More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4319 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  871    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  65.31 
 
 		 453 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  65.31 
 
 		 453 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  65.31 
 
 		 453 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  62.01 
 
 		 448 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  61.68 
 
 		 453 aa  514  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  61.63 
 
 		 460 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  60.54 
 
 		 455 aa  498  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  62.73 
 
 		 452 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  61.56 
 
 		 470 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  60.09 
 
 		 460 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  58.82 
 
 		 456 aa  468  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  56.73 
 
 		 445 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  58.2 
 
 		 447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  57.47 
 
 		 472 aa  448  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  56.84 
 
 		 464 aa  429  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  54.44 
 
 		 469 aa  429  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  56.38 
 
 		 464 aa  429  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  52.32 
 
 		 484 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  54.77 
 
 		 469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  50 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  52.34 
 
 		 488 aa  391  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  45.9 
 
 		 455 aa  347  2e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  44.55 
 
 		 446 aa  344  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  42.79 
 
 		 455 aa  337  3.9999999999999995e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  43.02 
 
 		 467 aa  336  5e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  43.24 
 
 		 448 aa  318  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  40.41 
 
 		 453 aa  305  7e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  40.64 
 
 		 467 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  41.36 
 
 		 465 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  41.36 
 
 		 465 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  41.14 
 
 		 465 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  40.04 
 
 		 449 aa  292  8e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1926  peptidase M20  42.08 
 
 		 447 aa  286  5.999999999999999e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1438  peptidase M20  41.04 
 
 		 457 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  40.53 
 
 		 449 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3706  peptidase M20  43.52 
 
 		 455 aa  265  8.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114919  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  35.96 
 
 		 455 aa  242  9e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  35.28 
 
 		 465 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  34.38 
 
 		 456 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  34.4 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  35.21 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  34.23 
 
 		 453 aa  219  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  32.46 
 
 		 456 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  34.52 
 
 		 462 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  34.44 
 
 		 465 aa  211  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  34.55 
 
 		 460 aa  211  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  34.06 
 
 		 458 aa  211  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  34.23 
 
 		 456 aa  210  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  33.64 
 
 		 440 aa  210  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.71 
 
 		 475 aa  210  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  35.98 
 
 		 469 aa  210  5e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  34.34 
 
 		 460 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.04 
 
 		 463 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  33.11 
 
 		 459 aa  207  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  32.79 
 
 		 453 aa  207  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  32.74 
 
 		 484 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  35.32 
 
 		 472 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  32.65 
 
 		 459 aa  205  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  32.81 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  31.77 
 
 		 468 aa  201  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  33.57 
 
 		 456 aa  199  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  31.25 
 
 		 467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  31.41 
 
 		 460 aa  197  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  33.03 
 
 		 463 aa  197  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  31.79 
 
 		 461 aa  197  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  32.53 
 
 		 468 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  32.6 
 
 		 461 aa  194  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  31.3 
 
 		 458 aa  193  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  34.02 
 
 		 468 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  31.6 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  31.6 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  33.33 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  33.18 
 
 		 474 aa  190  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  34.35 
 
 		 485 aa  190  4e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  32.56 
 
 		 470 aa  190  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  31.66 
 
 		 468 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  31.03 
 
 		 468 aa  189  8e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  30.72 
 
 		 465 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  31.75 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  30.77 
 
 		 468 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  31.32 
 
 		 468 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  32.27 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  30.98 
 
 		 461 aa  186  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  31.75 
 
 		 457 aa  186  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  28.51 
 
 		 471 aa  186  9e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  30.32 
 
 		 461 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  36.97 
 
 		 496 aa  182  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  31.36 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  33.26 
 
 		 488 aa  182  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  33.18 
 
 		 456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  32.98 
 
 		 468 aa  180  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  30.13 
 
 		 469 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  30.61 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  32.17 
 
 		 467 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  30.13 
 
 		 462 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  29.87 
 
 		 471 aa  176  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  29.87 
 
 		 471 aa  176  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  30.07 
 
 		 463 aa  176  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  32.26 
 
 		 451 aa  176  8e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>