More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2534 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  81.31 
 
 
453 aa  705    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  81.31 
 
 
453 aa  705    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  81.31 
 
 
453 aa  705    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  90.49 
 
 
460 aa  777    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  80.42 
 
 
470 aa  685    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  889    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  63.09 
 
 
445 aa  526  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  58.41 
 
 
453 aa  472  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  57.5 
 
 
448 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  55.06 
 
 
445 aa  461  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  56.51 
 
 
455 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  54.61 
 
 
484 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  55.96 
 
 
472 aa  435  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  56.28 
 
 
447 aa  430  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  55.48 
 
 
456 aa  430  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  53.05 
 
 
469 aa  415  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  54.13 
 
 
464 aa  416  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  56.91 
 
 
464 aa  415  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  54.16 
 
 
469 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  51.44 
 
 
476 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  52.09 
 
 
488 aa  402  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  55.15 
 
 
460 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  47.92 
 
 
446 aa  350  3e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  43.62 
 
 
467 aa  341  2e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  42.82 
 
 
453 aa  331  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  44.68 
 
 
455 aa  329  7e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  42.7 
 
 
455 aa  326  5e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  46.56 
 
 
448 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  43.27 
 
 
449 aa  313  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  43.43 
 
 
449 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  41.1 
 
 
467 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1926  peptidase M20  41.56 
 
 
447 aa  287  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  41.22 
 
 
465 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  41.22 
 
 
465 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  40.98 
 
 
465 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1438  peptidase M20  39.95 
 
 
457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368913  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3706  peptidase M20  43.67 
 
 
455 aa  260  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114919  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  37.38 
 
 
453 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  36.84 
 
 
455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  37.25 
 
 
469 aa  227  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  34.4 
 
 
456 aa  227  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  34.47 
 
 
458 aa  226  9e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  31.95 
 
 
453 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  33.94 
 
 
465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  34.83 
 
 
462 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  35.14 
 
 
465 aa  219  8.999999999999998e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.68 
 
 
475 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  33.33 
 
 
456 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  34.42 
 
 
440 aa  215  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.89 
 
 
456 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  34.75 
 
 
458 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  33.11 
 
 
452 aa  210  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  32.42 
 
 
460 aa  209  7e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  32.89 
 
 
457 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  33.17 
 
 
456 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  32.27 
 
 
459 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  33.71 
 
 
463 aa  209  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  33.48 
 
 
455 aa  207  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  32.59 
 
 
465 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  34.47 
 
 
485 aa  206  9e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  37.13 
 
 
464 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  34.84 
 
 
472 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  34.22 
 
 
462 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  35.33 
 
 
479 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  32.76 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.22 
 
 
463 aa  201  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  33.19 
 
 
470 aa  200  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  31.91 
 
 
471 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  32.18 
 
 
459 aa  199  7e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  32.89 
 
 
458 aa  199  7.999999999999999e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  34.01 
 
 
460 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  32.96 
 
 
462 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  32.59 
 
 
471 aa  196  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  32.9 
 
 
469 aa  196  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  32.59 
 
 
471 aa  196  7e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  33.26 
 
 
468 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  32.28 
 
 
462 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  33.26 
 
 
461 aa  194  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  32.8 
 
 
461 aa  193  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  32.15 
 
 
462 aa  193  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  31.91 
 
 
451 aa  190  4e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  31.07 
 
 
461 aa  190  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  31.59 
 
 
461 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  31.67 
 
 
463 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  32.19 
 
 
461 aa  186  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  33.48 
 
 
464 aa  186  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  32.19 
 
 
461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  33.11 
 
 
460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  31.89 
 
 
470 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  31.2 
 
 
468 aa  184  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  31.89 
 
 
457 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  30.89 
 
 
458 aa  183  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  30.65 
 
 
460 aa  182  7e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  29.86 
 
 
484 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  31.02 
 
 
457 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  29.81 
 
 
468 aa  179  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  30.08 
 
 
467 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  30.34 
 
 
468 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  31.17 
 
 
468 aa  176  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  31.09 
 
 
474 aa  176  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>