More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_66365 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_66365  Metalloexopeptidase  100 
 
 
977 aa  2012    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.203014  normal  0.591866 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01879  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G04360)  32.72 
 
 
980 aa  415  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.747659 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04170  conserved hypothetical protein  31.61 
 
 
988 aa  389  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  34.65 
 
 
512 aa  246  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78234  Glutamate carboxypeptidase-like protein  33.63 
 
 
481 aa  222  3e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  34.52 
 
 
535 aa  218  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  31.69 
 
 
476 aa  216  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  29.72 
 
 
456 aa  191  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  31.82 
 
 
456 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  30.02 
 
 
458 aa  181  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  30.54 
 
 
465 aa  179  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  30 
 
 
459 aa  179  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  30.7 
 
 
467 aa  176  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  30.05 
 
 
456 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  29.89 
 
 
458 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  30.52 
 
 
440 aa  174  7.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  29.67 
 
 
455 aa  172  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  27.85 
 
 
451 aa  166  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  30.02 
 
 
474 aa  166  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  28.44 
 
 
462 aa  162  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  28.83 
 
 
465 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  28.83 
 
 
465 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  28.83 
 
 
465 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  29.25 
 
 
453 aa  157  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  27.52 
 
 
467 aa  157  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  28.6 
 
 
463 aa  155  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  28.29 
 
 
460 aa  155  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  27.86 
 
 
457 aa  154  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  29.01 
 
 
455 aa  153  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  26.57 
 
 
465 aa  152  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  31.21 
 
 
460 aa  151  7e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.02 
 
 
456 aa  151  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  28.41 
 
 
457 aa  150  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  29.17 
 
 
452 aa  150  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.89 
 
 
475 aa  147  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  25.57 
 
 
453 aa  146  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  28.14 
 
 
458 aa  140  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  27.85 
 
 
461 aa  139  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  27.29 
 
 
469 aa  138  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  27.53 
 
 
468 aa  137  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  26.33 
 
 
452 aa  137  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  26.75 
 
 
472 aa  137  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  26.84 
 
 
459 aa  135  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  27.57 
 
 
437 aa  134  6.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  29.05 
 
 
451 aa  133  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  27.88 
 
 
464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  27.77 
 
 
460 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  27.88 
 
 
484 aa  130  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.59 
 
 
463 aa  129  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  27.19 
 
 
453 aa  129  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  27.78 
 
 
455 aa  128  4.0000000000000003e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  30.09 
 
 
453 aa  128  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  28.04 
 
 
468 aa  127  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  30.65 
 
 
476 aa  127  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  26.5 
 
 
463 aa  126  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  26.36 
 
 
456 aa  126  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  27.84 
 
 
468 aa  126  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  27.44 
 
 
469 aa  126  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  27.55 
 
 
462 aa  126  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  26.96 
 
 
448 aa  126  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  28.38 
 
 
469 aa  125  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  26.61 
 
 
455 aa  124  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  26.49 
 
 
462 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  26.05 
 
 
462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  27.45 
 
 
455 aa  121  7.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  28.44 
 
 
464 aa  120  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  26.21 
 
 
461 aa  120  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  27.47 
 
 
471 aa  120  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  24.78 
 
 
479 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  26.33 
 
 
472 aa  119  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  27.27 
 
 
468 aa  119  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  26.28 
 
 
445 aa  119  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  28.13 
 
 
468 aa  119  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  27.29 
 
 
471 aa  118  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  27.29 
 
 
471 aa  118  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  26.34 
 
 
448 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  27.72 
 
 
468 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  26.97 
 
 
485 aa  117  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  28.41 
 
 
460 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  25.11 
 
 
488 aa  116  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  26.42 
 
 
469 aa  116  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  26.57 
 
 
452 aa  114  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  28.04 
 
 
468 aa  114  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1640  hypothetical protein  26.4 
 
 
458 aa  114  9e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  27.44 
 
 
464 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  27.93 
 
 
484 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  26.3 
 
 
450 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  25.17 
 
 
464 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  25.68 
 
 
496 aa  113  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  26.13 
 
 
462 aa  112  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  28.1 
 
 
468 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  27.6 
 
 
470 aa  112  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  25.82 
 
 
465 aa  112  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.45 
 
 
445 aa  111  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  27.32 
 
 
488 aa  111  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  24.83 
 
 
463 aa  111  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  25.87 
 
 
453 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1719  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  26.46 
 
 
448 aa  110  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  25.87 
 
 
453 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  24.5 
 
 
460 aa  109  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>