More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3741 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  66.52 
 
 		 463 aa  640    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  75.5 
 
 		 453 aa  730    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  70.42 
 
 		 456 aa  678    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  67.84 
 
 		 460 aa  643    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  100 
 
 		 453 aa  931    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  68 
 
 		 459 aa  643    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  69.25 
 
 		 456 aa  657    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  64.71 
 
 		 485 aa  602  1.0000000000000001e-171  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  58.46 
 
 		 460 aa  553  1e-156  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  55.58 
 
 		 451 aa  522  1e-147  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  53.35 
 
 		 458 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  51.96 
 
 		 455 aa  461  1e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  51.26 
 
 		 440 aa  454  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  47.96 
 
 		 456 aa  442  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  46.92 
 
 		 475 aa  421  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  46.36 
 
 		 456 aa  420  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  46.33 
 
 		 455 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  44.84 
 
 		 462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  45.11 
 
 		 463 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  46.41 
 
 		 459 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  42.43 
 
 		 452 aa  364  2e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  43.47 
 
 		 461 aa  359  6e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  40.48 
 
 		 468 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  42.11 
 
 		 467 aa  351  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  41.39 
 
 		 456 aa  350  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  38.88 
 
 		 465 aa  349  6e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  40.83 
 
 		 464 aa  347  3e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  43.27 
 
 		 460 aa  346  6e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  38.78 
 
 		 458 aa  345  8e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  42.29 
 
 		 465 aa  345  1e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  42.76 
 
 		 460 aa  345  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  43.38 
 
 		 467 aa  343  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  39.07 
 
 		 458 aa  341  1e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  42.92 
 
 		 461 aa  341  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  44.06 
 
 		 468 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  41.15 
 
 		 474 aa  336  5e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  40.88 
 
 		 468 aa  332  6e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  41.84 
 
 		 463 aa  332  8e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  40.95 
 
 		 461 aa  332  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  42.53 
 
 		 462 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  41.53 
 
 		 460 aa  330  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  42.53 
 
 		 462 aa  329  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  39.47 
 
 		 457 aa  328  8e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  40.66 
 
 		 468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  41.5 
 
 		 458 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  41.32 
 
 		 461 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  41.91 
 
 		 468 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  37.63 
 
 		 472 aa  326  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  41.32 
 
 		 461 aa  326  5e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  40.18 
 
 		 468 aa  325  9e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  41.07 
 
 		 464 aa  324  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  42.03 
 
 		 457 aa  323  5e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  38.62 
 
 		 469 aa  323  5e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  40.7 
 
 		 462 aa  322  8e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  39.31 
 
 		 481 aa  322  9.000000000000001e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  41.91 
 
 		 468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  40.69 
 
 		 461 aa  320  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  43.19 
 
 		 468 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  41.97 
 
 		 462 aa  319  7e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  38.55 
 
 		 484 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  40.82 
 
 		 469 aa  318  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  40.18 
 
 		 488 aa  317  3e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  37.94 
 
 		 470 aa  317  3e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  40.36 
 
 		 471 aa  316  7e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  40.32 
 
 		 470 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  41.76 
 
 		 457 aa  313  3.9999999999999997e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  40 
 
 		 471 aa  312  5.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  40 
 
 		 471 aa  312  5.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  37.25 
 
 		 465 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  40.32 
 
 		 457 aa  312  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  40 
 
 		 463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  38.62 
 
 		 468 aa  305  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  35.36 
 
 		 479 aa  282  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  37.58 
 
 		 496 aa  281  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  35.11 
 
 		 465 aa  276  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  35.52 
 
 		 452 aa  276  7e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  34.67 
 
 		 465 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  34.67 
 
 		 465 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  34.29 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  35.6 
 
 		 448 aa  256  4e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  35.7 
 
 		 448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  35.96 
 
 		 451 aa  249  5e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  36.7 
 
 		 459 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  34.99 
 
 		 437 aa  239  5e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  32.69 
 
 		 476 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  33.49 
 
 		 450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  37.08 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  33.92 
 
 		 451 aa  231  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  32.25 
 
 		 453 aa  229  7e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  30.64 
 
 		 512 aa  228  1e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1484  hypothetical protein  35.51 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.555419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  34.55 
 
 		 445 aa  223  7e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  33.41 
 
 		 460 aa  223  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  32.9 
 
 		 535 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  33.49 
 
 		 453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  33.49 
 
 		 453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  33.49 
 
 		 453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  32.95 
 
 		 452 aa  219  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  32.18 
 
 		 470 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  32.07 
 
 		 484 aa  213  7.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>