More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1074 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  76.77 
 
 		 467 aa  716    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  100 
 
 		 474 aa  963    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  46.31 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  44.94 
 
 		 456 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  43.99 
 
 		 463 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  46.49 
 
 		 440 aa  385  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  45.04 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  43.68 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  45.79 
 
 		 455 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  41.45 
 
 		 459 aa  364  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  44.05 
 
 		 456 aa  363  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  45.27 
 
 		 456 aa  361  1e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  43.61 
 
 		 475 aa  356  5e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  40.83 
 
 		 456 aa  354  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  41.15 
 
 		 453 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  42.32 
 
 		 455 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  43.65 
 
 		 464 aa  346  6e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  40.72 
 
 		 460 aa  343  4e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  43.23 
 
 		 469 aa  343  5e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  38.85 
 
 		 463 aa  342  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  41.59 
 
 		 457 aa  341  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  40.55 
 
 		 456 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  39.35 
 
 		 460 aa  339  5.9999999999999996e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  40.95 
 
 		 458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  41.67 
 
 		 458 aa  333  4e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  40.3 
 
 		 472 aa  332  9e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  41.65 
 
 		 452 aa  332  1e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  38.36 
 
 		 459 aa  326  5e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  36.59 
 
 		 451 aa  315  9.999999999999999e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  37.15 
 
 		 469 aa  315  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  38.21 
 
 		 485 aa  315  9.999999999999999e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  37.31 
 
 		 471 aa  311  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  37.31 
 
 		 471 aa  311  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  38.28 
 
 		 468 aa  311  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  39.73 
 
 		 465 aa  311  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  40.65 
 
 		 460 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  37.42 
 
 		 468 aa  310  4e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  39.27 
 
 		 462 aa  308  9e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  43.08 
 
 		 481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  38.31 
 
 		 471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  37.17 
 
 		 461 aa  306  7e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  37.9 
 
 		 465 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  39.25 
 
 		 461 aa  305  9.000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  39.05 
 
 		 479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  39.13 
 
 		 458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  39.6 
 
 		 465 aa  302  7.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  40.13 
 
 		 460 aa  302  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  38.26 
 
 		 461 aa  301  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  39.22 
 
 		 461 aa  301  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  38.9 
 
 		 468 aa  298  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  39.82 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  37.86 
 
 		 468 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  39.19 
 
 		 464 aa  298  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  36.85 
 
 		 467 aa  296  7e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  39.39 
 
 		 457 aa  296  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  36.44 
 
 		 462 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  38.63 
 
 		 488 aa  294  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  39.39 
 
 		 461 aa  294  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  39.18 
 
 		 461 aa  292  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  37.93 
 
 		 468 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  39.1 
 
 		 457 aa  289  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  36.75 
 
 		 462 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  36.4 
 
 		 462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  39.6 
 
 		 468 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  36.5 
 
 		 470 aa  283  5.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  36.82 
 
 		 460 aa  282  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  36.58 
 
 		 468 aa  279  9e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  36.56 
 
 		 468 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  34.89 
 
 		 484 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  35.57 
 
 		 463 aa  276  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  36.21 
 
 		 463 aa  276  6e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  36.22 
 
 		 468 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  36.4 
 
 		 457 aa  262  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  32.38 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  35.51 
 
 		 451 aa  247  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  34.72 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  34.57 
 
 		 448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  31.21 
 
 		 476 aa  231  2e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  32.68 
 
 		 465 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  32.63 
 
 		 496 aa  226  6e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  32.46 
 
 		 465 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  32.46 
 
 		 465 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  35.6 
 
 		 451 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.922328 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  31.24 
 
 		 535 aa  222  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  34.22 
 
 		 453 aa  219  7.999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  28.66 
 
 		 512 aa  217  4e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  32.96 
 
 		 459 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  31.22 
 
 		 467 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78234  Glutamate carboxypeptidase-like protein  29.08 
 
 		 481 aa  208  1e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  27.95 
 
 		 450 aa  203  5e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  30.91 
 
 		 437 aa  201  3e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1719  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  30.75 
 
 		 448 aa  200  5e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  35.25 
 
 		 488 aa  196  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1484  hypothetical protein  32.54 
 
 		 418 aa  196  9e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.555419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  33.18 
 
 		 445 aa  193  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  37.54 
 
 		 406 aa  192  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04170  conserved hypothetical protein  30.82 
 
 		 988 aa  191  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  31.96 
 
 		 453 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  31.96 
 
 		 453 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  31.96 
 
 		 453 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>