More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2228 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  100 
 
 
406 aa  828    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  39.64 
 
 
452 aa  310  4e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  41.13 
 
 
455 aa  278  9e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  39.15 
 
 
440 aa  270  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  39.64 
 
 
475 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  37.53 
 
 
456 aa  266  5e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  38.62 
 
 
456 aa  263  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  39.05 
 
 
451 aa  261  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  37.08 
 
 
453 aa  260  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  42.6 
 
 
458 aa  259  6e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  39.35 
 
 
455 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  37.24 
 
 
453 aa  256  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  39.28 
 
 
448 aa  249  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  40.97 
 
 
459 aa  249  6e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  37.61 
 
 
463 aa  247  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  34.76 
 
 
456 aa  247  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  38.27 
 
 
448 aa  246  6e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  34.18 
 
 
463 aa  243  5e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  34.33 
 
 
460 aa  241  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  38.02 
 
 
462 aa  241  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  35.45 
 
 
459 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  37.37 
 
 
452 aa  239  8e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  39.33 
 
 
465 aa  238  1e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  36.41 
 
 
468 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  34.73 
 
 
458 aa  237  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  37.57 
 
 
456 aa  237  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  40.05 
 
 
451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  38.61 
 
 
467 aa  233  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  38.57 
 
 
496 aa  233  7.000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  36.56 
 
 
453 aa  231  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  37.89 
 
 
465 aa  230  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  36.68 
 
 
461 aa  229  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  36.09 
 
 
451 aa  229  1e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  35.09 
 
 
470 aa  226  8e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  37.61 
 
 
457 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  38.65 
 
 
460 aa  223  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  35.22 
 
 
437 aa  223  7e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  35.68 
 
 
462 aa  219  7.999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  36.46 
 
 
468 aa  218  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  36.72 
 
 
460 aa  219  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  34.62 
 
 
465 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  37.08 
 
 
470 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  33.76 
 
 
471 aa  216  4e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  34.26 
 
 
469 aa  215  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  37.34 
 
 
457 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1484  hypothetical protein  36.87 
 
 
418 aa  215  9.999999999999999e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.555419  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  35.98 
 
 
462 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  36.78 
 
 
481 aa  215  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  37.07 
 
 
469 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  36.83 
 
 
457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  37.38 
 
 
460 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  36.73 
 
 
463 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  36.12 
 
 
468 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  36.49 
 
 
462 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  37.04 
 
 
457 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  34.45 
 
 
460 aa  211  2e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  35.97 
 
 
467 aa  210  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  35.66 
 
 
468 aa  209  6e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  35.79 
 
 
456 aa  209  9e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  37.33 
 
 
464 aa  208  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  32.65 
 
 
484 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  33.67 
 
 
485 aa  208  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  34.61 
 
 
464 aa  208  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  34.43 
 
 
471 aa  207  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  34.43 
 
 
471 aa  207  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  37.54 
 
 
474 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  34.54 
 
 
462 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  36.13 
 
 
468 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.51 
 
 
445 aa  203  5e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  34.06 
 
 
461 aa  202  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  35.98 
 
 
458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1719  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  32.89 
 
 
448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  34.26 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  33.42 
 
 
472 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  36.19 
 
 
468 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  30.71 
 
 
450 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  36.01 
 
 
468 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  36.21 
 
 
468 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  34.46 
 
 
458 aa  196  9e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  34.45 
 
 
461 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  34.45 
 
 
461 aa  194  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  35.13 
 
 
463 aa  193  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  33.67 
 
 
461 aa  193  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  33.76 
 
 
488 aa  190  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  34.7 
 
 
479 aa  190  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  34.29 
 
 
459 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  34.45 
 
 
468 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4109  peptidase M20  31.39 
 
 
450 aa  180  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.720688 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  33.62 
 
 
467 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0916  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.57 
 
 
521 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  32.28 
 
 
465 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  32.28 
 
 
465 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  32.36 
 
 
465 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  30.95 
 
 
476 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  29.58 
 
 
512 aa  173  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2145  peptidase M20  35.04 
 
 
470 aa  172  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0790004  normal  0.0404303 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  31.49 
 
 
535 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  30.75 
 
 
508 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  34.55 
 
 
445 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1640  hypothetical protein  27.95 
 
 
458 aa  161  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>