More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0813 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  100 
 
 
463 aa  947    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  50.11 
 
 
456 aa  478  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  52.74 
 
 
455 aa  456  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  52.11 
 
 
458 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  46.91 
 
 
440 aa  419  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  47.03 
 
 
453 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  45.11 
 
 
453 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  44.27 
 
 
456 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  44.52 
 
 
459 aa  399  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  45.23 
 
 
451 aa  395  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  47.38 
 
 
475 aa  398  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  46.07 
 
 
456 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  46.67 
 
 
456 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  44.98 
 
 
458 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  45.17 
 
 
460 aa  392  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  45.09 
 
 
455 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  46.68 
 
 
462 aa  385  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  43.46 
 
 
463 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  45.2 
 
 
467 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  43.99 
 
 
474 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  45.84 
 
 
459 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  45.27 
 
 
456 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  42.28 
 
 
452 aa  363  4e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  43.53 
 
 
461 aa  363  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  42.35 
 
 
460 aa  362  6e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  43.46 
 
 
485 aa  361  1e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  44.28 
 
 
460 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  44.02 
 
 
465 aa  357  1.9999999999999998e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  42.89 
 
 
461 aa  356  5e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  40.34 
 
 
484 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  43.63 
 
 
460 aa  353  4e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  42.89 
 
 
461 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  42.67 
 
 
461 aa  350  4e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  42.89 
 
 
468 aa  345  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  42.05 
 
 
468 aa  342  7e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  42.05 
 
 
461 aa  342  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  40.65 
 
 
458 aa  341  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  43.88 
 
 
464 aa  340  4e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  41.56 
 
 
457 aa  339  5e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  43.21 
 
 
461 aa  339  5e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  41.59 
 
 
462 aa  335  7e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  41.39 
 
 
469 aa  335  9e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  41.94 
 
 
469 aa  333  3e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  40.42 
 
 
471 aa  332  6e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  40.52 
 
 
470 aa  331  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  41.09 
 
 
457 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  40.4 
 
 
457 aa  331  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  39.13 
 
 
465 aa  331  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  39.22 
 
 
465 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  40.86 
 
 
471 aa  330  3e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  40.86 
 
 
471 aa  330  3e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  41.39 
 
 
460 aa  330  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  41 
 
 
470 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  42.11 
 
 
458 aa  324  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  38.56 
 
 
462 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  40.78 
 
 
457 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  39.26 
 
 
468 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  37.85 
 
 
468 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  41.32 
 
 
472 aa  320  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  39.48 
 
 
468 aa  320  5e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  39.87 
 
 
462 aa  319  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  38.56 
 
 
462 aa  319  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  39.91 
 
 
488 aa  318  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  40.36 
 
 
463 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  39.48 
 
 
468 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  39.06 
 
 
463 aa  317  4e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  39.27 
 
 
467 aa  316  5e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  39.87 
 
 
464 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  38.18 
 
 
468 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  38.26 
 
 
468 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  41.61 
 
 
481 aa  297  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  35.23 
 
 
452 aa  290  3e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  38.04 
 
 
468 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  37.5 
 
 
465 aa  280  6e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  37.5 
 
 
465 aa  280  6e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  37.28 
 
 
465 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  36.66 
 
 
467 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  37.19 
 
 
479 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  34.87 
 
 
512 aa  263  4.999999999999999e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  36.44 
 
 
448 aa  259  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  35.67 
 
 
496 aa  250  5e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  35.78 
 
 
448 aa  247  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  35.18 
 
 
451 aa  246  4.9999999999999997e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  32.07 
 
 
476 aa  246  6.999999999999999e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  34.23 
 
 
535 aa  246  8e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  35.65 
 
 
459 aa  233  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  34.18 
 
 
437 aa  231  3e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  37.61 
 
 
406 aa  226  6e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  34.32 
 
 
453 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  35.43 
 
 
451 aa  221  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78234  Glutamate carboxypeptidase-like protein  32.22 
 
 
481 aa  218  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  33.7 
 
 
445 aa  216  5.9999999999999996e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4109  peptidase M20  31.95 
 
 
450 aa  215  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.720688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  32.88 
 
 
453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1484  hypothetical protein  31.52 
 
 
418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.555419  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  33.33 
 
 
448 aa  212  9e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  31.86 
 
 
446 aa  212  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  33.7 
 
 
484 aa  211  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  35 
 
 
476 aa  211  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  34.84 
 
 
460 aa  210  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>