More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1407 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  67.4 
 
 		 460 aa  649    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  74.56 
 
 		 456 aa  714    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  69.25 
 
 		 453 aa  671    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  68.11 
 
 		 463 aa  648    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  68.67 
 
 		 453 aa  643    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  100 
 
 		 456 aa  944    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  64.94 
 
 		 485 aa  613  9.999999999999999e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  65.77 
 
 		 459 aa  610  1e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  57.58 
 
 		 460 aa  538  9.999999999999999e-153  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  57.27 
 
 		 451 aa  528  1e-149  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  54.65 
 
 		 458 aa  479  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  52.08 
 
 		 456 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  50.68 
 
 		 440 aa  450  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  49.09 
 
 		 455 aa  442  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  48.02 
 
 		 475 aa  435  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  48.53 
 
 		 456 aa  436  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  47.02 
 
 		 462 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  46.38 
 
 		 455 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  46.67 
 
 		 463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  46.62 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  45.68 
 
 		 461 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  44.06 
 
 		 452 aa  377  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  39.82 
 
 		 465 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  44.34 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  42.63 
 
 		 467 aa  362  7.0000000000000005e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  44.32 
 
 		 456 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  45.27 
 
 		 465 aa  360  4e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  41.02 
 
 		 458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  41.91 
 
 		 464 aa  355  1e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  43.84 
 
 		 460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  43.41 
 
 		 461 aa  350  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  43.75 
 
 		 462 aa  345  7e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  40.22 
 
 		 469 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  40.86 
 
 		 468 aa  344  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  43.2 
 
 		 467 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  41.63 
 
 		 460 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  41.89 
 
 		 457 aa  343  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  42.73 
 
 		 457 aa  342  7e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  41.82 
 
 		 460 aa  342  9e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  42.56 
 
 		 470 aa  339  8e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  39.61 
 
 		 472 aa  338  9e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  44.67 
 
 		 468 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  42.53 
 
 		 462 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  43.05 
 
 		 461 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  42.63 
 
 		 461 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  43.05 
 
 		 461 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  41.3 
 
 		 468 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  41.09 
 
 		 468 aa  335  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  43.12 
 
 		 463 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  42.53 
 
 		 462 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  42.92 
 
 		 469 aa  334  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  42.33 
 
 		 457 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  39.74 
 
 		 470 aa  331  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  42.32 
 
 		 468 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  43.13 
 
 		 468 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  42.31 
 
 		 471 aa  329  8e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  42.31 
 
 		 471 aa  329  8e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  40.4 
 
 		 474 aa  328  9e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  41.35 
 
 		 488 aa  326  6e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  42.44 
 
 		 457 aa  325  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  40.69 
 
 		 461 aa  323  3e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  43.12 
 
 		 462 aa  323  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  40.6 
 
 		 458 aa  322  8e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  39.52 
 
 		 481 aa  320  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  43.19 
 
 		 468 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  39.04 
 
 		 468 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  42.11 
 
 		 463 aa  319  7.999999999999999e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  40.87 
 
 		 471 aa  317  2e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  41.8 
 
 		 464 aa  315  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  39.91 
 
 		 468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  38.86 
 
 		 465 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  37.96 
 
 		 484 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  36.89 
 
 		 465 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  37.19 
 
 		 479 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  36.22 
 
 		 465 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  36.22 
 
 		 465 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  36.99 
 
 		 452 aa  288  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  35.78 
 
 		 467 aa  282  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  38.91 
 
 		 451 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  38.34 
 
 		 459 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  36.22 
 
 		 448 aa  265  8.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  35.94 
 
 		 448 aa  262  8e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  34.69 
 
 		 496 aa  251  1e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  34.04 
 
 		 512 aa  244  3e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  35.65 
 
 		 535 aa  242  9e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  33.79 
 
 		 437 aa  241  2e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  33.48 
 
 		 476 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78234  Glutamate carboxypeptidase-like protein  35.28 
 
 		 481 aa  233  7.000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  33.55 
 
 		 453 aa  232  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  34.43 
 
 		 448 aa  227  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  33.41 
 
 		 453 aa  225  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  33.97 
 
 		 450 aa  224  2e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  34.64 
 
 		 451 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1484  hypothetical protein  34.99 
 
 		 418 aa  223  6e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.555419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  33.33 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  33.49 
 
 		 470 aa  216  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  33.7 
 
 		 455 aa  216  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  33.56 
 
 		 484 aa  216  9e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  36.43 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  33.96 
 
 		 453 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>