More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2132 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  100 
 
 		 458 aa  933    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  55.33 
 
 		 459 aa  514  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  53.35 
 
 		 453 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  53.14 
 
 		 456 aa  499  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  53.69 
 
 		 453 aa  497  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  53.64 
 
 		 456 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  53.29 
 
 		 460 aa  489  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  55.02 
 
 		 440 aa  482  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  54.65 
 
 		 456 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  52.52 
 
 		 463 aa  478  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  52.24 
 
 		 451 aa  474  1e-132  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  52.11 
 
 		 463 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  51.66 
 
 		 460 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  53.57 
 
 		 485 aa  463  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  53.42 
 
 		 455 aa  462  1e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  51.52 
 
 		 458 aa  451  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  49.01 
 
 		 456 aa  444  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  48.34 
 
 		 475 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  49.42 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  47.48 
 
 		 459 aa  420  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  46.59 
 
 		 467 aa  415  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  46.44 
 
 		 455 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  47.25 
 
 		 469 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  46.31 
 
 		 474 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  47.67 
 
 		 465 aa  396  1e-109  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  47.14 
 
 		 458 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  47.57 
 
 		 464 aa  396  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  43.35 
 
 		 457 aa  397  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  46.83 
 
 		 461 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  44.03 
 
 		 468 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  46.56 
 
 		 464 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  45.89 
 
 		 472 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  46 
 
 		 460 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  45.52 
 
 		 452 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  45.35 
 
 		 458 aa  388  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  45.7 
 
 		 462 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  46.05 
 
 		 462 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  44.89 
 
 		 460 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  43.86 
 
 		 468 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  45.05 
 
 		 462 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  43.38 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  44.71 
 
 		 468 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  43.6 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  44.37 
 
 		 463 aa  381  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  46.1 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  47.4 
 
 		 481 aa  375  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  44.37 
 
 		 468 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  43.18 
 
 		 465 aa  375  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  42.12 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  44.03 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  44.37 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  44.13 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  44.2 
 
 		 469 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  45.05 
 
 		 461 aa  375  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  44.03 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  45.81 
 
 		 470 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  44.27 
 
 		 470 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  44.03 
 
 		 468 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  45.39 
 
 		 461 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  45.59 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  44.52 
 
 		 463 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  44.49 
 
 		 457 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  45.59 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  45.59 
 
 		 457 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  44.52 
 
 		 456 aa  364  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  42.16 
 
 		 465 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  45.48 
 
 		 468 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  42.83 
 
 		 462 aa  359  5e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  45.15 
 
 		 460 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  39.52 
 
 		 484 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  44.23 
 
 		 488 aa  348  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  43.3 
 
 		 457 aa  332  6e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  43.02 
 
 		 479 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  40.44 
 
 		 465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  40 
 
 		 465 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  40 
 
 		 465 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  39.02 
 
 		 467 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  35.96 
 
 		 452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  34.32 
 
 		 512 aa  274  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  38.24 
 
 		 451 aa  273  4.0000000000000004e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  37.95 
 
 		 496 aa  271  1e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  35.06 
 
 		 476 aa  266  5.999999999999999e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  36.28 
 
 		 448 aa  263  6e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  36.24 
 
 		 459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  34.48 
 
 		 535 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  34.73 
 
 		 448 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  35.28 
 
 		 453 aa  248  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78234  Glutamate carboxypeptidase-like protein  32.56 
 
 		 481 aa  245  9.999999999999999e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  36.38 
 
 		 437 aa  237  3e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  30.18 
 
 		 450 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  35.29 
 
 		 484 aa  236  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  38.27 
 
 		 406 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  34.85 
 
 		 453 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  34.85 
 
 		 453 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  34.85 
 
 		 453 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  35.96 
 
 		 469 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  36.18 
 
 		 452 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  34.65 
 
 		 476 aa  223  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  32.97 
 
 		 451 aa  222  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  34.25 
 
 		 470 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>