462 aa  357  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  42.25 
 
 
465 aa  356  3.9999999999999996e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  44.92 
 
 
468 aa  355  1e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  47.14 
 
 
456 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  45.79 
 
 
474 aa  353  4e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  45.27 
 
 
468 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  45.31 
 
 
460 aa  352  1e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  43.64 
 
 
488 aa  350  3e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  43.67 
 
 
458 aa  349  8e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  43.96 
 
 
465 aa  348  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  43.51 
 
 
468 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  47.24 
 
 
464 aa  345  8e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  42.83 
 
 
472 aa  345  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  45.02 
 
 
457 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  44.8 
 
 
464 aa  343  4e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  42.82 
 
 
457 aa  342  8e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  44.34 
 
 
470 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  42.24 
 
 
484 aa  339  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  43.99 
 
 
469 aa  338  9e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  45.12 
 
 
468 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  44.12 
 
 
457 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  41.69 
 
 
463 aa  331  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  45.33 
 
 
481 aa  327  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  41.24 
 
 
457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  42.18 
 
 
479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  36.99 
 
 
452 aa  300  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  41.53 
 
 
451 aa  288  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  38.78 
 
 
465 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  39.49 
 
 
459 aa  278  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  38.55 
 
 
465 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  38.55 
 
 
465 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  41.73 
 
 
496 aa  268  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  37.36 
 
 
535 aa  264  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  36.12 
 
 
512 aa  256  7e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  39.03 
 
 
437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  36.82 
 
 
467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  41.13 
 
 
406 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  35.45 
 
 
453 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  35.67 
 
 
448 aa  246  8e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  36.32 
 
 
453 aa  243  5e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  35.96 
 
 
445 aa  242  9e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  35.67 
 
 
476 aa  241  2e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  37.44 
 
 
448 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1484  hypothetical protein  36.32 
 
 
418 aa  241  2.9999999999999997e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.555419  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  36.07 
 
 
448 aa  240  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  36.55 
 
 
453 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  36.55 
 
 
453 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  36.55 
 
 
453 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  37.66 
 
 
451 aa  232  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  37.14 
 
 
460 aa  229  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  37.21 
 
 
452 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  36.12 
 
 
446 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>