More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_78234 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_78234  Glutamate carboxypeptidase-like protein  100 
 
 		 481 aa  985    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  59.62 
 
 		 535 aa  582  1.0000000000000001e-165  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  53.7 
 
 		 476 aa  500  1e-140  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  49.59 
 
 		 512 aa  459  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  32.56 
 
 		 458 aa  237  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  34.56 
 
 		 453 aa  237  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04170  conserved hypothetical protein  33.77 
 
 		 988 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  34.13 
 
 		 440 aa  232  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  31.62 
 
 		 456 aa  232  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  35.28 
 
 		 456 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  33.26 
 
 		 456 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  33.33 
 
 		 451 aa  223  7e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66365  Metalloexopeptidase  33.63 
 
 		 977 aa  222  9.999999999999999e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.203014  normal  0.591866 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  32.14 
 
 		 461 aa  220  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  33.85 
 
 		 455 aa  218  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  32.22 
 
 		 463 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  33.19 
 
 		 460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  31.24 
 
 		 461 aa  214  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  33.62 
 
 		 459 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  30.62 
 
 		 459 aa  212  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  29.35 
 
 		 465 aa  212  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  31.48 
 
 		 453 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.36 
 
 		 463 aa  211  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  31.39 
 
 		 460 aa  211  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  32.89 
 
 		 465 aa  210  4e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  31.67 
 
 		 460 aa  210  4e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  31 
 
 		 467 aa  209  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  31.67 
 
 		 458 aa  207  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  30.65 
 
 		 462 aa  207  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  30.5 
 
 		 460 aa  203  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  31.43 
 
 		 485 aa  202  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  31.28 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  32.2 
 
 		 461 aa  201  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  33.33 
 
 		 460 aa  201  3e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  31.19 
 
 		 461 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  31.33 
 
 		 461 aa  196  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  31.33 
 
 		 461 aa  194  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  30.94 
 
 		 458 aa  193  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  29.08 
 
 		 474 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.69 
 
 		 456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  29.16 
 
 		 455 aa  190  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  29.54 
 
 		 458 aa  190  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  32.31 
 
 		 456 aa  189  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.57 
 
 		 475 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  28.69 
 
 		 470 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  29.49 
 
 		 469 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  28.69 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  27.88 
 
 		 468 aa  187  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  28.94 
 
 		 463 aa  186  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  30 
 
 		 462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  28.6 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  29.4 
 
 		 471 aa  183  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  29.4 
 
 		 471 aa  183  6e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  29.6 
 
 		 468 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  29.5 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  27.6 
 
 		 484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  28.9 
 
 		 468 aa  180  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  29.7 
 
 		 464 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  28.95 
 
 		 463 aa  180  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01879  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G04360)  34 
 
 		 980 aa  179  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.747659 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  29.8 
 
 		 462 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  28.48 
 
 		 469 aa  179  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  29.01 
 
 		 465 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  31.01 
 
 		 457 aa  176  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  28.69 
 
 		 468 aa  176  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  28.6 
 
 		 462 aa  176  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  27.95 
 
 		 468 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  28.92 
 
 		 470 aa  174  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  26.95 
 
 		 471 aa  173  6.999999999999999e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  29.77 
 
 		 457 aa  172  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  28.63 
 
 		 468 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  29.89 
 
 		 472 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  27.98 
 
 		 467 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  27.65 
 
 		 468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  27.81 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  28.44 
 
 		 468 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  27.46 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  29.31 
 
 		 479 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  30.08 
 
 		 437 aa  150  6e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  28.14 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  27.19 
 
 		 488 aa  148  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  26.78 
 
 		 465 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  26.78 
 
 		 465 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  26.78 
 
 		 465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  27.49 
 
 		 470 aa  146  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  26.41 
 
 		 467 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  27.35 
 
 		 453 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  27.35 
 
 		 453 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  27.35 
 
 		 453 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  28.92 
 
 		 481 aa  140  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  26.74 
 
 		 496 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1640  hypothetical protein  27.14 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.66 
 
 		 445 aa  134  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  28.01 
 
 		 455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  25.1 
 
 		 544 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  25.1 
 
 		 497 aa  133  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  27.65 
 
 		 484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1719  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  29.72 
 
 		 448 aa  132  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  27.25 
 
 		 453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  29.5 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>