More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3983 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  75.43 
 
 
471 aa  724    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  70.28 
 
 
462 aa  676    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  71.96 
 
 
463 aa  687    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  72.67 
 
 
462 aa  684    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  100 
 
 
462 aa  939    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  75.43 
 
 
471 aa  724    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  70.5 
 
 
462 aa  683    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  75.76 
 
 
469 aa  728    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  67.96 
 
 
471 aa  658    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  65.16 
 
 
468 aa  631  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  62.58 
 
 
461 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  61.82 
 
 
461 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  62.36 
 
 
461 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  61.44 
 
 
460 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  60.78 
 
 
460 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  61.14 
 
 
470 aa  573  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  62.58 
 
 
461 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  62.14 
 
 
457 aa  569  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  60.57 
 
 
465 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  59.57 
 
 
468 aa  565  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  59.78 
 
 
468 aa  565  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  59.65 
 
 
461 aa  566  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  61.66 
 
 
467 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  60.92 
 
 
470 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  60.7 
 
 
457 aa  551  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  60.95 
 
 
460 aa  554  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  58.73 
 
 
458 aa  549  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  60.22 
 
 
461 aa  551  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  59.48 
 
 
468 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  59.91 
 
 
468 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  59.65 
 
 
468 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  61.29 
 
 
468 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  57.69 
 
 
488 aa  533  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  60.09 
 
 
464 aa  531  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  55.92 
 
 
468 aa  508  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  52.48 
 
 
463 aa  489  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  52.07 
 
 
484 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  53.58 
 
 
468 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  46.05 
 
 
458 aa  375  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  47.94 
 
 
455 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  44.25 
 
 
459 aa  346  4e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  42.95 
 
 
440 aa  346  4e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  42.79 
 
 
453 aa  340  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  42.47 
 
 
460 aa  339  5.9999999999999996e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  43.58 
 
 
456 aa  336  5.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  41.59 
 
 
463 aa  335  7e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  41.34 
 
 
456 aa  335  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  41.24 
 
 
456 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  40.96 
 
 
456 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  42.34 
 
 
459 aa  324  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  40.7 
 
 
453 aa  322  8e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  42.56 
 
 
452 aa  321  9.999999999999999e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  39.96 
 
 
463 aa  320  3e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  40.27 
 
 
458 aa  319  5e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  42.28 
 
 
462 aa  318  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  39.47 
 
 
475 aa  318  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  39.91 
 
 
455 aa  312  5.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  42.06 
 
 
485 aa  311  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  41.14 
 
 
460 aa  310  4e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  44.42 
 
 
465 aa  309  5.9999999999999995e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  42.39 
 
 
464 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  41.19 
 
 
458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  40.3 
 
 
467 aa  303  5.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  39.78 
 
 
457 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  38.34 
 
 
465 aa  299  8e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  40.49 
 
 
451 aa  299  9e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  39.27 
 
 
474 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  39.73 
 
 
469 aa  289  6e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  40.72 
 
 
457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  39.35 
 
 
472 aa  283  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  39.3 
 
 
456 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  40.74 
 
 
479 aa  279  9e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  40.39 
 
 
481 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  36.82 
 
 
451 aa  243  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  32.03 
 
 
452 aa  240  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  37.07 
 
 
459 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  35.48 
 
 
453 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  33.84 
 
 
496 aa  219  7e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  33.84 
 
 
484 aa  211  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  32.17 
 
 
453 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  32.17 
 
 
453 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  32.17 
 
 
453 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  33.88 
 
 
448 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  35.25 
 
 
465 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  35.7 
 
 
406 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  33.26 
 
 
453 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  35.23 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  35.23 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  32.1 
 
 
448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  31.88 
 
 
448 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  33.49 
 
 
460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  31.47 
 
 
437 aa  194  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  31.18 
 
 
476 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  29.39 
 
 
476 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  33.26 
 
 
452 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  32.54 
 
 
467 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  29.24 
 
 
512 aa  184  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  30.33 
 
 
535 aa  184  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  32.88 
 
 
488 aa  183  7e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  31.94 
 
 
445 aa  182  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.501063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>